柄海鞘共附生细菌的分离培养与系统发育多样性研究     

苗婷婷  邢翔  杜宗军  陈冠军 《海洋科学进展》2012,30(1):111-118

通过纯培养和16SrRNA基因序列的相似性比对,并构建系统发育树对威海海域柄海鞘共附生细菌的多样性进行了研究。用2216E培养基从柄海鞘样品中分离到78株细菌,通过形态学特征和TCBS培养基选择性筛选后,选取30株具有代表性的菌株进行了16SrRNA基因测序和基于16SrRNA基因序列的系统发育多样性分析。结果表明,30株菌株分别属于细菌域的4个系统发育类群(Actinobacteria,Bacteroidetes,Firmicutes,Gro-teobacteria)的11个科,11个属。根据16SrRNA基因序列,大多数菌株与其系统发育关系最密切的模式菌株之间存在一定的遗传差异(16SrRNA基因序列相似性为91.82%～98.93%)。其中菌株HQW7,HQYD1,HQWD4,HQE1和HQE2与相关模式菌株的16SrRNA基因最高相似度仅分别为91.82%,92.51%,92.99%,93.52%,93.87%,这5株菌可能代表新的分类单元。威海海域柄海鞘共附生细菌存在着较为丰富的物种多样性和系统发育多样性,并可能存在新的物种。  相似文献   

吉尔吉斯斯坦伊塞克湖一处土壤样品细菌多样性          下载免费PDF全文

王宁  包慧芳  古丽尼莎·沙依木  王炜 《干旱区地理》2013,36(4):609-614

采用纯培养方法从吉尔吉斯斯坦共和国伊塞克湖一处温泉旁的土壤中分离到32株细菌,通过ARDRA 分析后得到不同的类群,从各个类群中随机选取1个代表菌株进行16S rDNA 序列测定和系统发育的分析。结果表明：分离的菌株分布在假单胞菌属（Pseudomonas）、类芽孢杆菌属（Paenibacillus）、芽孢杆菌属（Bacillus）、寡养单胞菌属（Stenotrophomonas）、Lysinibacillus、溶杆菌属（Lysobacter）、短芽孢杆菌属（Brevibacillus）、根瘤菌属（Rhizobium）、变形杆菌属（Proteus）等9个属,且部分菌株的16S rDNA序列同源性低于97%,可能是潜在的新种。结果揭示了该样点可培养细菌种群的多样性及独特性。  相似文献   

一株产铁载体细菌的筛选及其与云母的相互作用   总被引：2，自引：0，他引：2  

何琳燕  张垠  盛下放  黄智 《高校地质学报》2012,18(1):117-124

        产铁载体细菌与云母类矿物相互作用的研究有助于了解矿物生物风化和土壤形成的演化规律和机理。采用纯培养法 自南京龙山废钾矿区酸模根际土壤分离筛选到一株高产荧光铁载体的细菌Z6,通过16S rDNA 序列分析和生理生化反应将其 鉴定为假单胞菌属（Pseudomonas sp.）;通过室温静置培养试验研究Z6 菌株与云母的相互作用结果表明,细菌生长代谢前期 （8~15 d）快速产生大量铁载体,菌株与矿物共培养75 d 后,产铁载体细菌对云母类矿物确实产生了风化作用,黑云母组发 酵液中Fe 含量增加了211 倍,Si 含量增加了约27.8 倍,SEM 显示云母表面出现溶蚀坑,细菌可以在矿物表面形成生物膜或 矿物- 细菌复合物。不同矿物对共培养体系中细菌数量、荧光铁载体含量、溶液pH 的影响不同。  相似文献   

青藏高原土壤中一株低温原油降解菌的分离鉴定及其原油降解特性   总被引：2，自引：2，他引：0  

王艺霖  艾雪  李师翁  龙昊知  章高森  张威  刘光琇  陈拓 《冰川冻土》2015,37(2):528-537

从青藏高原班戈桥地区土壤中分离到一株能利用原油为碳源生长的细菌(BGQ-6). 通过16S rRNA基因序列比对及Biolog GEN Ⅲ鉴定板确定该菌株为Rhodococcus qingshengii. 将生长至对数期的菌株接入MM培养基, 10 ℃、150 rpm条件下培养15 d后, 通过GC法检测到该菌对原油的总降解率为74.14%, 且对直链烷烃、支链烷烃、环烷烃和芳香烃等60种烃类有较高的降解率. 通过特异性基因扩增检测到该菌株基因组中具有4个alkB和1个almA两种烷烃羟化酶基因.  相似文献   

Detection of antibiotic resistant bacteria inhabiting the sand of non-recreational marine beach     

Zbigniew Mudryk 《Marine pollution bulletin》2010,60(2):207-214

The present study examined the antibiotic resistance of heterotrophic bacteria, which were isolated from the sand of the beach located in the National Park of the southern Baltic Sea coast. The bacteria demonstrated low levels of antibiotic resistance. These microorganisms were the most resistant to cefaclor and clindamycin and the most sensitive to clarithromycin, doxycycline, gentamycin and oxytetracycline. The majority of bacteria inhabiting the sand of the studied beach were resistant to only one antibiotic out of 18 tested antibiotics in this study. The bacteria inhabiting the middle part of the beach and the dune were more antibiotic resistant than bacteria isolated from the seawater and the shoreline-seawater contact zone. Generally, there was no significant difference in antibiotic resistance between bacteria isolated from the surface and the subsurface sand layers. The bacterial antibiotic resistance level depends on the chemical structure of antibiotics.  相似文献   

我国植物内生菌研究进展   总被引：5，自引：0，他引：5  

赵旭  常思静  景春娥  薛林贵 《中国沙漠》2010,30(1):87-91

基于近年来我国植物内生菌研究成果,综述了我国植物内生菌的研究与开发进展,主要包括内生菌的分类方法、多样性、分布、生物学作用,以及内生菌资源的开发与应用等,并展望了我国内生菌资源的开发和利用前景,以便为进一步研究和利用植物内生菌资源提供理论依据。  相似文献   

纳米磁铁矿链的仿生合成及其生物矿化意义   总被引：1，自引：0，他引：1  

曲晓飞  姚奇志  周根陶 《高校地质学报》2011,17(1):66-75

本文在不使用任何蛋白质或生物分子的情况下,以四方针铁矿和二价铁离子为铁源仿生合成磁铁矿纳米颗粒。实验 结果表明,在弱碱性条件下,合成的磁铁矿颗粒为35 nm左右的近似立方体,而且这些颗粒能够自发的定向排列,形成类 似趋磁细菌体内的磁小体链状结构。作者认为,由于磁铁矿晶体存在着固有的磁偶极,晶体之间的磁偶极作用力驱动着磁 铁矿颗粒自发组装成定向排列的链状结构。这就揭示了在趋磁细菌体内磁小体的矿化及组装链形成过程中,除了生物蛋白 影响外,磁小体颗粒之间的磁偶极吸引作用也可能是一个重要因素。生物蛋白和晶体化学因素可能在趋磁细菌体内生物矿 化过程中协同起作用。  相似文献   

Experimental Investigation on Abstraction of Phenol Onto Micrococcus lylae and Cetyl Trimethyl Ammonium Bromide          下载免费PDF全文

Natarajan Saravani  Muthukumarasamy Arulmozhi  Kugarajah Vaidhegi 《洁净——土壤、空气、水》2016,44(11):1489-1498

  相似文献   

地下水中锰离子氧化细菌的分离与筛选鉴定   总被引：1，自引：0，他引：1  

路杨  刘相国  杨朔  宁波  张晓英  郝东云 《吉林大学学报(地球科学版)》2009,39(6)

从沈阳张士经济开发区净水厂的成熟生物滤池中,分离筛选得到了3株具有较强Mn~(2+)氧化能力的革兰氏阴性细菌,分别命名为Mn1、Mn2和Mn3.经3个菌株的16S rDNA鉴定及其系统发育学分析表明,菌株Mn1和Mn2为Delftia属,菌株Mn3为Klebsiella属.进一步考察了3株菌对地下水中浓度为2 mg/L的Mn~(2+)氧化及发酵能力.结果表明,3株菌均可在12 h内达到使1 m~3生物滤料成熟时所需的最少生物量;且Mn1、Mn2和Mn3对Mn~(2+)的相对氧化能力分别为96%、94%和85%,为生物滤池法去除地下水中铁锰的快速启动提供了菌种基础.  相似文献   

Evaluation of equivalence between different methods for enumeration of fecal indicator bacteria before and after adoption of the new Bathing Water Directive and risk assessment of pollution     

Darija Vukić Lušić  Dražen Lušić  Denis Pešut  Vladimir Mićović  Marin Glad  Lovorka Bilajac  Vesna Peršić 《Marine pollution bulletin》2013

The quality of bathing water is of considerable public importance due to the possibility of fecal contamination. In 2009, Croatia implemented the new European Bathing Water Directive (BWD, 2006/7/EC) establishing stricter microbiological standards for new parameters with new reference methods. This study aims to evaluate the equivalence of different methods according to the old and revised BWD and to provide the possibility of data comparison. Furthermore, the directive requires the establishment of the bathing water profile (BWP) for pollution risk assessment. The estimation of consistency of pollution risk assessment with obtained microbiological results was also performed.  相似文献