赤潮叉角藻18SrDNA和ITS区序列测定与分析   总被引：20，自引：0，他引：20  

庄丽  陈月琴  李钦亮  屈良鹄 《海洋与湖沼》2001,32(2):148-154

采用PCR及克隆测序的方法，对1998年引发渤海赤潮的叉角藻18SrRNAadldey DNAITS区（Internal Transcribed Spacer Regions)进行了序列测定与分析。并通过因特网从国际分子生物学数据库中获取甲藻另外15个种的18rDNA序列，以Tetrahymena corlissi作为类群，分别采用Neighbor-Joining和Fitch方法构建甲藻较为一致和可靠的进化树图，探讨具有高度多样性和在分类上争议较多的甲藻各类群之间的形态与分子进化关系。结果表明，Prorocentrum(有2个简单的壳板）出现得较早，而大多数多甲藻目（覆盖着多个壳板）、裸甲藻目（大多数不具壳板）和膝沟藻目的成员较晚出现。另外，对叉角藻ITS区的分析表明，ITS区为高变区，是良好的分子标记，可用于叉角藻快速鉴定的专一性核酸分子探针的研制。  相似文献   

南沙群岛微型与超微型真核藻类遗传多样性的初步研究   总被引：3，自引：0，他引：3  

袁洁  邵鹏  陈月琴  蔡创华  屈良鹄 《海洋科学》2003,27(7):43-47

用分子生物学方法建立了南沙海域5号采样点附近海域的微型、超微型真核藻类18S rDNA库，采用RFLP和基因测序的手段对其遗传多样性进行了初步探讨。研究表明南沙海域的微型、超微型藻类的遗传多样性十分丰富，而且尚有大量未获培养的、分类位置未知的物种有待研究。  相似文献   

南沙群岛海区沉积物中可培养的非嗜压好气性异养细菌的初步调查     

戴欣  蔡创华  周惠  周毅频  陈月琴  周世宁  屈良鹄 《热带海洋学报》2003,22(5):76-81

采用16SrRNA基因序列分析，对南沙群岛海区沉积物中分离获得的细菌进行了种类鉴定及多样性初步研究。发现沉积物中可培养的非嗜压好气性异养细菌主要为革兰氏阳性细菌，其中海洋芽孢杆菌又是最常见的种；分离获得的菌株中存在部分细菌的16SrDNA序列与发表在国际基因数据库中的16SrDNA序列表现出较大的差异，但目前尚未能直接确定其属种，说明在南海海洋沉积物中存在着我们目前还不了解的细菌多样性，而且可以通过分离培养获得其中的部分新的菌株，提示该海区沉积物中蕴藏着丰富的细菌资源。  相似文献   

南海有毒塔玛亚历山大藻的分子地理标记分析   总被引：10，自引：0，他引：10  

陈月琴  邱小忠  屈良鹄  曾陇梅  齐雨藻  郑磊 《海洋与湖沼》1999,30(1):45-51

采用聚合酶链扩增反应（ＰＣＲ）和限制性片段长度多态性分析（ＲＦＬＰ）方法,对１９９２年５月和１９９４年１２月采自中国南海大鹏湾,大亚湾,香港海域的赤潮有毒甲藻塔玛亚历山大藻８个不同地理株的核糖体小亚基ＲＮＡ基因（Ｓｓ－ｒＤＮＡ）进行分析,并与北美,西欧等地的比较。结果表明,中国南海的塔玛业历山大藻缺少Ｂ基因,这与北美等地的塔玛亚历山大藻（包括有毒和无毒株）不同,而与西欧,澳洲等地的有毒和无毒株相似  相似文献   

自然水样微型藻类遗传多样性的方法学研究   总被引：3，自引：2，他引：3  

邵鹏  袁洁  陈月琴  屈良鹄  黄邦钦 《海洋科学》2002,26(4):1-4

以海洋微型藻类为研究材料，探索和建立了适用于自然水样中低浓度微型藻类遗传多样性研究的分子生物学方法，为进一步开展海洋微型藻类多样性研究提供了新的分析手段。并在此基础上，对厦门西海域真核藻部分种群的结构特点进行了初步分析。  相似文献   

棕囊藻赤潮原因种的分子鉴定和起源分析   总被引：8，自引：1，他引：8  

陈月琴  王宁  周惠  屈良鹄  杨练锋  吕颂辉  齐雨藻 《海洋学报》2002,24(6):99-103

测定了发生于我国东南海域赤潮原因种Phaeocystis sp.及相关种类P.globosa和P.pouchetii 18S rDNA序列,并以Phylip35分析软件构建序列距离矩阵和分子系统发育树图.结果表明,该赤潮原因种与球形棕囊藻P.globosa 18S rDNA序列完全相同,从分子水平鉴定了该原因种为P.globosa.分子系统发育树图表示的P.globosa和P.pouchetii的分化顺序表明,分布于我国东南海域的P.globosa可能是一种本地起源的暖水种.Phaeocystis globosa不同株系的形态差异,可能是适应不同生活环境的结果.根据分子生物学的数据对有害赤潮藻类进行系统发育分析,并设计用于有害赤潮藻快速鉴定的特异性分子探针,对赤潮的监控和防治具有重要意义.  相似文献   

南海赤潮有毒甲藻链状-塔马亚历山大藻的分子鉴定   总被引：7，自引：0，他引：7  

陈月琴  屈良鹄  曾陇梅  齐雨藻  郑磊 《海洋学报》1999,21(3):107-112

以核糖体rDNAITS为分子指标,采用RFLP及序列分析方法对南海海域Alexandriumcatenella和Alexandriumtamarense进行分析和鉴定,并通过与日本海域不同海区A.tenella和A．tamarense的比较,得出A．catenella或A．tamarense的不同地理株的种内个体间ITS区序列非常相似,而种间序列则有显著差异,表明了ITS区用于不同海区A．catenella和A．tamarense种间鉴定是一个较稳定的指标．可看出,ITS区的研究从一个新的角度为海洋微藻种的界定提供了很好的依据．  相似文献   

赤潮铜绿微囊藻rDNA基因间隔区的序列分析以及与淡水微囊藻的比较   总被引：3，自引：0，他引：3  

陈月琴  庄丽  屈良鹄  郑天凌  王大志  王艳丽 《海洋科学》1999,23(1):48-50

采用ＰＣＲ及序列测定 厦门西港海域采集的赤潮铜绿微囊藻１６Ｓ和２３Ｓ ｒＤＮＡ基因间隔区Ｉｎｔｅｒｇｅｎｉｃ Ｓｐａｃｅｒ Ｒｅｇｉｏｎ（ＩＳＲ）区进行了序列测定和分析,并通过与两种淡水微囊藻的比较,找出了其特征性核苷酸作为专一性分子探针设计的靶序列,为该藻种以及微囊藻属的快速鉴定及系统学研究提供了分子基础。  相似文献