| 成团泛菌依赖型磷酸甘油酸变位酶基因的克隆、序列分析及产氢中的差异表达 |
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| 引用本文： | 马颖超,朱大玲,王广策.成团泛菌依赖型磷酸甘油酸变位酶基因的克隆、序列分析及产氢中的差异表达[J].海洋科学,2013,37(6):60-65. |
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| 作者姓名： | 马颖超 朱大玲 王广策 |
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| 作者单位： | 1. 天津科技大学 海洋科学与工程学院，天津市海洋资源与化学重点实验室，天津 300457
2. 中国科学院海洋研究所,山东 青岛,266071 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(40906074); 天津市自然科学基金项目(12JCQNJC04300, 12JCZDJC22200, 12JCQNJC04200); 天津科技大学科学基金项目(20100410) |
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| 摘 要： | 为研究高效产氢菌株成团泛菌(Pantoea agglomerans)BH-18中依赖型磷酸甘油酸变位酶(cofactor-dependent phosphoglycerate mutase, dPGM)与产氢之间的关系,本研究根据GenBank上已登录的肠杆菌中编码 dPGM的基因序列设计一对引物,从细菌基因组 DNA中克隆得到编码 dPGM基因的完整开放阅读框,其长度为753 bp,编码250 aa。采用BLAST对其与NCBI GenBank中的核苷酸序列进行比较分析,结果表明该基因保守性相对较高,与肠杆菌科众多菌株中的 dPGM 基因相似性达100%。采用Bioedit和Mega4软件构建NJ系统进化树,结果表明成团泛菌BH-18的dPGM氨基酸序列与Enterobacter asburiae的dPGM聚为一类,而与成团泛菌属中其他菌株的该蛋白关系较远, dPGM的氨基酸序列在属内不保守。最后,根据已获得的基因序列设计引物,采用RT-PCR的方法分析了成团泛菌BH-18产氢过程中dPGM基因的转录情况,结果表明dPGM基因的转录与产氢呈正相关,依赖型磷酸甘油酸变位酶是产氢过程中的关键酶。
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| 关 键 词： | 成团泛菌(Pantoea agglomerans) 依赖型磷酸甘油酸变位酶 基因克隆 序列分析 产氢 |
| 收稿时间： | 2012/10/14 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2013/1/22 0:00:00 |
Clone, sequential analysis and differential expression during the process of hydrogen-production of cofactor-dependent phosphoglycerate mutase (dPGM) gene in Pantoea agglomerans |
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| MA Ying-chao
,
ZHU Da-ling
,
WANG Guang-ce.Clone, sequential analysis and differential expression during the process of hydrogen-production of cofactor-dependent phosphoglycerate mutase (dPGM) gene in Pantoea agglomerans[J].Marine Sciences,2013,37(6):60-65. |
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| Authors: | MA Ying-chao ZHU Da-ling WANG Guang-ce |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Pantoea agglomerans dPGM gene clone sequential analysis hydrogen-production |
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