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1.
生物序列的比对是计算生物学中的1个基本问题.最近有些生物学家给出了RNA二级结构序列的一些3-D和4-D图形表示方法,它们能给出RNA序列的比较直观的表述.文中提出RNA二级结构序列的1种新的图形表示方法.首先依据RNA中碱基分类,将RNA二级结构序列分为8个子序列,并分别对8个子序列建立特征曲线,得到相应的数字指标,构造特征向量,用以进行比对.最后用该方法对9个不同病毒的同一段RNA二级结构序列进行比对以验证其可靠性. 相似文献
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为提升重组位点识别的预测性能,本文提出了一种新的特征提取方法来识别重组位点。分别利用Word2Vec模型编码的3-gram向量和DNA特性获得两组表示DNA序列的新特征,与已有的特征(FastText模型获取)进行组合来表示DNA序列,使用支持向量机为分类算法,在基准数据集上进行5倍交叉验证。研究表明,本文提出的方法在识别重组位点方面获得了93.88%的敏感性、95.08%的特异性、94.54%的准确率和0.890 2的马修斯相关系数,以上指标均优于现有的方法,本文所提出的方法为解决生物学的序列信息提取问题提供了一种新思路。 相似文献
3.
本文通过Stirling数等特殊组合数的概率表示,结合着已有的基本恒等式,演化得到了若干新的关于常见组合变量的恒等式及递推关系,同时对一些已有的组合恒等式及递推关系给出了新的概率的证明。 相似文献
4.
基于氨基酸的物理化学性质,将氨基酸分为4类,疏水,带电荷,有极性,甘氨酸,在此基础上给出DNA序列一种新的图形表示方法:将1列DNA序列表示为二维空间中的3条特征曲线,利用计算C(i,j)矩阵的主特征值,给出DNA序列的3维特征向量,得到相似距离矩阵.最后计算10种不同物种β-球蛋白第一段外显子的欧式空间距离矩阵D(i,j),并利用UPGMA算法给出了这10种不同物种基于这种相似关系的系统发生树. 相似文献
5.
最近提出的DNA四维图形表示是以4种碱基A,T,G,C的3种分类为基础的,这种表示方法给出了DNA序列的几何中心.在几何中心的基础上,通过把不同遗传密码序列划分成具有相同长度的片断,构建1种新的相似性分析方法.对表1所列的11种不同物种的第一类β球蛋白基因序列构建的相似性分析表,阐述这种方法的应用. 相似文献
6.
在Faàdi Bruno公式和Lagrange反演公式的基础上,得到一些有关Bell数和第二类Stirling数的恒等式。 相似文献
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8.
利用算子之间的相互关系将算子g(xΔ)展成3种不同的形式,构造一些级数转化公式,并结合Eulerian多项式简化这些级数转化公式、最后讨论这些级数转化公式在寻找求和公式及组合恒等式证明中的一些应用。 相似文献
9.
利用孙平和王天明给出的错排数的概率表示,得到有关错排数的递推公式新的证明方法,并得到有关错排数的一些新结果. 相似文献
10.
通过改变矩阵元素得到Pascal函数矩阵的一种推广形式Pn[f(t)],运用矩阵相关理论讨论其代数性质及指数展开形式,由Pn[f(t)]的逆给出1个反演关系,借助指数发生函数,得到包含二项式型多项式、Hermite多项式与Euler多项式等的一些组合恒等式;最后,给出了Pn[f(t)]的2种不同形式的推广。 相似文献