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桡足类是海洋生态系统中初级生产者和较高营养级消费者之间的关键联系环节，掌握桡足类的现场食物组成对于准确评估海洋食物网中的营养关系和能量转移至关重要。本研究中，我们以中华哲水蚤这一在中国、日本以及韩国近海具有重要生态地位的大型哲水蚤属桡足类为研究对象，应用之前开发的基于PCR的克隆技术，通过分析中华哲水蚤所摄食生物的18S rDNA序列，研究了中华哲水蚤的现场食物组成。结果揭示了南黄海（Y19站位）和渤海（B49站位）中华哲水蚤食物组成的多样性。共检测出43个操作分类单元（OTUs），分别隶属于13个类群：硅藻（Bacillariophyta）、甲藻（Dinoflagellata）、硅鞭藻（Dictyochophyceae）、金藻（Chrysophyta）、Katablepharidophyta、浮生藻（Pelagophyceae）、无根虫（Apusozoa）、水螅水母（Hydrozoa）、栉水母（Ctenophora）、棘皮动物（Echinodermata）、被囊动物（Tunicata）、毛颚动物（Chaetognatha）以及海洋真菌。结果还表明，当发生藻类暴发时，中华哲水蚤可以摄食引发藻类暴发的藻种。当周围海域浮游植物的丰度相对较低时，中华哲水蚤可以选择摄食各种后生动物尤其是水螅水母和栉水母的卵、幼虫或者有机碎屑。我们的研究结果表明中华哲水蚤是一种杂食性桡足类，它对食物的选择依赖其生活海域中食物的可获得性。 相似文献
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黄河口邻近水域中华哲水蚤现场食物组成的分子生物学检测 总被引：1，自引：0，他引：1
浮游桡足类是海洋初级生产力和高级营养级之间能量传递的重要中介,对自然海区桡足类食物组成的研究是深入了解其在海洋食物网所处生态地位的关键。然而,由于研究方法的局限,目前很难获取桡足类准确的现场摄食信息。本文用分子生物学方法研究了黄河口邻近水域中华哲水蚤的现场食物组成,对现场采集固定的中华哲水蚤样品进行清洗、去除附肢、镜检等处理,研磨匀浆后提取总基因组DNA。基于对以此DNA为模板扩增出的非桡足类核糖体小亚基基因(non-copepod 18SrDNA)序列的分析,本文共检测出属于8个门的中华哲水蚤的潜在食物种类。研究结果表明,PCR的分子生物学技术在桡足类摄食研究中具有强大的效用,同时,诸多潜在食物类群的发现也意味着利用分子生物学方法对桡足类及其它海洋生物现场食物组成进行深入系统研究,将有利于揭示海洋生态系统结构与功能的真实状态,促进海洋生态系统物质循环和能量流动的研究。 相似文献
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本实验针对两次突发的饲养海月水母(Aureliaaurita)大规模烂洞解体状况,通过对病灶处进行细菌培养,从其中每次发病水母中均各分离到2种优势病原菌菌株,利用PCR扩增和DNA测序技术,获得优势菌株16SrRNA基因序列,通过生物信息比对分析显示,导致两次海月水母发病的病原菌菌株分别为2种嗜冷杆菌(Psychrobacter sp.)和2种弧菌(Vibrio splendidusVibrio neptunius)。通过利用福林酚法进行此四种优势菌株的细菌发酵培养液蛋白酶活性的测定,结果显示,此4种细菌均具有较强的蛋白酶活性。根据实验结果推测,分离所得的2种嗜冷杆菌菌株(Paa1Paa2)和2种弧菌菌株(Vaa1Vaa2)作为此次发病海月水母的病原菌,有可能均是通过分泌胞外蛋白酶侵蚀水母伞体,从而导致伞体烂洞解体。通过本次实验分析,推测自然条件下水母暴发后的快速消亡是由水母自身免疫下降与细菌侵染的共同作用导致。 相似文献
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Copepods are among the most abundant and successful metazoans in the marine ecosystem. However, genomic resources related to fundamental cellular processes are still limited in this particular group of crustaceans. Ribosomal proteins are the building blocks of ribosomes, the primary site for protein synthesis. In this study, we characterized and analyzed the c DNAs of cytoplasmic ribosomal proteins(c RPs) of two calanoid copepods, P seudodiaptomus poplesia and A cartia pacifi ca. We obtained 79 c RP c DNAs from P. poplesia and 67 from A. pacifi ca by c DNA library construction/sequencing and rapid amplifi cation of c DNA ends. Analysis of the nucleic acid composition showed that the copepod c RP-encoding genes had higher GC content in the protein-coding regions(CDSs) than in the untranslated regions(UTRs), and single nucleotide repeats(3 repeats) were common, with "A" repeats being the most frequent, especially in the CDSs. The 3′-UTRs of the c RP genes were signifi cantly longer than the 5′-UTRs. Codon usage analysis showed that the third positions of the codons were dominated by C or G. The deduced amino acid sequences of the c RPs contained high proportions of positively charged residues and had high p I values. This is the fi rst report of a complete set of c RP-encoding genes from copepods. Our results shed light on the characteristics of c RPs in copepods, and provide fundamental data for further studies of protein synthesis in copepods. The copepod c RP information revealed in this study indicates that additional comparisons and analysis should be performed on different taxonomic categories such as orders and families. 相似文献
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