| 应用MSAP技术研究扇贝全基因组DNA甲基化水平 |
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| 引用本文： | 吕佳,侯睿,李宁,王宸,张玲玲,胡晓丽,王师,包振民.应用MSAP技术研究扇贝全基因组DNA甲基化水平[J].中国海洋大学学报(自然科学版),2013(10):48-53. |
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| 作者姓名： | 吕佳 侯睿 李宁 王宸 张玲玲 胡晓丽 王师 包振民 |
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| 作者单位： | 中国海洋大学海洋生物遗传育种教育部重点实验室 |
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| 基金项目： | 中央高校基本科研业务费专项;国家科技支撑计划项目(2011BAD13B01);山东省自然科学基金项目(ZR2009DM019);中国海洋大学水生生物种质资源标准化及资源共享项目资助 |
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| 摘 要： | DNA甲基化作为真核生物基因组重要的表观遗传学修饰,对生物体基因的表达有重要的调控作用。为获得扇贝基因组DNA甲基化修饰水平及模式等表观遗传学信息,以栉孔扇贝(Chlamys farreri)、海湾扇贝(Argopecten irradians)、虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)以及本课题组培育的"海大金贝"为材料,建立了甲基化敏感扩增多态性方法(Methylation-sensitive amplified polymorphism,MSAP)的反应体系,利用该方法对其基因组DNA CCGG区域的甲基化水平进行分析。结果表明,本研究筛选得到的引物组合可用于贝类DNA甲基化的研究,在栉孔扇贝、海湾扇贝、普通虾夷扇贝和"海大金贝"的甲基化比例分别为32.08%、25.99%、32.88%和34.97%。几种扇贝基因组CCGG序列中,胞嘧啶的全甲基化率要高于半甲基化率,推测扇贝基因组中主要的甲基化模式是CpG型。通过对"海大金贝"和普通虾夷扇贝闭壳肌甲基化谱进行比较,筛查得到46个差异位点,这些位点可能参与"海大金贝"闭壳肌积累类胡萝卜素的调控。
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| 关 键 词： | 扇贝 DNA甲基化 甲基化敏感扩增多态性 |
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