基于SLAF-seq技术的黑棘鲷微卫星标记开发及其在鲷科鱼类中的通用性研究     

吴仁协  肖瑶  牛素芳  翟云  张浩冉  陈伟勇  黎晓 《海洋与湖沼》2019,50(2):365-377

黑棘鲷(Acanthopagrusschlegelii)是广泛分布于西北太平洋的暖温性中下层经济鱼类,也是我国沿海重要的海洋捕捞鱼类和增养殖对象。然而,目前有关黑棘鲷的微卫星标记研究报道较少,难以对其种质资源状况作出精确评估。本研究采用SLAF-seq技术测序共获得22489个二至六碱基重复的黑棘鲷微卫星序列,短重复序列(二、三碱基)占总微卫星序列的90.8%,长重复序列(四至六碱基)占有9.2%。经过157对随机合成引物的多态性筛选,开发出49个高多态性的黑棘鲷微卫星标记,其中短重复序列位点有25个,长重复序列位点有24个。每个位点的等位基因数(Na)为2—20(均值为8.3),观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0.097—0.938和0.122—0.922(均值分别为0.663和0.701),多态信息含量(PIC)为0.118—0.897(均值为0.655)。经Bonferroni校正后,有47个位点符合哈迪-温伯格平衡(HWE),各位点间未检测到连锁不平衡现象,仅2个位点偏离HWE。结果表明,所开发的大部分微卫星标记具有高多态性,蕴含的遗传信息含量较为丰富,能够为黑棘鲷的种群遗传资源评估提供数量充足、类型多样的有效分子标记。跨物种扩增结果显示,有43个黑棘鲷微卫星标记可在9种鲷科鱼类中成功扩增,其中28个标记在太平洋棘鲷(Acanthopagruspacificus)、黄鳍棘鲷(Acanthopagruslatus)和澳洲棘鲷(Acanthopagrusaustralis)中具有较好的通用性,2个标记在平鲷(Rhabdosargussarba)、蓝点赤鲷(Pagruscaeruleostictus)、真赤鲷(Pagrusmajor)、二长棘犁齿鲷(Evynnis cardinalis)及黄牙鲷(Dentex hypselosomus)中具有通用性。这些通用性标记可为阐明鲷科属、种间的系统进化关系和棘鲷属鱼类的群体遗传学分析提供新的标记来源和研究角度。  相似文献   

自动剪断线算法的设计与实现     

李春光  赵怡康 《山东地质》2011,(8):31-34

结合相关几何学原理,阐述了线段之间存在的空间拓扑关系,并结合当前线段相交算法的优缺点,提出了判断线段间有唯一实交点的混合判断方法,并在此基础上完成了对自动剪断线算法的设计与实现。  相似文献   

我国沿海棘头梅童鱼（Collichthys lucidus）群体遗传结构的AFLP分析   总被引：2，自引：0，他引：2       下载免费PDF全文

郑德锋  赵金良  周文玉  严骏骢 《海洋与湖沼》2011,42(3):443-447

利用AFLP技术分析了我国沿海棘头梅童鱼8个地理群体（山东荣成、江苏南通、启东、上海芦潮港、浙江温州、瑞安、福建福州和广州番禺）的遗传结构特征。10对引物组合在8个群体160尾个体中共扩增出272个位点,多态位点72个,多态位点比例为26．47％。8个地理群体的多态位点比例、Nei遗传多样性指数分别为8．82％-15．...  相似文献   

基于卡尔曼滤波的GPS高动态载波跟踪环路设计     

张小军  郭承军  曹建蜀 《测绘科学》2015,40(3):21-25

针对高动态环境会使接收机接收信号载频上产生很大的多普勒频移及其变化率,普通的GPS载波跟踪环无法保证可靠的跟踪等问题,通过综合分析传统的二阶叉积自动频率控制环(CPAFC)辅助三阶锁相环(PLL)的高动态载波跟踪环路,以及卡尔曼滤波器在动态跟踪中的优势与劣势,该文设计了一种基于卡尔曼滤波的二阶CPAFC辅助三阶PLL的GPS高动态载波跟踪环路。通过仿真分析证明,新的环路能更好地适应动态性,整体跟踪性能更好;并且在信噪比较低的情况下,环路优势更明显。  相似文献   

氨氮急性攻毒对水产经济动物棘胸蛙(Paa spinosa)蝌蚪死亡率、排氨率、耗氧率及窒息点的影响     

牛春格  杨程  申屠琰  郑晓静  王志铮 《海洋与湖沼》2019,50(1):188-196

以体长(1.932±0.204)cm、体质量(1.386±0.055)g的棘胸蛙蝌蚪为实验动物,在水温(24±0.2)℃、DO(7.30±0.01)mg/L、pH 7.30±0.01条件下,采用静水停食法开展了氨氮对蝌蚪的急性攻毒实验,并以此为基础,测定了不同氨氮质量浓度胁迫下棘胸蛙蝌蚪的排氨率、耗氧率、氧氮比及窒息点。结果表明:(1)蝌蚪对氨氮急性攻毒具明显的运动避毒行为,濒死个体的背部皮肤和肝脏均具明显的色变症状;(2)氨氮对蝌蚪的急性致死率具明显的剂量—时间效应,24h、48h、72h、96h LC50依次为177.5、151.7、148.6和146.8mg/L,毒性时段蓄积程度系数呈持续下降趋势,24—48h、48—72h、72—96h的时段MAC值分别为84.04%、10.1%和5.86%;(3)蝌蚪夜均、昼均、日均及时段排氨率随氨氮质量浓度增加均呈阶梯式下降趋势,其中时段排氨率与对照组均无显著差异的为9.80mg/L实验组,夜均、昼均、日均及时段排氨率与对照组均无显著差异的仅为2.45mg/L实验组(P0.05);(4)氨氮对蝌蚪呼吸耗氧具低毒兴奋效应,其夜均、昼均和日均耗氧率随氨氮质量浓度增加均呈先升后降趋势,峰值氨氮质量浓度范围均为4.90—7.35mg/L(P0.05),与对照组均无显著差异的仅为14.70mg/L实验组(P0.05),窒息点含氧量随氨氮质量浓度增加呈先降后升趋势,谷底出现于4.90mg/L实验组(P0.05),与对照组无显著差异的仅为9.80mg/L实验组(P0.05);(5)实验期间,蝌蚪氧氮比(O:N)波动于18.87—25.34之间,昼均和日均氧氮比(O:N)随氨氮质量浓度增加均依次呈"上升—稳定—下降—再稳定"之趋势,两者的峰值氨氮质量浓度范围分别为4.90—14.70mg/L和4.90—9.80mg/L,夜均氧氮比(O:N)呈先升后降趋势,峰值出现于7.35mg/L实验组(P0.05)。  相似文献   

脂肪水平对厚唇弱棘鯻生长及肠道脂肪酶活性的影响   总被引：1，自引：0，他引：1  

宋理平  韩勃  冒树泉  王爱英  胡斌 《广东海洋大学学报》2010,30(1):13-17

以鱼油为脂肪源,配制成脂肪水平(质量分数,下同)分别为3.1%、5.8%、9.4%、11.9%和15.1%的5种等氮饲料,探讨饲料脂肪水平对初始体重为(4.05±0.11)g的厚唇弱棘鯻(Hephaestus fuliginosus)生长及肠道脂肪酶活性的影响。结果表明,随着饲料脂肪含量提高,实验用鱼脏体比、肥满度及肌肉粗蛋白含量也随着提高,但各组间差异不显著(P>0.05)。饲料脂肪水平从3.1%增加到9.4%,厚唇弱棘鯻的饲料效率呈升高趋势,相对增重率值由76.42%±5.88%升至102.09%±5.31%;而当饲料脂肪水平从9.4%提高至15.1%,饲料效率呈降低趋势(P<0.05),相对增重率值降为70.54%±2.06%。随着饲料脂肪水平提高,厚唇弱棘鯻肝体比、肌肉粗脂肪含量、肠道脂肪酶活性均呈上升趋势,且各组间差异显著(P<0.05)。表明本实验条件下饲料脂肪含量超过9.4%可导致厚唇弱棘鯻生长和饲料利用下降,对其形体特征、肌肉粗脂肪含量以及肠道脂肪酶活性均有显著影响。  相似文献   

出现于南沙海域的黄带棘箱鲀的形态特征     

黄梓荣  梁沛文 《台湾海峡》2012,31(3):437-439,449

2011年4月17日在南沙海域调查时,采集到2尾棘箱鲀属(Kentrocapros)标本,经鉴定为黄带棘箱鲀(Kentrocapros flavofasciantus),标本现保存在南海水产研究所标本馆.标本体长分别为108、135 mm.无鳍棘和腹鳍,背鳍和臀鳍各1个.背鳍鳍条数目为11,胸鳍鳍条数目为12,臀鳍鳍条数目为10,尾鳍鳍条数目为11.体长为体高的2.41～2.57倍,体宽的3.07～3.09倍,头长的3.38～3.48倍,吻长的4.35～4.70倍.头长为眼径的2.22～2.38倍,眼间隔的1.35～1.54倍,鳃孔长度的3.10～3.33倍.除尾柄、胸鳍基部、背鳍基部、臀鳍基部、肛门附近之外,体披硬体甲,体甲刚好在背鳍前方闭合,体甲为6棱形,无刺平滑,从肛门连续沿纵线到胸鳍基部下前方形成裸褶.体侧无侧线.上下颌每侧具8个小柱状切牙.胸鳍最上第一鳍条很短,长度约为第二鳍条的1/6.体为褐黄色,体甲有两条较宽的纵向黄带.唇为褐棕色,牙为红褐色.所有鳍条为黄色或略显褐黄色.  相似文献   

赤潮叉角藻18SrDNA和ITS区序列测定与分析   总被引：20，自引：0，他引：20  

庄丽  陈月琴  李钦亮  屈良鹄 《海洋与湖沼》2001,32(2):148-154

采用PCR及克隆测序的方法，对1998年引发渤海赤潮的叉角藻18SrRNAadldey DNAITS区（Internal Transcribed Spacer Regions)进行了序列测定与分析。并通过因特网从国际分子生物学数据库中获取甲藻另外15个种的18rDNA序列，以Tetrahymena corlissi作为类群，分别采用Neighbor-Joining和Fitch方法构建甲藻较为一致和可靠的进化树图，探讨具有高度多样性和在分类上争议较多的甲藻各类群之间的形态与分子进化关系。结果表明，Prorocentrum(有2个简单的壳板）出现得较早，而大多数多甲藻目（覆盖着多个壳板）、裸甲藻目（大多数不具壳板）和膝沟藻目的成员较晚出现。另外，对叉角藻ITS区的分析表明，ITS区为高变区，是良好的分子标记，可用于叉角藻快速鉴定的专一性核酸分子探针的研制。  相似文献   

光棘球海胆育苗技术的初步研究   总被引：2，自引：1，他引：2  

王波  张建中 《黄渤海海洋》1993,11(2):55-61

  相似文献   

盐度对双棘黄姑鱼仔鱼活力及仔稚鱼生长的影响   总被引：8，自引：0，他引：8  

林向阳  刘伟斌  叶金聪 《台湾海峡》2005,24(3):351-355

分别用不同盐度梯度海水对双棘黄姑鱼仔鱼进行饲养试验。结果表明：盐度为17．0．22．0、27．0．31．0～33．0的4个试验组仔鱼的不投饵存活系数分别为5．38、7.35、6.46、6．18；各盐度组仔稚鱼的生长速度没有显著差异（P〉0．05），各组仔鱼经25d的培养，其平均全长为18．8～19．2mm；盐度22．0及27．0的海水中仔稚鱼呈较高的存活率，各盐度组的平均存活率为36、0％、48．5％、46．7％和39．2％．  相似文献