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1.
军曹鱼全人工繁殖群体遗传特征的SSR分析 总被引：2，自引：1，他引：1
利用8个微卫星DNA位点分析南海海域5个军曹鱼全人工繁育群体(HN1、HN2、ZJ、FJ和LS)子代的遗传多样性特征和群体间遗传分化。结果显示,军曹鱼养殖群体与天然群体的遗传结构特征基本一致:1)平均有效等位基因数为3.910±0.440,观测杂合度为0.595±0.049,分子方差分析(AMOVA)表明,个体内分化占主导(46%),军曹鱼养殖群体整体遗传多样性较高;2)群体间基因流明显(N_m=2.5959,F_(st)=0.0878),整体分化程度较低。各养殖群体表现出不同于天然大群体的特征:1)绝大部分位点均明显偏离哈温平衡,杂合子缺失或过剩现象普遍存在;2)聚类和群体分配分析等表明HN2与另四个养殖群体(HN1、ZJ、FJ和LS)分化明显。 相似文献
2.
为分析湛江流沙湾海域优势渔种卵鳎的遗传多样性,应用微卫星标记技术,选用15对微卫星引物,以等位基因数、基因杂合度、多态信息含量、固定指数等遗传参数为指标,评估卵鳎群体内的遗传多态性。结果表明:共检测到90个等位基因,等位基因数从1~12不等,平均为6.0;有效等位基因数从1.0~8.4,平均为4.0,多态性位点比例为53%,显示其具有中等杂合子水平,其中8个多态位点的期望杂合度(He)为0.670~0.881,平均为0.800,观测杂合度(Ho)为0.353~1.000,平均为0.773,多态信息含量(PIC)值为0.616~0.870,平均为0.773,群体内固定指数F为-0.199~0.564,平均为0.046;流沙湾卵鳎群体具有高度遗传多样性。 相似文献
3.
采用RAPD技术分析了湛江近海紫红笛鲷 (LutjanusargentimaculatusForsk l)的遗传多样性。从 12 0个随机引物中筛选出了 14个引物。 14个引物共检测到 173个位点 ,其中多态位点比例 (P)为 6 8.79%,遗传距离 (D)为 0 .2 2 2 8,遗传多样性指数 (H)为 0 .190 4。结果表明 ,目前湛江近海的紫红笛鲷自然群体的遗传多样性仍然维持在良好水平 ,捕捞尚未对其造成明显影响。 相似文献
4.
罗非鱼4个选育群体遗传结构SSR分析 总被引：2，自引：0，他引：2
采用SSR分子标记分析了吉富品系罗非鱼的两个家系(GF1和GF2)以及奥利亚罗非鱼(Fo)和奥本尼罗罗非鱼(Fn)群体的遗传结构。结果显示,扩增后等位基因数为3～8个,随引物不同而异,14对引物共扩增60个等位基因,扩增片断大小在102～267 bp之间。微卫星分析表明,奥本尼罗罗非鱼(Fn)的平均观测杂合度(0.764 3)和平均期望杂合度(0.519 6)均最高,吉富尼罗罗非鱼(GF1)平均多态信息含量(0.419 5)最高;吉富尼罗罗非鱼(GF2)平均观测杂合度(0.614 2),奥利亚罗非鱼(Fo)的平均期望观测度(0.446 6)、平均多态信息含量(0.359 2)最低;因此,吉富鱼(GF1)的遗传多样性最高,奥利亚的遗传多样性最低。Hardy-Weinberg平衡遗传偏离指数(D)奥利亚(Fo)和尼罗(Fn)(0.463 4和0.478 9)明显高于吉富的两家系(0.234 1和0.250 0)。Fo与GF2间遗传距离(0.477 0)最大;而GF1和GF2间的遗传距离(0.302 7)最小,遗传相似系数(0.607 3)最大,可推断新一代吉富罗非鱼与本地选育群体有相对较远的亲缘关系,更具杂种优势。 相似文献
5.
采用RAPD技术分析了湛江沿海野生蜂巢石斑鱼的遗传多样性 ,从 6个系列 1 2 0个引物筛选出1 6个引物 ,对 1 0尾蜂巢石斑鱼进行RAPD分析 ,1 6个引物共检测到 1 5 4个位点 ,其中 ,多态位点比例 (P)为 6 5 5 8% ,平均个体间遗传相似系数 (S)为 0 7887,平均个体间遗传距离 (D)为 0 2 1 1 3,遗传多样性指数 (H)为 0 1 776。研究结果表明 ,湛江沿海的野生蜂巢石斑鱼的遗传多样性较高。 相似文献
6.
大口黑鲈选育群体遗传结构的微卫星分析 总被引：1，自引：0，他引：1
采用微卫星标记技术分析不同世代大口黑鲈选育群体的遗传结构。利用11对微卫星引物对大口黑鲈第2～4代选育群体及南水群体(对照)共120个个体进行PCR扩增,共得到28个等位基因。每个位点获得2～3个等位基因,平均等位基因为2.54。第2代(F_2)、第3代(F_3)、第4代(F_4)及南水群体(CG)的平均多态信息含量(PIC)值分别为:0.423、0.419、0.386、0.366。与F_2相比,F_4的遗传多样性减少8.76%,但与CG相比,F_4仍具有较高的遗传多样性,表明大口黑鲈选育群体的遗传基础逐步趋向纯化,且仍有较大选育潜力。此外,尽管F_2与F_4的遗传距离(0.022)比F_2与F_3的(0.011)大,但世代间的F_(st)值(0.006～0.009)均小于0.05,且世代群体总遗传分化指数为0.013,表明选育群体已出现遗传分化,但分化程度较低。 相似文献
7.
应用AFLP方法,从64对引物中筛选出5对用于分析胡子鲇(Claris fuscus)厦门(XM)、江门(JM)、玉林(YL)等3个养殖群体共90个个体群体内、群体间遗传多样性。扩增共得到289条清晰谱带,引物多态性介于47.8%～63.8%,平均多态性比率为56.4%。胡子鲇群体总遗传杂合度(Ht)、遗传分化系数(Hs)、遗传分化度(Gst)和基因流(Nm)分别为0.161 1、0.153 6、0.051 1和8.501 8,表明胡子鲇多态性处于中等偏下水平,群体内部遗传分化系数较高,三个群体间无较大分化,群体间基因流动较好。其中,JM群体多态性比率、有效等位基因数Ne、Nei’s指数和Shannon指数都较XM群体和YL群体高,种内分化程度较好。对群体进行两两比较发现,XM群体和YL群体间分化程度最大,XM群体和JM群体次之,JM群体和YL群体最小。基于杂交优势,推断XM和YL群体繁殖所产生的后代将具有比亲代更为优良的性状。 相似文献
8.
近江牡蛎两个野生种群的遗传多样性分析 总被引：1，自引：0，他引：1
采用RAPD分子标记和rDNA-ITS1序列分析了近江牡蛎Crassostrea rivularis湛江官渡和阳江程村野生种群的遗传多样性。12个RAPD引物共扩增出8838条片段,157个位点,平均每个引物可产生13个位点,片段长度在200～2200bp之间。湛江种群和阳江种群的多态位点比例分别为89.62%和89.57%,遗传多样性指数分别为0.4170和0.4334。种群间平均遗传距离为0.0327,平均遗传相似性为0.9681,平均遗传分化系数为0.0437。得到近江牡蛎18S、5.8S部分序列和ITS1全部序列,其中ITS1序列片段长度为478～485bp,共有11个变异位点,两个为转换(A/G),其他为插入/缺失(A/-、T/-)。湛江和阳江种群各获得8个单倍型,其中有一个单倍型为两个种群共享。两个种群的CG碱基平均含量较高,分别为58.29%和58.41%。种群间的遗传分化系数0.0254。结果说明,近江牡蛎湛江种群和阳江种群间具有较高的遗传多样性和较低的遗传分化。 相似文献
9.
紫红笛鲷随机扩增多态性DNA及遗传多样性分析 总被引：1，自引：0，他引：1
采用RAPD技术分析了湛江近海紫红笛鲷(Lutjanus argentimaculatus Forskal)的遗传多样性。从120个随机引物中筛选出了14个引物。14个引物共检测到173个位点，其中多态位点比例(P)为68．79％，遗传距离(D)为0．2228，遗传多样性指数(日)为0．1904。结果表明，目前湛江近海的紫红笛鲷自然群体的遗传多样性仍然维持在良好水平，捕捞尚未对其造成明显影响。 相似文献
10.
利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术分别分析了五岛西部日本鲐、东海西部日本鲐和澳洲鲐三群体的样本,共产生226个分子标记,其中143个为多态性标记,多态百分率达到63.3%,每条引物产生的平均标记数为7.29。五岛西部日本鲐、东海西部日本鲐和澳洲鲐群体内遗传相似度分别为0.949、0.877和0.936,而群体间遗传距离依次为:五岛西部日本鲐-东海西部日本鲐(0.2357)<东海西部日本鲐-澳洲鲐(0.3030)<五岛西部日本鲐-澳洲鲐(0.3528),五岛西部日本鲐与东海西部日本鲐个体在UPGMA系统树独立聚类为两个类群,初步支持东、黄海的日本鲐存在东海西部和五岛西部的两个种群的观点。Shannon多样性指数表明,其遗传多样性大小依次为东海西部日本鲐、澳洲鲐、五岛西部日本鲐。 相似文献
11.
The genetic variation and differentiation of the razor clam Sinonovacula constricts distributed along the coast of China were studied through amplified fragment length polymorphism(AFLP)analysis. Six primer combinations generated 193 fragments. The He values varied from 0. 322 to 0. 463 and the percentage of polymorphic loci ranged from 74. 1% to 98. 4%, which indicates a high level of genetic diversity. Cluster analysis by Nei's pairwise distance grouped all specimens by geographical origins. AMOVA consistently showed that genetic variation among populations was 8. 71%, and most of the variation came from the genetic variation within populations(91.29%). Genetic differentiation among the six populations was moderate; pairwise FST ranged from 0. 0282 to0. 1480, which indicated that S. Constricts populations along the coast of China are genetically connected. Among all the six populations, the Beihai population is the mostly differentiated from the others, suggesting that Hainan Island and Leizhou Peninsula act as barriers to gene flow. All populations abide isolation by distance model as indicated by Mantel test, except for ZS(Zhoushan)and YQ(Yueqing)populations. Information obtained in this study will provide guidelines for conservation and fishery management of this species in the future. 相似文献
12.
The AFLP(amplified fragment length polymorphism) technique was used to analyze and compare the genetic diversity of Tachypleus tridentatus from three south-eastern coastal sites of China(Pingtan,Hong Kong and Beihai).Eight pairs of primers generated 361 loci,including 285 polymorphic loci.The ratio of polymorphic loci was 96.97%.Nei's genetic diversity index was 0.420 8 and the Shannon information index was 0.607 5,both of which were higher than that reported for many other arthropods.These results show tha... 相似文献
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长江下游鳊鱼遗传多样性的RAPD分析 总被引：2，自引：0，他引：2
应用RAPD技术对长江下游鳊鱼群体的遗传多样性进行分析,从40个随机引物中筛选出28个引物对鳊鱼24个个体的基因组DNA进行扩增,共检测到178个位点,分子片段在0.2～2.0kb之间,其中多态位点83个,占46.63%;个体间最大的遗传距离为0.1326,最小的遗传距离为0.0476,平均遗传距离为0.0885;群体的Nei基因多样性指数为0.2593,Shannon多样性指值为0.0986。与其他鱼类的遗传多样性研究结果相比,长江下游鳊鱼群体的遗传多样性处于中等水平。 相似文献
15.
1INTRODUCTION Since the first use in human genetic research in1966,allozyme has become the most popular genetic marker for population genetics studies for almost all groups of animals and plants(Lewontin and Hubby,1966;Murphy et al.,1996).In the past seve… 相似文献
16.
Inter-simple sequence repeat (ISSR) markers were used to determine the genetic variation and genetic differentiation of cultured and wild populations of Trachidermus fasciatus, an endangered catadromous fish species in China. Six selected primers were used to amplify DNA samples from 85 individuals, and 353 loci were detected. Relatively low genetic diversity was detected in the cultured population (the percentage of polymorphic loci PPL = 73.80%, Nei’s gene diversity h = 0.178 2, Shannon information index ... 相似文献