牙鲆、石鲽和川鲽的线粒体16S rRNA基因片段的序列比较研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

孔晓瑜  刘亚军  喻子牛  庄志猛  武云飞 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2001,31(5):713-722

以相应引物对牙鲆(Paralichthysolivaceus)和石鲽(K.areiusbicoloratus)的线粒体16SrRNA基因片段进行了PCR扩增,PCR产物经T载体连接之后进行了克隆、测序,均得到了590bp的碱基序列,并将其与GenBank中牙鲆线粒体全序列相应片段和川鲽(Platichthysflesus)相应片段进行比较,结果表明,川鲽和石鲽序列差异很小(核苷酸差异数为7,同源性为98.8%);而牙鲆与川鲽和石鲽的序列差异明显(核苷酸差异数为90～93,同源性约为84%),且大多数核苷酸变异位点集中在序列中部大约200bp的区域.  相似文献   

6种笛鲷属鱼类Cyt b基因片段序列的比较   总被引：10，自引：0，他引：10  

周发林  江世贵  苏天凤  吕俊霖 《热带海洋学报》2004,23(4):87-92

采用聚合酶链式反应直接测序法，获得紫红笛鲷(Lutjanus argentimaculatus)、白星笛鲷(L．stellatus)、千年笛鲷(L．sebae)、勒氏笛鲷(L．russelli)、红鳍笛鲷(L．erythropterus)5种笛鲷属鱼的线粒体细胞色素b(Cyt b)425bp序列，并结合基因库中的斜带笛鲷(L．decussatus)Cytb同源序列进行比较分析，共发现88个核苷酸位点存在变异(20．7％)。用MEGA2．1软件中的Pairwise distance工具计算了6种笛鲷属鱼类的相对遗传距离，表明6种笛鲷属鱼类的序列差异在0．096-0．129之间，其中红鳍笛鲷和紫红笛鲷序列差异最大为0．129，千年笛鲷与红鳍笛鲷的序列差异最小为0．096；序列变异的转换／颠换比值较低，平均只有2．160。  相似文献   

半参数回归在测量平差中的应用     

吴凤娟  吕志平  汤廷松  李森 《海洋测绘》2007,27(6):16-18

针对测量平差中的实际问题,引入半参数回归模型,分析了它在测量平差中应用的可能性,并以实例与经典测量平差方法进行精度分析,说明该方法的有效性。对含有系统误差的测量平差问题进行了试算,为进一步研究半参数回归模型在测量平差中的应用具有一定的意义。  相似文献   

长菱形藻(Nitzschia longissima)和新月细柱藻(Cylindrotheca closterium)分子分类研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

李海涛  杨官品  石媛嫄  吴岁寒  孙颖 《海洋湖沼通报》2006,(3):67-72

本研究自胶州湾分离了两种底栖硅藻,形态学初步鉴定为长菱形藻和新月细柱藻。对其18S rDNA和rbcL基因进行了测序并用邻接法构建了系统树。结果表明,两藻在18S rD-NA和rbcL基因序列上均存在较大的差异,基于DNA序列的分类结果与形态学分类结果一致。在依据形态指标难以确定藻类分类地位的情况下,18S rDNA和rbcL基因序列是有用的鉴定工具。  相似文献   

Cloning and Structural Analysis of Calmodulin Gene from the Mangrove Plant Sonneratia Paracaseolaris     

Xiong Lingyuan  Lin Tao  ZHOU Hantao  Xu jinsen  Ge Yunsheng  Chen Muchuan  Chen Liang 《海洋通报(英文版)》2002,4(2)

Calmodulin is a calcium binding protein that modulates the activity of diverse groups of protein including some protein kinase, adenylate cyclases and ATPase. Here we use the total DNA of Sonneratiaparacaseolaris as the template ofthe polymerase chain reaction (PCR). The PCR primers have been designed and synthesized according to the 5-and 3-terminal oligonucleotide sequences of Calmodulin gene of plants in Genbank and ligated with cloning vector pBsk( ).The recombinant clones have been obtained from the selected medium. The results of DNA sequences analysis show that the nucleotide sequences of ORF share more than 85% homologies as compared with those ofcalmodulin genes of several other plants. Similar to rice and apple, the ORF is interrupted by an intron behind the 75th nucleotide.  相似文献   

不同发育阶段文蛤同工酶基因的表达研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

李太武  苏秀榕  季延滨  刘保忠 《海洋学报》2006,28(5):162-166

文蛤(Meretrix meretrix),隶属于瓣鳃纲(Lamellibranchia)、帘蛤目(Veneroida)、帘蛤科(Veberidae).在我国是一种重要的养殖种类.目前有关文蛤的研究主要集中在生态学方面,而有关文蛤个体发育的研究还未见报道.已经证明在动物发育过程中同工酶谱的变化与形态分化和器官形成具有相关性,同工酶电泳技术解释为“基因如何控制个体发育”以及确定个体发育的基因调控表达的重要阶段等问题提供一种有效的实验方法.  相似文献   

Characteristics and phylogeny of light-harvesting complex gene encoded proteins from marine red alga Griffithsia japonica     

LIU Chenlin  HUANG Xiaohang  LEE Yookyung  LEE Hongkum  LI Guangyou 《海洋学报(英文版)》2005,24(2):120-130

1 Introduction T he light-harvesting com plex (LH C ) com posedofphotosynthesis pigm ents and associated proteins arelocated on the thylakoid m em brane of chloroplast inhigherplants and algae. T he capture oflightenergy isthe first step in photosynthesis and is largely accom -plished by the pigm entprotein com plexes. To m axi-m ize the capture of light energy under various envi-ronm entalconditions, the LH C s w ith differentchro-m ophore com positions have evolved in differentpho-tosynth…  相似文献   

红树植物拟海桑钙调蛋白基因的克隆及分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

熊玲媛  林涛  周涵韬  徐金森  葛运生  陈睦传  陈亮 《台湾海峡》2002,21(2):193-198,T002

钙调蛋白（Calmodulin)是生物细胞内一种重要的调控蛋白，通过其与靶酶的相互作用控制细胞正常的生长和发育，作者以高抗盐红树植物海桑属拟海桑（Sonnera-tia paracasolaris)总DNA为模板，参考GenBank上植物钙调蛋白基因序列合成5′端和3′端引物，利用多聚酶链式反应（PCR）扩增了拟海桑钙调蛋白基因，与克隆载体pBsk( )重组，转化Escherichia coliDH5α得到重组克隆子，DNA序列分析表明，所得片段的编码区在核苷酸序列上与迄今已知的几种植物钙调蛋白基因有很高的同源惺 ，同源率在85%以上；与水稻、苹果，衣藻等相似，其基因编码区被一个位于第75位核苷酸之后的内含子所中断。  相似文献   

温度对南极衣藻ICE-L(Chlamydomonas sp. ICE-L)谷胱甘肽含量及其相关酶活性的影响   总被引：6，自引：2，他引：6  

丁燏  缪锦来  王全富  阚光锋  郑洲  李光友 《海洋与湖沼》2006,37(2):154-161

采用分光光度法研究了在不同温度下(包括最适温度、低于或高于最适温度)南极衣藻ICE-L(Chlamydomonassp.ICE-L)谷胱甘肽(GSH)含量、蛋白含量、谷胱甘肽过氧化物酶(GPx)、谷胱甘肽还原酶(GR)和谷胱甘肽硫转移酶(GST)活性,同时分析了已适应高温(16℃)的衣藻重新适应低温(8℃)时这些指标的变化,以期阐明谷胱甘肽系统与南极冰藻低温适应性的关系。结果表明,当温度低于对照组(最适温度8℃)时,蛋白含量降低,而GSH含量、GPx、GST和GR活性上升,已适应高温的衣藻重新适应低温时也出现类似的结果。但当温度高于最适温度时,GSH含量、GST和GPx活性下降,而蛋白含量和GR活力有上升的趋势,GR活力增长幅度比低于最适温度时的变化小。由此可见谷胱甘肽系统在南极衣藻低温适应过程中,GSH、GPx、GR、GST与低温适应呈正相关,同时除GR外其他因子与南极衣藻高温适应呈负相关,GSH及其相关酶在南极冰藻低温适应中具有重要作用。  相似文献   

委内瑞拉产地龙须菜藻红蛋白基因的克隆及其系统学研究     

隋正红  张学成 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2003,33(3):384-390

本文报道了红藻 Gracilaria lemaneiformis委内瑞拉株的藻红蛋白基因的部分序列 ,将所得序列与其它红藻 - Rhodella violacea,Polysiphonia boldii,Griffithsia monolis,Porphyra tenera,Porphyra yezoensis及青岛产龙须菜的相应序列对齐后 ,进行了系统学研究。结果显示 ,同一属的藻红蛋白 α和 β亚基之间的间隔序列 ,从长度到核苷酸序列均非常相似 ,而同一科不同属或同一目的科间的该序列有很大的不同 ;两不同产地龙须菜的 PE基因在 β亚基上的转换多于颠换 ,说明 β亚基比 α亚基保守 ;委内瑞拉来源龙须菜与青岛产地龙须菜可能不属于同一物种 ,应为同属不同种关系 ;由藻红蛋白基因所得的系统树包括 3个与建立在形态标准上的遗传位置一致的分支 ;藻红蛋白基因序列可用于种间及更高地位的分子系统研究。  相似文献