牙鲆、石鲽和川鲽的线粒体16S rRNA基因片段的序列比较研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

孔晓瑜  刘亚军  喻子牛  庄志猛  武云飞 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2001,31(5):713-722

以相应引物对牙鲆(Paralichthysolivaceus)和石鲽(K.areiusbicoloratus)的线粒体16SrRNA基因片段进行了PCR扩增,PCR产物经T载体连接之后进行了克隆、测序,均得到了590bp的碱基序列,并将其与GenBank中牙鲆线粒体全序列相应片段和川鲽(Platichthysflesus)相应片段进行比较,结果表明,川鲽和石鲽序列差异很小(核苷酸差异数为7,同源性为98.8%);而牙鲆与川鲽和石鲽的序列差异明显(核苷酸差异数为90～93,同源性约为84%),且大多数核苷酸变异位点集中在序列中部大约200bp的区域.  相似文献   

养殖牙鲆鱼苗腹水症病原菌的鉴定及系统发育学分析   总被引：34，自引：7，他引：34       下载免费PDF全文

莫照兰  茅云翔  陈师勇  张振冬  徐永立  张培军 《海洋与湖沼》2003,34(2):131-141

从患腹水症养殖牙鲆鱼苗分离到一株细菌B17，人工感染实验证实春具有致病性。用Biolog-GN细菌鉴定系统对B17进行测试，发现其与参考菌株的相似性较低，不能进行鉴定。常规生化测试表明，B17具有弧菌属的特征，其表型特征与Vibrio splendidus非常相似。为了进一步明确菌株B17的分类学地位，测定了其16SrRNA基因序列，分析了相关细菌相应序列的同源性，构建了系统发生树，结果表明菌株B17与V. splendidus的亲缘关系最近。综合上述结果，菌株B17可鉴定为V.splendidus。  相似文献   

Seasonal phytoplankton composition, productivity and biomass in the Neuse River estuary, North Carolina     

Michael A. Mallin  Hans W. Paerl  Joseph Rudek 《Estuarine, Coastal and Shelf Science》1991,32(6)

Phytoplankton community composition, productivity and biomass characteristics of the mesohaline lower Neuse River estuary were assessed monthly from May 1988 to February 1990. An incubation method which considered water-column mixing and variable light exposure was used to determine phytoplankton primary productivity. The summer productivity peaks in this shallow estuary were stimulated by increases in irradiance and temperature. However, dissolved inorganic nitrogen loading was the major factor controlling ultimate yearly production. Dynamic, unpredictable rainfall events determined magnitudes of seasonal production pulses through nitrogen loading, and helped determine phytoplankton species composition. Dinoflagellates occasionally bloomed but were otherwise present in moderate numbers; rainfall events produced large pulses of cryptomonads, and dry seasons and subsequent higher salinity led to dominance by small centric diatoms. Daily production was strongly correlated (r = 0·82) with nitrate concentration and inversely correlated (r = −0·73) with salinity, while nitrate and salinity were inversely correlated (r = −0·71), emphasizing the importance of freshwater input as a nutrient-loading source to the lower estuary. During 1989 mean daily areal phytoplankton production was 938 mgC m⁻², mean chlorophyll a was 11·8 mg m⁻³, and mean phytoplankton density was 1·56 × 10³ cells ml⁻¹. Estimated 1989 annual areal phytoplankton production for the lower estuary was 343 gC m⁻².  相似文献   

红树林海洋细菌的分离鉴定及其活性物质初步分析   总被引：5，自引：1，他引：5  

梁静娟  庞宗文  詹萍 《热带海洋学报》2006,25(6):47-51

从广西北部湾红树林海洋淤泥中分离筛选到270株海洋细菌,用喉癌细胞Hep-2的细胞毒作用为筛选模型,用SRB法检测这270株海洋细菌的抑制肿瘤细胞生长活性,其中13株呈阳性反应。依据形态和生理生化反应特征及16SrRNA基因序列分析,确定其中一株为短小芽孢杆菌Bacillus pumilusPLM4。取该菌株液体培养上清液,检测对人喉癌细胞Hep-2的生长抑制率为63.9%,经过凝胶过滤层析分析获得2个活性峰,其中活性高的峰估计平均分子量为116kd。采用经典显色反应法初步判断该活性物质为多糖。  相似文献   

椒江口化工园区邻近海域沉积物中细菌多样性初步研究     

蒋然  王健鑫  黄备  张潘  郑俊威  俞凯成  刘明华 《海洋与湖沼》2015,46(6):1420-1437

为研究椒江化工园区邻近海域沉积物中细菌结构, 选取四个典型站点, 通过分离纯化、鉴 定和建立克隆文库的方法, 对其进行多样性及系统发育分析。可培养细菌的形态学及API 鉴定结果 显示洋葱假单胞菌及杀鲑气单胞菌杀鲑亚种是优势种, 典型细菌16S rDNA 分子鉴定结果表明厚壁 菌门及γ-变形菌纲为主要类群。非培养细菌克隆文库的序列分析结果表明: 细菌主要包括变形菌门、 酸杆菌门、绿弯菌门、芽单胞菌门、硝化螺旋菌门、CFB 群、放线菌门、厚壁菌门、浮霉菌门等9 个类群; 其中C3 站点克隆子主要属于γ-变形菌纲及δ-变形菌纲; C4 站点克隆子以γ-变形菌纲及酸杆 菌门为主; C5 站点克隆子主要属于δ-变形菌纲及γ-变形菌纲; C6 站点克隆子主要属于γ-变形菌纲及 放线菌门。综合可培养及非培养结果, 可发现椒江口化工园区邻近海域沉积物中γ-变形菌纲为典型 优势类群, 除相当数量的克隆子相似序列来自石油烃污染的沉积环境外, 还有大量克隆子相似序列 来自养殖污染环境。  相似文献   

南极冰藻 Chlamydomonas sp.ICE-L的 cDNA文库构建及品质检测     

王能飞  沈继红  金治平  赵爱云  林学政 《海洋科学进展》2006,24(4):520-525

为构建南极冰藻Chlamydomonassp.ICE-L的cDNA文库,提取对数生长期南极冰藻ICE-L的总RNA,以此为模板,通过PowerScript逆转录酶逆转录合成第一链cDNA;再以第一链cDNA产物为模板,用LD-PCR合成第二链cDNA。该cDNA产物经分级分离转入大肠杆菌中,即获得南极冰藻ICE-L的cDNA原始文库,其滴度为1.6×106cfu/mL。扩增后的cDNA文库的滴度为1.0×1010cfu/mL。用PCR方法测得文库的重组率大于97%,插入cDNA的长度为0.5~1.8 kb,0.9 kb以上插入片段占50%以上。取适量扩增文库稀释并铺平板,挑取72个独立菌落,对其中22个独立菌落所插入的cDNA进行测序,克隆到了一个具有5′和3′非编码区的40S ribosomalprotein S5全长基因序列,GenBank收录号为AM167929。  相似文献   

3S技术在土地利用动态监测中的应用     

滕晓波  陈春花 《全球定位系统》2010,35(3):38-41

准确把握土地使用状况是依法实施土地资源管理的基础。3S（GPS、RS、GIS）技术因具有快速、准确、实时、大范围的对地观测能力及强大的空间信息加工、处理和分析能力,而成为土地使用动态监测的首要技术手段。详细介绍了3S技术在土地使用信息的判读、提取、坎西恩、分析和处理等环节中的作用和具体应用。  相似文献   

"3S"技术在四川木里地区金矿资源预测与定位中的应用     

徐韬  尹显科  宋元宝  李威 《四川地质学报》2005,25(2):122-126

在新的成矿理论、新思路的指导下,通过对已有地质、物探、化探、遥感资料进行二次开发及综合研究分析。应用以遥感技术(RS)为主。辅以GIS、GPS技术和野外现场验证等多源信息手段和方法,进行成矿预测,高效、快速、经济地实现找矿靶区的预测与定位。  相似文献   

基于3S技术的土地利用现状长效管理机制     

王号  曹中初  杨珂拉 《国土资源信息化》2010,(1):63-66

本文介绍了上海市土地利用现状长效管理机制的构建思路、总体框架,及其发现——调查——处置——反馈机制。最后总结了上海市土地利用现状长效管理机制的作用和效果。  相似文献   

3S技术支持下的安溪茶业信息化     

吴定定 《地理空间信息》2010,8(5):21-23

在介绍3S及其在茶业信息化的基础上,提出了构建基于3S安溪茶业信息平台的新思路。对系统的目标、架构设计及系统的功能设计进行了详细的介绍。该平台对安溪茶业信息化建设具有一定的实用意义。  相似文献