施氏鲟Asnanos1基因序列分析及其在雌雄不同组织中表达     

肖懿哲  朱友芳  孙玉龙  张鑫  张子平  王艺磊 《海洋科学》2017,41(4):17-23

本研究首先从施氏鲟(Acipenser schrenckii)性腺转录组中获得nanos1(Asnanos1)基因全长c DNA,并对其序列的准确性和特征分别进行PCR验证和生物信息学分析。进一步利用荧光定量RT-PCR技术检测Asnanos1基因在雌、雄施氏鲟的性腺、心脏、鳃、脑、肾、肝脏、脾脏等组织中的表达量。利用荧光定量RT-PCR技术检测Asnanos1基因在雌、雄施氏鲟的性腺、心脏、鳃、脑、肾、肝脏、脾脏等组织中的表达量。结果显示:Asnanos1的c DNA全长为1 389 bp,其中,5′非编码区(UTR)为414 bp,3′UTR为279 bp,ORF为696 bp。该基因共编码231个氨基酸。Asnanos1基因在施氏鲟除心脏以外的各组织中均有表达,在雌、雄鱼的鳃、脑、肾、肝脏、脾脏等组织中表达量无显著差异,但在卵巢中的表达量显著高于其他各组织(P0.05)。所得到的结果可为人工培育全雌施氏鲟苗种提供一些基础资料。  相似文献   

基于Storm的地理编码引擎     

余靖毅  邬伦  高勇 《地球信息科学学报》2015,17(12):1431-1441

近年来,随着Web 2.0和具有位置感知能力的移动计算设备的普及应用,带来了大量含有时空语义的地理大数据。在这个背景下,以地图厂商人工方式和半自动方式更新地名地址库为基础的传统地理编码服务,已难以满足新的应用需求。本文提出一种地理大数据驱动的自适应地理编码引擎的构建思路和方法,通过引入实时计算和流式计算平台Storm,实现对网络中的多源地理大数据的爬取与实时处理,加速地名地址库及相关资源的生成与更新过程,并给出了相适应的地理编码匹配方法。在实时流式计算框架基础上,通过JTS Topology Suite实现流式并行的空间操作,设计并实现了基于Storm的地理编码引擎原型系统,满足多源地理大数据的高效处理和地理编码要求。实验结果表明,该引擎通过实时流式处理可加速地址库的扩充与更新过程,并且利用地址库持续更新的方法,提升了地理编码的匹配率和定位准确度。  相似文献   

煤层气井流体原位实时监测仪     

李炯  乌效鸣  李瑞  张峰 《煤田地质与勘探》2015,43(3):99-101

煤层气生产过程中,需要随时了解和掌握煤层气井的产水、产气、液面高度等各项参数,以便根据生产阶段的需要及时调整生产参数,使煤层气井的生产处于最佳状态。目前国内煤层气抽采过程中仅能单独测量压力、温度、液位等参数,并不能检测每个层位的产气产水量,因此为了达到长期同时监测不同层位煤层的目的,设计了煤层气井流体原位实时监测仪。该监测仪不仅能测量温度、压力等参数,还可结合地面测得的气、水流量,分别得出不同层位煤层的产气产水量,为煤层气开采方法的确定提供科学依据,有利于提高煤层气抽采率。   相似文献   

基于累积偏移算法的线路矢量数据实时压缩     

王飞  曾燕  赵小波  刘胤田 《地球信息科学学报》2014,16(2):173-181

针对线路矢量数据实时采集和同步压缩应用需求,本文提出具有高压缩率、低失真度特点的累积偏移实时压缩算法（CORC Algorithm）。算法突出对弯曲极值点和距离偏移的感知,创新性地提出累积变向点和累积变向拐点的弯曲极值点探测方法,提出距离累积偏移临界点的线路偏移快速判断方法,从而有效提高算法对方向连续偏移的敏感度和对摇摆偏移的高压缩率,提高线路矢量数据实时压缩的高保真性。累积偏移实时压缩算法在高限差阈值情况下仍能有效发现各类弯曲极值点和距离累积偏移临界点,在O（N）时间复杂性和O（1）空间复杂性下取得高压缩率、低失真度的理想压缩效果,实现了线路采集的零延时同步压缩。应用定时、定距两种采集策略生成的线路矢量数据集,与垂距法（VD Algorithm）、分段道格拉斯-普克法（Subsection DP Algorithm）进行实时压缩性能实验对比,结果表明,累积偏移法作为实时压缩方法,与上述两种主流实时压缩算法相比,在压缩实时性、压缩率失真度平衡、限差阈值可控性3方面都具有明显的优越性。在同等压缩率情况下,累积偏移压缩算法失真度普遍降低达10%,且压缩率与失真度的平衡性受限差阈值取值和线路轨迹特征影响最小,可实现线路的定位采集、实时压缩、同步网络上传,在交通、旅游、探险搜救等领域的实时定位监控中具有广阔的应用前景。  相似文献   

大规模地形实时绘制算法   总被引：8，自引：3，他引：5  

朱军  龚建华  齐华  曹振宇 《地理与地理信息科学》2005,21(2):24-27

该文提出一种适合大规模地形实时绘制的简单高效的LOD简化算法。该算法使用一种紧凑有效的规则网格表示方法,优化网格节点的数目,减少可视化过程中的计算量,降低额外内存开销。探讨该算法相关的数据组织、视域裁剪、LOD层次选择、裂缝消除、三角形化等关键问题。实验结果表明,该算法实现简单,内存开销较少,CPU耗费小,对图形卡要求低,能够在普通机器上实现大规模地形的实时漫游。  相似文献   

SEED格式STEIM2数据压缩算法在实时地震数据传输中的应用   总被引：9，自引：1，他引：8  

王洪体  陈阳  庄灿涛 《地震地磁观测与研究》2004,25(4):14-19

在一定带宽内,及时、高效、无失真地传输地震数据是地震数据传输的基本要求,SEED格式给出的数据格式在数据压缩方面有其独到之处,但SEED格式没有定义数据正确性和完整性保证机制和检验方法,因而影响实时传输中的使用。本文提出一种基于SEED格式的STEIM2数据压缩算法,同EDAS数据包形式兼容的实时压缩数据包编码方法,来实现实时压缩数据的传输。经理论评估和实际数据检验,它容易实现,效率高,安全,可靠,完全可以应用于实时数据传输。  相似文献   

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郭爱智  王勇  刘根友  郑晖  张茂顺 《大地测量与地球动力学》2013,33(5):34-38

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An efficient method of noroviruses recovery from oysters and clams     

ZHOU Deqing  MA Liping  ZHAO Feng  YAO Lin  SU Laijin  LI Xinguang 《中国海洋大学学报(英文版)》2013,12(1):85-90

Noroviruses (NoVs) are widespread causes of nonbacterial gastroenteritis. Outbreaks of NoVs caused diseases are commonly ascribed to the consumption of contaminated shellfish. The concentration and RNA extraction of NoVs are crucial steps of detecting NoVs in shellfish. This study aimed to select a simple, rapid and highly efficient recovery method of NoVs detection with real-time RT-PCR. Four methods of recovering GI.3 and GII.4 NoVs from spiked digestive tissues of oysters and clams, respectively, were compared, of them, the method involving proteinase K and PEG 8000 was found the most efficient. With this method, 9.3% and 13.1% of GI.3 and GII.4 NoVs were recovered from oysters and 9.6% and 12.3% of GI.3 and GII.4 NoVs were recovered from clams, respectively. This method was further used to detect NoVs in 84 oysters (Crassostrea gigas) and 86 clams (Ruditapes philippinarum) collected from 10 coastal cities in China from Jan. 2011 to Feb. 2012. The NoVs isolation rates were 10.47% of clams (9/86) and 7.14% of oysters (6/84). All the detected NoVs belonged to genotype GII. The NoVs recovery method selected is efficient for NoVs detection in oysters and clams.  相似文献   

刺参虾青素基因的克隆及不同体色个体间表达差异的分析     

赵鹤凌  杨红生  赵欢  刘石林 《海洋科学》2012,36(3):22-28

仿刺参(Apostichopus japonicus Selenka)的体色变化很大,多数背腹均为黄褐色,极少数呈白化特征,背腹均为纯白色。经人工繁育实验发现,白化仿刺参的子代仍多具白化特征。本文研究了虾青素基因与刺参白化特征的相关性。在克隆虾青素基因cDNA全长的基础上,比较了普通仿刺参和白化仿刺参在不同发育时期虾青素基因表达量的差异。结果表明,该基因的cDNA含有2058个核苷酸,编码560个氨基酸。经实时定量PCR分析,白化成参体壁中虾青素基因表达量显著低于普通成参;而在仿刺参色素沉积的早期,白化稚参体壁中虾青素基因表达量从受精后第39天开始显著低于普通稚参。可见,仿刺参体壁中虾青素基因的低表达与刺参白化特征的发生密切相关。  相似文献   

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钟斌  吴云 《大地测量与地球动力学》2012,32(4):57-60

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