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1.
吴琪  李莉  张国范 《海洋与湖沼》2011,42(2):251-255
提取巨蛎属中熊本牡蛎、葡萄牙牡蛎和日本巨牡蛎的基因组DNA,应用PCR技术扩增了三种牡蛎的海藻糖凝集素结构域(Fucose binding lectin,F-lectin),结合GenBank中长牡蛎海藻糖凝集素结构域的序列利用邻接法对得到的序列进行了系统进化分析,并利用非同义替换率和同义替换率之间的比值分析了巨蛎属四...  相似文献   
2.
Information on the spatial distribution of soil salinity can be used as guidance in avoiding the continued degradation of land and water resources by better informing policy makers. However, most regional soil-salinity maps are produced through a conventional direct-linking method derived from historic observations. Such maps lack spatial details and are limited in describing the evolution of soil salinization in particular instances. To overcome these limitations, we employed a method that included an integrative hierarchical-sampling strategy(IHSS) and the Soil Land Inference Model(So LIM) to map soil salinity over a regional area. A fuzzy c-means(FCM) classifier is performed to generate three measures, comprising representative grade, representative area, and representative level(membership). IHSS employs these three measures to ascertain how many representative samples are appropriate. Through this synergetic assessment, representative samples are obtained and their soil-salinity values are measured. These samples are input to So LIM, which is constructed based on fuzzy logic, to calculate the soil-forming environmental similarities between representative samples and other locations. Finally, a detailed soil-salinity map is produced through an averaging function that is linearly weighted, which is used to integrate the soil salinity value and soil similarity. This case study, in the Uyghur Autonomous Region of Xinjiang of China, demonstrates that the employed method can produce soil salinity map at a higher level of spatial detail and accuracy. Twenty-three representative points are determined. The results show that 1) the prediction is appropriate in Kuqa Oasis(R2 = 0.70, RPD = 1.55, RMSE = 12.86) and Keriya Oasis(R2 = 0.75, RPD = 1.66, RMSE = 10.92), that in Fubei Oasis(R2 = 0.77, RPD = 2.01, RMSE = 6.32) perform little better than in those two oases, according to the evaluation criterion. 2) Based on all validation samples from three oases, accuracy estimation show the employed method(R2 = 0.74, RPD = 1.67, RMSE = 11.18) performed better than the multiple linear regression model(R2 = 0.60, RPD = 1.47, RMSE = 14.45). 3) The statistical result show that approximately half(48.07%) of the study area has changed to salt-affected soil, mainly distributed in downstream of oases, around lakes, on both sides of rivers and more serious in the southern than the northern Xinjiang. To deal with this issue, a couple of strategies involving soil-salinity monitoring, water management, and plant diversification are proposed, to reduce soil salinization. Finally, this study concludes that the employed method can serve as an alternative model for soil-salinity mapping on a large scale.  相似文献   
3.
陈燕  孙晨 《海洋科学》2020,44(6):148-151
富含半胱氨酸肠蛋白是一种含双锌指结构的小分子蛋白,其在锌离子转运、个体发育、免疫防御以及肿瘤发生等多种生理过程中发挥重要作用。作者主要对富含半胱氨酸肠蛋白的结构特点及其在发育和免疫方面的研究进展进行系统概述,并指出其相关作用机制尚待深入研究。  相似文献   
4.
5.
LIM类同源异形框基因研究进展   总被引:1,自引:0,他引:1  
  相似文献   
6.
PPC(Pre-Peptidase C-terminal)结构域广泛分布于分泌型海洋细菌蛋白酶的C末端,对蛋白酶的分泌,锚定及与底物相互吸附起到重要作用。对PPC结构域序列分析发现,PPC结构域存在两个较为保守序列区,且这两个保守区空间结构为β-折叠。尽管有的PPC结构域序列一致性较低,但不同结构域间存在相同的保守序列,且其三维结构相似。为了进一步对不同来源的PPC结构域的进化关系进行系统研究,本研究选取公开发表的PPC结构域,通过在NCBI数据库中搜索得到61条来自于39个细菌所分泌的不同蛋白酶的PPC的氨基酸序列进行系统发育分析。发现PPC结构域在生物进化过程中序列变异性大,保守性弱。其中,有些细菌PPC结构域可能来源于自身基因重复产生,有些细菌PPC结构域则可能由水平基因转移产生。  相似文献   
7.
为探讨虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)性别决定和雌雄同体形成的分子机制,利用兼并引物,以闭壳肌基因组DNA为实验材料,扩增和克隆了虾夷扇贝Dmrt基因的DM结构域,雌性、雄性和雌雄同体3种性别共获得2个具有不同DM序列的克隆,序列长度均为141bp,分别命名为Py Dmrt3和Py Dmrt4。Py Dmrt3在3种性别类型中均有克隆,而雄性中还克隆出Py Dmrt4。结果表明,在虾夷扇贝不同性别中,Dmrt基因家族的成员可能会有不同;雄性py Dmrt3的DM结构域核苷酸和氨基酸变异频率高,其次是雌雄同体,雌性的较保守,与其他软体动物DM结构域比对,该基因家族在进化上仍然高度保守,由此推测,部分雄性可能是发生了性逆转的雌雄同体,这种较高的变异性可能也是雌雄同体的一个特点,Py Dmrt4可能参与调控雄性性别的形成。  相似文献   
8.
首次在长牡蛎(Crassostrea gigas)中克隆得到一种新的贝壳基质蛋白nacrein-like protein F3的全长c DNA序列。nacrein-like protein F3基因c DNA全长1499bp,其中编码区长度为1242bp,编码一条含413个氨基酸残基的多肽链。氨基酸序列比对和结构域分析均表明其为合浦珠母贝(Pinctada fucata)nacrein的同源蛋白,含有1个保守的α-碳酸酐酶结构域,但由于重复结构域的插入,α-碳酸酐酶结构域被间隔成2个亚结构域。系统进化分析显示nacrein-like protein F3与贻贝(Mytilus californianus)nacrein-like protein进化关系最近。此外,在软体动物中,双壳纲nacrein-like proteins进化速度相对较快,推测与寒武纪时期剧烈的环境变化有关,如影响贝壳形成的海水化学变化。  相似文献   
9.
细菌通过趋化系统感知和响应外界环境变化并进行趋利避害, 因此很多细菌进化出了非常复杂多样的趋化系统以适应不同的生态位。Epsilon-变形菌广泛存在于自然界中, 能适应不同的生态环境, 特别是深海Epsilon-变形菌能适应深海热液口和冷泉等极端环境, 其趋化系统可能有其独特之处。通过BlastP和MIST数据库分析, 我们发现大部分深海Epsilon-变形菌拥有F3类型趋化系统且具有单拷贝的双功能域融合蛋白CheV。此外, 一种特殊结构域CZB (C-terminal Zinc-Binding) 存在于深海Epsilon-变形菌的趋化受体蛋白中, 而且在部分深海Epsilon-变形菌的趋化受体中还发现并鉴定了一种新的结构域CZB-like结构域。文章以Epsilon-变形菌的模式菌株空肠弯曲杆菌(Campylobacter jejuni 81-176)为研究对象, 用细菌双杂交试验证实了CheV能与所有含MA结构域的趋化受体相互作用。用电感耦合等离子体质谱(ICP-Mass)技术证实了CZB-like结构域不能结合Zn离子, 但细菌双杂交试验证实它能介导趋化受体Tlp9与CheV的互作。  相似文献   
10.
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