WOD09的PFL数据和Argo数据的比较     

陈帅  王丹  张志迅 《海洋技术学报》2011,30(4):32-37

WOD09(Wodd Ocean Database 2009)数据库的PFL(Profiling Float Data)数据集中包含了Argo浮标数据,同样在中国Argo数据中心也可以下载到Argo浮标数据.这两个来源的Argo浮标数据由于经过了不同的数据排重和质量控制过程,数据的数量和数据的质量并不完全相同.从多源数...  相似文献   

大菱鲆与耐高温性状相关的微卫星标记筛选   总被引：2，自引：0，他引：2  

马爱军  许可  黄智慧  王新安 《海洋科学进展》2011,29(3)

采用微卫星分子标记(SSR)技术分析大菱鲆(Scophthalmus maximus L.)耐高温相关特性,为耐高温大菱鲆的分子辅助育种提供合适的分子标记.将大菱鲆经过高温实验处理,区分为耐高温组与高温敏感组,用于实验分析.采用Salah.M法抽提大菱鲆肌肉组织的DNA,根据已知的30个大菱鲆微卫星位点的侧翼保守序列设计引物,进行微卫星引物PCR(SSR-PCR)扩增.对PCR扩增出的差异条带进行个体统计,最后进行微卫星位点与耐高温性状的相关性分析.结果表明,有1个微卫星位点与大菱鲆耐高温性状存在一定的负相关性;有3个微卫星位点与大菱鲆耐高温性状存在正相关性,其中位点Sma-USC27 286 bp的等位基因片段与耐高温性状的正相关性极显著,相关系数达到0.383(P＜0.01),其余2个位点为一般显著性相关.微卫星位点Sma-USC27所扩增出的差异等位基因片段可作为分子标记指导耐高温大菱鲆的辅助育种.  相似文献   

基于核基因组标记的群体遗传学研究中的数学分析方法   总被引：1，自引：0，他引：1  

包振民  王明玲  李艳  张玲玲  胡晓丽  黄晓婷  胡景杰  王师 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2011,41(11):48-56

近些年来,各种数学分析方法被广泛的应用于群体遗传学的研究中。然而,对这些数学分析方法的应用缺乏统一的认识,某些研究甚至存在着误用、乱用等现象。对近些年来基于核基因组标记的群体遗传学研究中主要采用的数学分析方法进行了系统的归纳整理,明晰了它们的适用条件和范围。同时,也综述了显性分子标记中对隐性等位基因频率估算的研究进展以及常用的群体遗传学分析软件包含的主要数学分析方法,对合理应用这些参数和软件进行群体遗传学分析具有指导意义。  相似文献   

基于Google Maps API等高线地形图专题网页的开发与应用     

冯美顺  王圣  王霞 《地理教学》2013,(2):56-58,49

正Google Maps API(以下简称API)是Google为开发者提供的Maps编程API,目前已升级为第3版。它允许开发者在不必建立自己的地图服务器的情况下,将Google地图嵌入到网站之中,从而实现嵌入Google地图的服务应用。此外,API还提供了大量实用工具以处理地图,通过各种服务向地图添加内容,使开发者能够开  相似文献   

多协议标记交换技术及应用     

文成玉  杨槐  樊昌元  刘乃琦 《成都信息工程学院学报》2003,18(3):228-231

多协议标记交换技术是一种全瓶的网络交换技术，它的成功应用，将会解决目前IP网络上存在的众多问题。阐述了多协议标记交换技术的原理、关键技术等，并简单介绍在虚拟专用网、流量工程、Qos等方面的应用。  相似文献   

基于转录组数据的马氏珠母贝EST-SSR位点的信息分析及其多态性检测     

王忠良  丁燏  许尤厚  简纪常  鲁义善  王蓓  陈刚  吴灶和 《海洋与湖沼》2015,46(3):687-693

为获得稳定可靠的马氏珠母贝SSR分子标记,本文利用MISA软件对转录组测序数据进行了大规模的EST-SSR标记发掘,并分析了位点信息及其多态性。结果表明,马氏珠母贝转录组测序所获得的74007条Unigenes中检测出9872个EST-SSR位点,位点出现频率为13.34%,平均每5102 bp含有1个SSR位点。在转录组SSR中共有132种重复基元类型,其中单核苷酸重复基元为主要类型,占SSR总数的81.46%;单核苷酸重复以A/T基序为主,占SSR总数的71.27%。基于筛选的SSR序列,应用Primer3软件进行引物的批量设计,共为5922条EST-SSR序列成功设计出17766对引物。随机选择80对引物对EST-SSR多态性进行检测,共有62对引物成功扩增出稳定条带,占引物总数的77.5%;其中,17对EST-SSR引物表现出个体多态性,多态性比率为27.42%。以上研究为马氏珠母贝遗传多样性、遗传图谱构建及分子辅助育种研究提供了有效工具,对于马氏珠母贝种质资源保护、优良品种培育和珍珠养殖业的健康发展均具有重要意义。  相似文献   

许氏平鲉(Sebastes schlegelii)EST-SSR标记开发及通用性检测     

薛蕊  马海涛  韩承慧  王斐  孙国华  姜海滨 《海洋与湖沼》2015,46(5):1096-1102

利用已发表的EST序列设计引物并结合PCR筛选的方法,对许氏平鲉多态EST-SSR引物进行了开发。结果表明:(1)许氏平鲉EST-SSR位点发现率为9.14%,核心序列以二碱基重复出现频率最高,占到33.03%,其中以TG/CA基序最为丰富。(2)共设计引物56对,46对实现有效扩增,其中18对具有多态性。(3)野生群体遗传多样性分析显示,每个位点观测等位基因数(Na)为2—9,平均观测等位基因数为3.89;观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)及平均值分别是0.0333—0.8000、0.0333—0.7927和0.3037、0.3757;每个位点的多态信息含量(PIC)在0.0323—0.7522之间,其中高度多态位点5个,中度多态位点5个;经Bonferroni校正后,3个位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡,但两两位点间不存在连锁不平衡现象。(4)许氏平鲉多态EST-SSR引物对朝鲜平鲉、褐菖鲉通用性检测结果表明,引物对二者的通用率和多态率分别为88.89%、100.00%和33.33%、88.89%。研究表明,这些通用引物可用于相关物种的遗传多样性评价、系统进化分析和比较基因组作图等研究。  相似文献   

一种个人地理标记数据的可视化方法     

华一新  李响  王丽娜  张晶 《测绘学报》2015,44(2):220-227

个人地理标记数据是个人通过笔记本、平板电脑或者手机等设备发布的包含地理位置且与个人相关的文本、照片和视频等信息。本文针对个人地理标记数据的特点,提出了一种适用于地理标签数据的可视化方法——个人地理标记数据拓扑图,并设计和实现了核心算法。为了比较和评估该方法的效能,对"文本列表""普通地图"和"标记拓扑图"3种用户界面进行了可用性测试,并对测试数据进行了方差分析。测试结论表明,3种不同用户界面在查找个人地理标记数据的效率方面存在显著性差异,其中文本列表和标记拓扑图均优于普通地图,文本列表和标记拓扑图在查找时间上的差异并不显著,标记拓扑图在查找时间均值上略优于文本列表。  相似文献   

地表热环境时空变化特征分析的动态展示系统     

《地理空间信息》2015,(4)

将SRT项目以网页的形式展现出来,通过网页将SRT项目的研究区域、研究目的、研究方法、研究结果以及数据成果进行动态展示,将展示系统上传到网端服务器,可让更多的人参与交流和学习,具有良好的交互性、共享性、开放性、协作性和自主性,是传统展板和PPT无法比拟的。  相似文献   

海水双壳类减数分裂器的一种免疫荧光显微观察方法     

李永仁  阙华勇  张国范 《海洋科学》2009,33(2):38-40

为定性并定量研究海水双壳类受精过程中纺锤体和染色体的动态,改进了一种免疫荧光显微观察方法,包括样品的预处理、荧光染色和荧光显微观察.本方法适用于同步观测海水双壳类的纺锤体和染色体,具有操作简捷、清晰度高的优点.  相似文献