黑鲷、真鲷及其杂交子代基因编码区微卫星序列及密码子偏好性分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

曹广勇  张志勇  张志伟  陈淑吟  祝斐  贾超峰  陈自强  曾海峰  汤晓建 《海洋与湖沼》2019,50(5):1108-1115

本研究采用生物信息学方法分析比较了黑鲷、真鲷及其两种杂交子代基因编码区(Coding sequence.CDS)中微卫星序列(简单重复序列.SSR)的分布规律及密码子偏好性。结果表明:(1)黑鲷、真鲷及其两种杂交子代微卫星序列均以三碱基重复类型为主,其次为二碱基重复,片段长度大多数在12—20bp之间。(2)黑鲷与反交(黑鲷♀×真鲷♂)在三、五碱基中优势基元类型相同,真鲷与正交(真鲷♀×黑鲷♂)在三碱基中优势基元类型相同,而黑鲷与正交在四碱基中优势基元类型相同。(3) UUC、UAC等28个密码子为黑鲷、真鲷及其两种杂交子代基因编码区的偏好性密码子,偏爱使用以C或G结尾的密码子,且第三位密码子碱基的GC含量(GC3s)均高于基因编码区平均GC含量。(4)真鲷与正交的密码子使用的偏好性相似,一定程度上说明黑鲷、真鲷杂交子代偏母系遗传。分析结果将为研究鲷科鱼类微卫星标记、研究其群体遗传多样性、构建转基因表达系统和开展分子遗传育种提供理论基础。  相似文献   

巷道浅层破碎围岩锚注加固承载特性试验研究     

潘锐  程桦  王雷  王凤云  蔡毅  曹广勇  张朋  张皓杰 《岩土力学》2020,41(6):1887-1898

为明确巷道浅层破碎围岩锚注加固承载特性，开展了不同岩体粒径、岩性、锚杆数量等因素影响下对比试验。研究结果表明：（1）试件承载能力随粒径增大呈现先增大后减小的趋势，与相同条件下无锚试件相比，含锚试件峰值应力平均提高了53.38%，峰值应变平均减小了46.43%。（2）含锚条件下，与支护面相对的自由面及附近为宏观破裂优先发展区域，支护面破坏一般均滞后于自由面，试件由拉伸破坏为主，逐渐过渡到拉剪混合式破坏；无锚条件下，试件以拉伸破坏为主。（3）锚杆数量增加，试件承载能力逐渐增大，但是增长速率逐渐变缓，峰值应变减缓与峰值应力增长拐点一致。（4）试件具有渐进再破坏的3个特征：一是应力峰值前产生的裂纹在峰后阶段继续扩展；二是支护面表面材料随着裂纹拉伸产生剥落；三是裂纹由表面逐渐向试件内部发展，先是岩块脱落，随后宏观破坏发展到锚杆区域，造成试件整体承载能力丧失。  相似文献