Phylogenetic analysis of Pectinidae(Bivalvia) based on the ribosomal DNA internal transcribed spacer region     

HUANG Xiaoting  BI Ke  HU Jingjie  HU Xiaoli  BAO Zhenmin 《海洋学报(英文版)》2007,26(6):83-90

The ribosomal DNA internal transcribed spacer (ITS) region is a useful genomic region for understanding evolutionary and genetic relationships. In the current study, the molecular phylogenetic analysis of Pectinidae (Mollusca: Bivalvia) was performed using the nucleotide sequences of the nuclear ITS region in nine species of this family. The sequences were obtained from the scallop species Argopecten irradians, Mizuhopecten yessoensis, Amusium pleuronectes and Mimachlamys nobilis, and compared with the published sequences of Aequipecten opercularis, Chlamys farreri, C. distorta, M. varia, Pecten maximus, and an outgroup species Perna viridis. The molecular phylogenetic tree was constructed by the neighbor-joining and maximum parsimony methods. Phylogenetic analysis based on ITS1, ITS2, or their combination always yielded trees of similar topology. The results support the morphological classifications of bivalve and are nearly consistent with classification of two subfamilies (Chlamydinae and Pectininae) formulated by Waller. However, A. irradians, together with A. opercularis made up of genera Amusium, evidences that they may belong to the subfamily Pectinidae. The data are incompatible with the conclusion of Waller who placed them in Chlamydinae by morphological characteristics. These results provide new insights into the evolutionary relationships among scallop species and contribute to the improvement of existing classification systems.  相似文献   

泥鳅(Misgurnus anguillicaudatus)病原霍乱弧菌(Vibrio cholerae)的表型与分子鉴定   总被引：3，自引：0，他引：3  

邴旭文  阎斌伦  张晓君  秦蕾  毕可然 《海洋与湖沼》2009,40(6):692-698

从江苏连云港某养殖场养殖死亡的泥鳅肝脏、血液及腹水中分离出大量优势生长的细菌,人工感染试验证明其对泥鳅具有很强的致病性。采用表观分类学及分子生物学方法,对分离菌进行了形态特征、理化特性、胞外酶活性及溶血活性等生物学性状检验;用PCR方法同时扩增其16SrRNA和gyrB基因,分析了16SrRNA和gyrB两种基因序列的同源性,并构建了系统发生树,通过基因序列分析,比较了两种基因在相似细菌的检测和鉴定能力;基于16SrRNA和gyrB基因的系统发育学分析表明分离菌(LD081008B-1)所扩增的16SrRNA和gyrB基因序列均与GenBank数据库中霍乱弧菌具有较高的相似性,且gyrB基因用于细菌种间鉴定更具优越性;16SrRNA基因序列长度为1446bp(GenBank登录号:GQ205447),gyrB基因序列长度为1207bp(GenBank登录号:GQ205452);根据分离菌的表型特征及分子特征,判定病原菌为弧菌属(VibrioPacini1854)的霍乱弧菌(Vibriocholerae)。胞外酶活性及溶血活性检测表明分离菌均具有蛋白酶、卵磷脂酶、淀粉酶、明胶酶及DNA酶活性,在含7%家兔脱纤血...  相似文献   

新旧地形图编号及范围解算方法          下载免费PDF全文

孙万民  毕永良  鲁强  任来平  张哲 《海洋测绘》2009,29(5):30-32

在深入分析新、旧地形图分幅及编号规则的基础上,建立了新地形图编号算法模型、新地形图图幅范围解算模型以及新、旧地形图编号转换算法模型。解决了地形图编号的快速检索与图幅范围解算等问题。  相似文献   

2-[[(2-氨基苯基)亚胺]苯甲基]-4-氯苯酚晶体结构的量子化学研究     

范玉华  何连花  毕彩丰  艾小康  王爱东  张栋梅 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2009,39(3)

采用密度泛函理论(DFT)B3LYP方法,运用Gaussian03量子化学程序包,在B3LYP/6-31G*基组水平上对合成的化合物2-[[(2-氨基苯基)亚胺]苯甲基]-4-氯苯酚的晶体结构进行优化,计算了分子稳定构型的总能量、前线分子轨道能量、原子自然电荷布局、自然键轨道(NBO)及稳定化能等.计算结果与通过单晶X-射线衍射法测得的晶体结构的实验结果吻合.此项研究可为异双希夫碱配体及其金属配合物的合成及实际应用提供理论参考.  相似文献   

基于存储结构的三元组地理信息元数据模型     

梁大圣  刘纪平  梁勇  毕军芳 《测绘通报》2009,(2)

首先分析地理信息数据库中元数据现有模型及其存在问题,给出地理信息元数据设计模型的原则和地理信息数据的五级存储结构,研究数据的存储结构与地理信息元数据的关系和数据应用与元数据的关系,并设计了一种基于地理信息数据五级存储结构的,由数据基本信息、数据基本操作和数据基本关系三元组来描述的基础地理信息元数据模型及其具体模板,解决地理信息数据在存储、管理和应用上难以协调的问题.  相似文献   

基于遥感技术的大安市土地利用现状分析     

马晶  毕强  鹿鹏 《测绘通报》2009,(11)

随着人类活动对环境的影响,人口、资源与环境问题日益突出,由此引起的土地利用变化尤其引起普遍关注。随着遥感平台的多样化和图像分辨率的提高,遥感技术已成为土地利用现状调查研究中不可或缺的手段。遥感技术以其宏观性、实时性、周期性及综合性等特点,为快速、客观、准确地获取土地利用现状信息提供了可能。通过采用2007年大安市SPOT 5遥感影像,对大安市的土地利用类型进行解译,最终得到各类土地的分类数据,以此为基础开展土地利用现状分析。  相似文献   

黄东海表观光学量与固有光学量经验模式研究     

汪小勇  李铜基  刘炜  杨安安  毕大勇  李尉尉 《海洋技术学报》2008,27(1):58-65

表观光学特性和固有光学特性是海洋光学研究领域的两大主要研究内容。文中通过2003年黄东海试验和2007年908专项海洋光学调查所获取的表观光学参数中的遥感反射率Rrs(λ)、水下遥感反射率rrs(λ)、海水透明度Zs、下行辐照度漫衰减系数Kd(490)、固有光学参数中的后向散射系数bb(λ)和水体吸收系数a(λ),建立了区域性、季节性的表观光学量和固有光学量之间的经验模式,并对模式进行了误差分析和改进。  相似文献   

半滑舌鳎病原鳗利斯顿氏菌表型及分子特征研究   总被引：4，自引：0，他引：4  

张晓君  秦国民  阎斌伦  徐静  毕可然  秦蕾 《海洋学报》2009,31(5):112-122

2008年12月,江苏赣榆某渔场养殖半滑舌鳎出现大量死亡,症状主要表现为:头部、鳃盖及鳍基出血,尾鳍腐烂,腹腔膨胀并积有大量腹水,部分病鱼肠管脱出肛外。从病鱼肝脏、腹水中分离出大量优势生长的细菌,人工感染试验证明其对半滑舌鳎有较强的致病性。对3株分离菌进行了形态特征、理化特性、胞外酶及溶血素活性等表型生物学性状检验;测定了代表菌株的16S rRNA和gyrB基因序列,分析了16S rRNA和gyrB两种基因序列的同源性,并构建了系统发生树,比较了两种基因对分离菌的鉴定能力;结果表明gyrB基因用于细菌种间鉴定更具优越性;基于16S rRNA和gyrB基因的系统发育学分析表明分离菌与鳗利斯顿氏菌具有高同源性,根据分离菌的表型及分子特征,判定分离菌为利斯顿氏菌属(Listonella MacDonell and Colwell 1986)的鳗利斯顿氏菌[Listonella anguillarum (Bergeman 1909) MacDonell and Colwell 1986]。胞外酶活性及溶血活性检测表明3株分离菌均具有淀粉酶、蛋白酶、卵磷脂酶等胞外酶活性,在含7%家兔脱纤血液营养琼脂培养基上呈β型溶血,PCR检测3株供试菌均可扩增出大小约493 bp的溶血素基因和大小约248bp的金属蛋白酶基因。分离菌的耐药谱测定结果显示,对供试49种抗菌药物中的青霉素G等13种药物耐药,对羧苄青霉素等6种药物存在敏感与耐药的株间差异。  相似文献   

北太平洋波浪输运和西边界流的季节变化     

张坤兰  吴克俭  胡保全  毕凡 《海洋湖沼通报》2009,(4)

西边界流输运可以用Sverdrup理论推算出来.本文首先利用ECMWF再分析风场数据,计算了44年的月平均的风应力旋度及Sverdrup体积输运,在北太平洋3条纬度上对Sverdrup体积输运进行积分,得到Sverdrup体积输运的季节变化,从中发现,在向赤道流动的方向上,Sverdrup体积输运在冬季存在最大值,夏季存在最小值;同样利用ECMWF再分析波浪数据,计算了44a的月平均的Stokes体积输运,在相同纬度上对Stokes体积输运进行积分,得到Stokes体积输运的季节变化,从结果中发现,在向赤道流动的方向上,Stokes输运在冬季存在最大值,在夏季存在最小值.在本文中设定R=T_(st)/T_(sv)×100%,T_(st)为Stokes体积输运,T_(sv)为Sverdrup体积输运,发现Stokes输运和Sverdrup输运存在同位相的季节变化,并且(-R)冬季平均值在5%以上,年平均值在2%～3%左右,从而推断出波浪诱导的输运对Sverdrup输运,既对西边界流有不可忽视的贡献.  相似文献   

Crystal Structure and Geometry-Optimization Study of N-(2-hydroxy-1-naphthaldene)-4-aminoantipyrme     

GUO Feng  BI Caifeng  FAN Yuhua  WANG Aidong  XU Jiakun  ZHANG Xia 《中国海洋大学学报(英文版)》2008,7(2)

N-(2-hydroxy-1-naphthaldene)-4-aminoantipyrine has been synthesized. The structure is determined by X-ray diffraction method and elemental analysis. The crystal system belongs to orthorhombic space group P(2)2(1)2(1). The geometry has been ob-tained from the density functional theory (DFT) method and the B3LYP method employing the 6-31G* basis sets. The calculated results propose that the latter is close to the experimental data. The structural parameters from the theory are close to those of the crystal and the calculated total energy of coordination is -31677.172 eV. The energy of HOMO and LUMO and the energy gap are 5.179 eV, -1.603 eV and 3.577 eV, respectively.  相似文献