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用双特异探针技术定性定量分析微型原甲藻 总被引：5，自引：0，他引：5
针对微型原甲藻核糖体大亚基和小亚基RNA分别设计了大亚基探针(LSU probe)和小亚基探针(SSU probe),发展了对微型原甲藻进行定性和定量分析的双特异探针技术.分析数据表明针对微型原甲藻核糖体大亚基RNA的LSU probe能够特异地将微型原甲藻和其他7种微藻分开,而且检测信号的强弱在一定的范围内与细胞数呈线性关系;由于针对微型原甲藻核糖体小亚基的SSU probe探针由于与具齿原甲藻存在核酸序列一致性,该探针与具齿原甲藻有严重的交叉反应,但未发现与海洋原甲藻和其他藻的交叉反应.另外,研究还优化了破碎微型原甲藻细胞所需的超声时间以及获得探针的特异性所需的S1酶反应温度.本研究为实现对微型原甲藻海水样品的快速准确监测奠定了基础. 相似文献
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本文概述了微藻脂肪酸生物合成的研究进展,主要包括微藻脂肪酸生物合成途径的解析、影响脂肪酸积累的因素以及微藻脂肪酸生物合成基因工程的研究进展等3个方面的内容。具体阐述了化学因素和物理因素对脂肪酸积累的影响,总结了当前通过基因工程手段提高微藻脂肪酸含量的发展思路,同时结合自身的研究成果对微藻脂肪酸生物合成的研究进行了展望。 相似文献
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东海原甲藻线粒体细胞色素b(Cytb)基因的定量检测 总被引：3，自引：0，他引：3
建立了检测东海原甲藻线粒体细胞色素b(Cytb)基因mRNA含量的实时荧光定量PCR方法.以甲藻Cytb基因的简并引物扩增得到984 bp长的东海原甲藻Cytb基因片段,经克隆、测序,制备并纯化质粒.以光度法测定质粒浓度并作为标准品.对上述基因片段,利用PRIMER EXPRESS 3.0 设计引物,以梯度稀释的质粒标准品进行定量PCR反应,以SYBR Green I为荧光染料,制作标准曲线,得到基因拷贝数X与Ct值的关系为:Ct=-3.50 lg X+39.35(相关系数r为0.999).通过对不同生长时期的东海原甲藻样品的Cytb基因mRNA含量检测,发现该基因的表达量较稳定,平均值为(45.4±4.7)拷贝/细胞,受生长状态影响不大,可作为实时荧光定量PCR的内参基因. 相似文献
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黄河下游营养盐浓度季节变化及其入海通量研究 总被引：7，自引：0，他引：7
2001年3月～2002年2月期间在黄河下游采集溶解及颗粒态营养盐样品,分析了黄河径流中各形态的营养盐的浓度及其月动态,估算此时段内黄河的营养盐入海通量。研究发现,溶解无机氮是溶解总氮的主要存在形式,硝酸盐是黄河中氮的最主要存在形态,其季节变化与水量变化趋势相反,年平均含量为(260.6±84.0)μmol/L,显著高于世界其它河流,为世界背景值(7.14μmol/L)的20多倍;黄河中磷主要以颗粒态存在,颗粒态磷含量变化规律与SPM的分布一致,其年平均含量为(16.2±22.9)μmol/L,磷酸盐含量较低,年平均含量为(0.42±0.20)μmol/L,与世界河流的平均水平相当。硅酸盐年平均含量为(122.0±18.2)μmol/L。每年约有17 200 t的总氮和1 600 t的总磷输入渤海,氮通量表现出在春季3月较高;磷通量在9月出现最高值,春季3,4月也较高;硅酸盐通量在3月出现最高值。 相似文献
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中国东部边缘海冬季硅酸盐的分布特征及主要来源 总被引：1，自引：0，他引：1
利用2007年1～2月的调查资料,分析讨论了中国东部陆架边缘海(南黄海、东海)冬季硅酸盐的分布特征及其主要影响因素。结果表明:近岸海域硅酸盐的高值区位于受长江冲淡水影响的区域;东海的硅酸盐浓度高于南黄海。长江冲淡水和黑潮水是影响东海和南黄海硅酸盐分布的主要因素。黑潮中层水是东海陆架区硅酸盐的主要来源。 相似文献
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硝化作用是海洋氮循环的核心过程。作为硝化过程关键步骤的氨氧化过程的主要参与者,氨氧化古菌和氨氧化细菌对硝化作用的相对贡献是海洋氮循环关注的热点问题之一。本文选取渤海和南黄海20个站位的表层沉积物,通过微宇宙培养实验研究了沉积物中氨氧化古菌和氨氧化细菌对硝化潜势的相对贡献。结果表明,渤海和南黄海海域表层沉积物中潜在硝化速率(以氮计,下同)为0.004 6～0.283 1μmol/(g·d),其中氨氧化古菌潜在硝化速率为0.004 3～0.274 3μmol/(g·d),氨氧化细菌潜在硝化速率为0.000 4～0.056 0μmol/(g·d)。氨氧化古菌是硝化潜势的主要贡献者,在渤海海域的贡献率为59.79%～97.95%,在南黄海海域的贡献率为18.47%～94.26%。渤海海域潜在硝化速率显著高于南黄海海域。此外,本研究海域中盐度是影响潜在硝化速率的关键环境因子,对渤海海域的分析则表明越高的NO3-浓度可能指示着越高的硝化潜势。在河口及近海沉积物中,氨氧化古菌在硝化过程中起着更加重要的作用;河口和近岸沉积物硝化潜势总体高于远海。本研究为进一... 相似文献
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为分析大气细菌群落结构区域差异性,本研究采集了2014—2015年黄海、青岛和兰州大气生物气溶胶样品,对其进行了16S rRNA基因高通量测序分析,探讨环境因子(温度、风速和相对湿度)对大气细菌群落结构可能的影响.结果表明,3月黄海、青岛和兰州以及青岛不同采样时间的生物气溶胶中细菌群落结构在区域(p<0.01)和时间(... 相似文献
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环境因子对海蜇生长发育影响的研究进展 总被引：1，自引：0，他引：1
<正>海蜇(Rhopilema esculenta Kishinouye)隶属于刺胞动物门(Cnidaria),钵水母纲(Scyphozoa),根口水母目(Rhizostomeae),根口水母科(Hizostomadae),海蜇属(Rhopilema)[1]。海蜇为进化比较保守的两胚层动物[2]。丁耕芜等[3]首次报告了海蜇的整个生活史。海蜇生活史具有刺胞动物门典型的世代交替特征,分为两个世代:水螅体世代和水母体世代。在水螅体世代整个过程中,海蜇螅状体于海底基质上营固着生活,以无性生殖 相似文献
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Relationships between phytoplankton community composition and environmental variables in the East China Sea (ECS) and Yellow Sea (YS) were investigated using geochemical and molecular microbiology methods. The diversity of phytoplankton was characterized using cultivation-independent PCR-based denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). Groups resulting from unweighted pair-group method with arithmetic averages clustering of the DGGE profiles showed good consistency with the eco-environmental characteristics of the sea area they belonged to. Additionally, the clustering results based on DGGE fingerprinting and those based on morphological compositions were practically identical. The relationship of phytoplankton diversity to environmental factors was statistically analyzed. Temperature, dissolved inorganic nitrogen (DIN), and silicate-Si were found significantly related to the phytoplankton community composition. Canonical correspondence analysis (CCA) was performed to reveal the relationship between community composition and these three environmental factors. Generally, values of the ECS are clearly separated from those of the YS in the CCA biplot, due to mainly the effect of temperature and DIN. 相似文献
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The complicated life cycle of A urelia spp., comprising benthic asexually-reproducing polyps and sexually-reproducing medusae, makes it hard for researchers to identify and track them, especially for early stage individuals, such as planulae. To solve this problem, we developed a real-time PCR assay(SYBR Green I) to identify planulae in both cultured and natural seawater samples. Species-specific primers targeting Aurelia sp.1 mitochondrial 16 SrDNA(mt 16 SrDNA) regions were designed. Using a calibration curve constructed with plasmids containing the A urelia sp.1 mt 16 SrDNA fragment and a standard curve for planulae, the absolute number of mt 16 SrDNA copies per planula was determined and from that the total number of planulae per sample was estimated. For the field samples, a 100-fold dilution of the sample DNA combined with a final concentration of 0.2 μg/μL BSA in the PCR reaction mixture was used to remove realtime PCR inhibitors. Samples collected in Jiaozhou Bay from July to September 2012 were subsequently analyzed using this assay. Peak A urelia sp.1 planula abundance occurred in July 2012 at stations near Hongdao Island and Qingdao offshore; abundances were very low in August and September. The real-time PCR assay(SYBR Green I) developed here negates the need for traditional microscopic identification, which is laborious and time-consuming, and can detect and quantify jellyfish planulae in field plankton samples rapidly and specifically. 相似文献