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缢蛏群体微卫星分析中样本量对遗传多样性指标的影响
引用本文:牛东红,陈慧,林国文,李家乐.缢蛏群体微卫星分析中样本量对遗传多样性指标的影响[J].海洋科学进展,2010,28(2).
作者姓名:牛东红  陈慧  林国文  李家乐
作者单位:1. 上海海洋大学,省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海,201306
2. 福建省闽东水产研究所,福建,宁德,352100
3. 上海海洋大学,省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室,上海,201306;上海市高校水产养殖学研究院,上海,201306
基金项目:国家高技术研究发展计划项目,福建省海洋与渔业局重点项目 
摘    要:采用微卫星标记进行缢蛏(Sinonovacula constricta)群体遗传研究时,群体的样本量多少对遗传多样性指标准确性有影响。实验设置了11个样本量梯度,并对观测等位基因数(Na),有效等位基因数(Ne),表观杂合度(Ho),期望杂合度(He)和Nei’s遗传多样性指数(H)的变化趋势进行了分析。结果表明,样本量与观测等位基因数和有效等位基因数具有高度的正相关性,与杂合度和内氏遗传多样性指数呈中度相关。当样本量小于20时,遗传多样性指标均呈现迅速增加的趋势;当样本量大于30,杂合度和内氏遗传多样性指数趋于稳定。建议在利用微卫星进行群体遗传结构评估时,最适参数为期望杂合度和内氏遗传多样性指数,最小样本量为30。

关 键 词:缢蛏  微卫星标记  样本量  遗传多样性指标

Effects of Sample Size on Genetic Diversity Index for Population of Sinonovacula Constricta in Use of Microsatellite DNA Marker
NIU Dong-hong,CHEN Hui,LIN Guo-wen,LI Jia-le.Effects of Sample Size on Genetic Diversity Index for Population of Sinonovacula Constricta in Use of Microsatellite DNA Marker[J].Advances in Marine Science,2010,28(2).
Authors:NIU Dong-hong  CHEN Hui  LIN Guo-wen  LI Jia-le
Abstract:
Keywords:
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