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应用PRIMER软件进行浮游植物群落结构的多元统计分析 总被引：2，自引：0，他引：2
根据青岛近海进行的一次添加营养盐的围隔实验数据,采用专业软件PRIMER中的多元统计分析方法,进行了浮游植物群落结构的变化研究。结果表明,虽然由于本实验中浮游植物的生长受到Si的限制,硅藻类群不占明显的优势,使得优势种随时间的变化不明显,没有出现明显的群落演替,但用PRIMER软件的聚类分析(Clustering)和多维尺度转换排序(MDS)分析表明,添加营养盐后浮游植物群落结构有较明显的变化,同时,PRIMER软件的相异系数(ANOSIM)分析也表明,在同时添加N、P的围隔内,浮游植物群落结构变化较只添加P的围隔中的变化显著。这显示了PRIMER软件在分析浮游植物群落结构变化和评价水域富营养化中的应用前景。 相似文献
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《中国海洋大学学报(自然科学版)》2016,(8)
本文根据2014年秋季青岛斋堂岛海域双桩竖杆张网的网囊网目选择性试验数据,运用PRIMER软件中的相似性分析、非参数多维标度分析和相似性百分比分析模块分析了张网渔具种类选择性。试验采用平行作业法,以传统网具(2a=16mm的菱形目网囊)作为对照网,设计了网目尺寸(2a)为30和35mm的菱形目网囊(以30D和35D表示)和网目尺寸(2a)为20、30和35mm的方形目网囊(以20S、30S和35S表示),进行选择性实验。研究显示:(1)35D、30S和35S渔获组成与对照网存在显著性差异,其余各网之间差异不显著。(2)改良后的试验网具能有效释放舒氏海龙;除20S组外,其余各试验网对方氏云鳚亦有较好的释放效果。(3)方形目网囊较相同尺寸的菱形目网囊具有更好的种类选择性;对相同网目形状的试验网囊进行比较,种类选择性随网目尺寸的增大而增大。(4)综合分析不同网具的渔获物组成和规格,在斋堂岛海域秋季小黄鱼、带鱼渔汛期,推荐使用30mm方形目网囊;方氏云鳚渔汛期,推荐使用20mm方形目网囊进行捕捞作业。研究结果表明,运用多元统计软件PRIMER进行张网渔具种类选择性分析虽然存在待完善之处,但该方法为本领域研究提供了有益参考。 相似文献
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本文根据2015年8月(夏季)和2016年1月(冬季)南黄海海域的调查资料,研究了该海域夏冬两季浮游动物的时空分布。结果如下,两季样品共鉴定出103种浮游动物,夏季种类数(96种)冬季(45种)。夏季优势种数为3种,冬季为6种。夏季和冬季浮游动物丰度均值分别为17 835.8和1 856.3ind/m~3,生物量均值分别为2 334.2和910.4mg/m~3。PRIMER5.2软件相似性分析表明:夏季,相似性在51.89%~56.07%时,可以将各站位划分为5个群落;冬季,相似性在59.91%~65.82%时,可划分为3个群落。相似性聚类分析时,按属或按科进行统计与按种进行统计相比产生的数据损失分别约为6%和10%。浮游动物总种数减少时,按更高阶元进行聚类所产生的数据损失也会减少。 相似文献
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南黄海夏季软体动物群落结构特征 总被引：2，自引：2，他引：0
通过对2011—2013年夏季南黄海大型底栖软体动物的群落结构进行分析,揭示其与黄海冷水团之间的关系。使用Shannon-Wiener指数(H')、Pielou指数(J')、Margalef指数(D)和ABC(Abundance Biomass Comparison)曲线法分析群落多样性和稳定性。使用PRIMER6.0对大型底栖软体动物群落进行Cluster和MDS相似性分析。通过单因素方差分析(ANOVA)检验各指数之间的差异性。结果表明,三个航次共获得大型底栖软体动物36种,日本梯形蛤(Portlandia japonica)与薄索足蛤(Thyasira tokunagai)在三年中均为优势种。大型底栖软体动物平均丰度分别为27.250±22.15、31.765±27.948和30.476±30.818 ind./m2;平均生物量分别为8.164±9.145、6.942±7.139和5.071±10.015 g/m2。研究结果显示3年来黄海冷水团内大型底栖软体动物的多样性高于冷水团外大型底栖软体动物多样性,丰度分布由北到南逐渐增加且冷水团内的丰度大于冷水团外的丰度。南黄海海域大型底栖软体生物群落结构稳定,与2006年相比没有较大的变化。 相似文献
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青岛近海秋季大型底栖动物群落特征 总被引：2，自引：0，他引：2
利用2007年10月在青岛近海进行的大型底栖动物定量采集样品,采用大型多元统计分析软件PRIMER,研究了该海域大型底栖动物群落的物种组成、生物量和丰度分布、群落等级聚类分析(CLUSTER)以及群落受污染扰动情况。本次调查共获得青岛近海大型底栖动物160种,其中多毛类93种,甲壳动物37种,软体动物16种,棘皮动物7种,其它类群动物7种。群落中优势种的优势度均不明显,以多毛类巴氏钩毛虫(Sigambra bassi)和长须沙蚕(Nereis longior)贡献率最高。生物量和丰度空间分布没有明显的规律性,呈斑块状分布。群落结构聚类分析表明,15个取样站的群落结构相似性程度都非常低,为10%~30%,仅有S2和S4站、S11和S12站Bray-Curtis相似性系数达到30%。ABC曲线表明,该研究海域处于1个轻度人为扰动的状态。 相似文献
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以2007年春季在渤海湾近岸海域进行的调查为基础,分析了海洋自由生活线虫的群落组成和环境之间的关系.以等级聚类(Cluster)、非度量多维标度(MDS)和生物-环境分析(BIO-ENV)等多元统计方法为主,采用 PRIMER 5.2软件进行数据处理和分析.在测定的约30个环境因素中,有10个因素对底栖线虫群落产生了重要影响,包括水体的 pH、硝酸盐、悬浮物、活性硅酸盐、温度、盐度、溶解氧和沉积物的脱镁色素、叶绿素 a、平均粒径等因素.一些沉积物因素和水环境因素组合后较好地解释了底栖线虫群落结构情况,这反映了水环境和沉积环境的关联性,今后的底栖生物研究中应注意水体和沉积物环境的耦合. 相似文献
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为研究福建省九龙江口海门岛大型底栖动物的群落结构变化,于2014年11月至2015年8月对海门岛红树林区的大型底栖动物进行4个季度的调查研究,并利用PRIMER软件进行群落物种多样性单变量分析、群落聚类分析(Cluster)、多维尺度排序(MDS)分析和丰度/生物量曲线(ABC)分析.结果表明:九龙江口海门岛红树林区获得大型底栖动物共计112种,年平均生物量为77. 58 g/m2,年平均栖息密度为991. 0 ind/m2. Shannon-Wiener多样性指数(H')、丰富度指数(d)和均匀度指数(J')分别为2. 42、5. 02和0. 70,其中春季生物多样性指数和均匀度指数均最低,与春季生物的繁殖有关.ABC曲线表明该区域有三分之一采样点的大型底栖动物群落受到中等到严重程度的扰动,主要集中在春季站位,这与该季节渔民滩涂养殖作业活动有关. Cluster聚类分析和MDS标序结果表明,在50%的相似性水平群落可分为6组,且不同组间显示季节差异显著.结合历史资料发现,大型底栖动物群落随环境质量的变化已出现了一定的群落演替,物种呈小型化趋势.环境因子与群落分布特征相关性较大,其中最能解释群落丰度和生物量空间分布特征的环境因子为水温、盐度和有机质含量. 相似文献
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2006年7月—2008年8月,对象山港全港海域设立的13个采样站位采集的调查资料,用物种丰富度指数、物种均匀度指数和物种多样性指数分析象山港大型底栖动物物种的多样性和群落种类的组成,以及采用ABC曲线方法和大型多元统计分析软件PRIMER5对象山港大型底栖动物进行Bray-Curtis相似性聚类分析和非度量MDS标序,研究象山港大型底栖动物群落结构。调查显示象山港大型底栖动物不同采样站位之间物种丰富度指数(d)、均匀度指数(J)、辛普森多样性指数(D)和香农-威纳多样性指数(H’)差异皆高度显著(P0.01)。群落结构聚类分析和MDS标序表明,13个采样站位的大型底栖动物群落大致可分为3组。根据所调查象山港大型底栖动物的丰度和生物量资料做的ABC曲线分析表明,该海域大型底栖动物群落受到了严重的环境污染或者扰动,逐渐由一种或几种个体较小的种类占优势。 相似文献
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阿什河流域底栖硅藻群落特征及水环境健康评价 总被引：1，自引：0，他引：1
为探索黑龙江省阿什河流域底栖硅藻群落特征及环境相关性,并对阿什河流域进行水环境健康评价,本研究于2018年7月(丰水期)和2018年10月(枯水期)对阿什河流域8个典型采样点进行调查。基于相似性分析检验(analysisofsimilarities,ANOSIM)和相似百分比分析(similarity percentages,SIMPER)分析探索枯水期与丰水期之间底栖硅藻的群落差异,通过冗余分析(redundancyanalysis,RDA)对驱动底栖硅藻的关键环境因子进行筛选;使用硅藻生物指数(biological diatom index, IBD)、硅藻属指数(generic index of diatom, GI)和水体营养指数(trophic state index, TSI)对研究区域水体营养状态进行初步评价。结果表明,研究期间共鉴定底栖硅藻89种,其中丰水期80种、枯水期57种。独立样本T检验(T-test)表明阿什河流域物种丰富度丰水期显著高于枯水期(P0.05),Shannon-wiener指数变化不显著(P0.05)。ANOSIM结合SIMPER分析结果显示阿什河流域硅藻群落格局存在一定的时空异质性。RDA分析表明水的电导率是驱动阿什河流域底栖硅藻空间分布的环境因子,枯水期与丰水期之间高锰酸盐指数(COD_(Mn))含量的变化是影响硅藻群落演替的因素之一。IBD、GI和TSI指数结果显示阿什河流域受人为活动干扰区域营养状态较差, IBD指数较GI指数能更有效的反映阿什河流域水体营养状况。 相似文献
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Francisco M. Wallenstein Marlene R. Terra Joana Pombo & Ana I. Neto 《Marine Ecology》2009,30(S1):113-117
Studies on macroalgal communities of the Azores report algal turfs as one of the most conspicuous ecological entities occurring on the rocky shores of these islands. The present study investigates the influence of shore height and substratum on turf composition. Data were analysed using the software PRIMER and results confirmed the previous distinction between calcareous, dominated by articulated coralline algae, and non-calcareous turfs, characterized mainly by small red algae. However, no differences in species composition were found in either type of turf occurring on different substrata or at different shore levels. 相似文献
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LI Baoquan LI Xinzheng WANG Hongf WANG Jinbao HAN Qingxi DONG Chao MA Lin ZHANG Baolin 《海洋学报(英文版)》2010,29(6):73-82
Macrobenthic infauna and associated environmental factors influencing the benthic community in the eastern coastal region of Shandong Peninsula were analyzed in four seasonal surveys from January 2007 to October 2007 (30 stations in winter, 20 stations in other three seasons), in order to understand the community structure and the factors unfluencing the benthic distribution. PRIMER 6.0 and SPSS 15.0 software packages were adopted to analyze the environmental and macrobenthic data. The results show that there were 260 macrobenthic species in total collected from the research region. The composition of species is:Polychaeta (94 species), Crustacea (75), Mollusca (56) and Echinoderm (12), among which, only 23 species were common species in the cruises of every season. The dominant species varied from season to season; however, the polychaete species Paralacydonia paradoxa Fauvel and Echinoderm species Amphioplus japonicus (Matsumoto) were always present year-round. The abundance and biomass of the macrobenthos in the research region were variable from season to season. The results of CLUSTER and MDS analysis show that the similarities of macrobenthic structures between the stations were low; most of the similarities were at about 30% of similarity value, only two stations were up to 70%. In accordance with the similarity values of the macrobenthic structures, we divided the 20 stations into five groups by arbitrary similarity level of 30%. The ABC curve indicates that the marcofauna communities in the research region had not been disturbed massively, except two stations, SB1 and SB3. Ecologically, benthos were controlled by a combination of factors such as salinity, phytoplankton, zooplankton, SiO3-Si and temperature, and no single factor could be considered as an ecological master factor. 相似文献
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Community structure of macrobenthos in coastal water off Rushan, southern Shandong Peninsula, and the relationships with environmental factors 总被引：6，自引：1，他引：5
LIXinzheng LIBaoquan WANGHongf WANGJinbao WANGXiaochen ZHOUJin HANQingxi MALin DONGChao ZHANGBaolin 《海洋学报(英文版)》2009,28(5):81-93
To understand the present actuality of the marine ecosystem in the southern coastal water region of the Shandong Peninsula and the impact of the global change and the human activities to the marine ecosystem of the region,the macrobenthic community structure was researched based on data from 26 sampling stations carried out on four seasonal cruises from December 2006 to November 2007.The data was analyzed using PRIMER 6.0 and SPSS 15.0 software packages.The results showed that 236 macrobenthic species in total were collected from the research region by the field works.Most of the species belong to Polychaeta (76 species),Mollusca (75) and Crustacea (60).Of which,33 species were common species by the four cruises.The dominant species were different among the four seasons,however,the polychaete species Nephtys oligobranchia and Sternaspis scutata were always dominant in the four seasons.The abundances and biomasses of the macrobenthos from the research region were variable in the four seasons.The results of CLUSTER and MDS analysis showed that the similarities of macrobenthic structures among the stations were low,most of the similarities were at about 40% of similarity values,only that of two stations were up to 60%.In accordance with the similarity values of the macrobenthic structures,the 26 stations were clustered as six groups at arbitrary similarity level of 30%.The ABC curve indicated that the marcofauna communities in the research region had not been disturbed distinctly.The results of BIOENV and BVSTEP (Spearman) analysis implied that the concentrations of organic matter in bottom water and heavy metal copper in sediment,water depth and temperature of bottom were the most significant environmental factors to affect the macrobentic community. 相似文献
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山东荣成临洛北湾夏季大型底栖动物群落生态学初步研究 总被引：1，自引：0，他引：1
利用2010年7月在山东荣成临洛北湾所获得大型底栖动物定量分析资料,研究了夏季该海域海带养殖区和邻近水域大型底栖动物在物种组成、生物量、丰度、优势种以及物种多样性等方面的特征和空间差异,并采用MDS和CLUSTER分析了大型底栖动物的群落结构,以期为该地区以后的科学研究提供基础数据.结果表明,本次调查通过采泥和拖网共采集到大型底栖动物88种,其中采泥得到大型底栖动物51种,拖网采得大型底栖动物45种,各站位的物种多样性差异明显,物种数量从2种到21种.与环境因子的相关性分析显示,各站的物种数和丰度与DO存在明显的负相关.在所有大型底栖动物中,甲壳动物26种,多毛类环节动物24种,软体动物23种,棘皮动物8种,其他类群动物6种(鱼类5种,尾索动物1种).该海域的优势种为多丝独毛虫和短叶索沙蚕.将CLUSTER结果以43%的群落结构相似性来划分,组内的相似性为50%~60%.该海域大型底栖动物的平均丰度为854个/m2,平均生物量为134.73 g/m2,与研究海域附近的历史研究结果相比较,该海域的平均丰度和生物量仍处于较高的水平. 相似文献
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锦鲤疱疹病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立及应用 总被引：2，自引：0，他引：2
研究建立并完善了Taqman实时荧光定量PCR检测锦鲤疱疹病毒（KHV）的方法。首先通过选取KHV病毒TK基因的保守序列（GenBank AB182940）,利用PRIMER EXPRESS 2.0设计引物和探针。其中Taqman探针的5’端标记FAM,3’端标记TAMRA。然后利用梯度稀释的阳性样品克隆质粒进行定量PCR反应,制作标准曲线,得到病毒拷贝数与Ct值的关系为：Ct=-3.45 lgX＋42.73（相关系数R2=0.989）。通过试验检测得到实时荧光定量PCR对KHV的灵敏度为32个病毒核酸拷贝数,同时,设计的引物和探针对于鱼类细胞系和其它鱼类病毒没有扩增反应,表现出较好的特异性。实验结果表明,实时荧光定量PCR检测KHV的方法,具有特异性好、灵敏度高的特点,可以缩短检测时间,提高检测速度,非常适合口岸进出口检验检疫的要求。 相似文献
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N. Simboura A. Zenetos M. Thessalou-Legaki M.-A. Pancucci A. Nicolaidou 《Marine Ecology》1995,16(4):283-306
Abstract. The infralittoral benthos was studied on three islands of the Northern Sporades in the Aegean Sea. Thirteen stations were sampled on both hard and soft substrata and 408 taxa were identified, some of zoogeographical interest. Multivariate statistical methods such as classification, ordination and Similarilies Terms Analysis were combined with existing ecological information to delineate the various communities present and to point to the indicator species characterising them. The communities were then defined using the indicator species and their affinities to typical biocoenoses. The main factor responsible for the observed distribution proved to be the type of substratum (algal cover or sediment type), which reflects the light and hydrodynamic conditions. The observed bathynietric zonation was similar lo that of the Balearic Islands in the western Mediterranean. 相似文献