| 胶州湾浮游桡足类18S核糖体RNA基因(18S rDNA)扩增及序列变异初步研究 |
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| 引用本文： | 门荣新,杨官品,刘永健,管晓菁.胶州湾浮游桡足类18S核糖体RNA基因(18S rDNA)扩增及序列变异初步研究[J].海洋与湖沼,2005,36(1):88-96. |
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| 作者姓名： | 门荣新 杨官品 刘永健 管晓菁 |
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| 作者单位： | 中国海洋大学海洋生命学院,青岛,266003 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目,40176028号。 |
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| 摘 要： | 采用PCR扩增、文库构建、限制性片段长度多态性分析、序列分析和系统学分析等方法，初步研究了夏季胶州湾上层海水浮游桡足类核糖体小亚基RNA基因(18S rDNA)约1．5kb片段的序列变异。从浮游生物混合DNA中选择性扩增桡足类18S rDNA，建立桡足类18S rDNA变异类型文库，并从文库中随机挑选的30个克隆进行分析。结果表明，Vsp Ⅰ限制性内切酶能将这些克隆分成频率分别为0．17、0．23和0．6的3种操作分类单元(OTUs)，遗传多样性指数达到0．95。3条OTU代表克隆序列与甲壳纲桡足亚纲核苷酸差异数在75．4—97．8之间，而与其他亚纲的差异都高于100。3条OTU代表克隆序列均属于桡足亚纲，其中，AY437861和AY437862属于哲水蚤目。3条OTU代表克隆序列可分为2个高变异区和3个相对保守区，其GC％分别为47．37％、48．16％和48．57％。研究结果表明，混合DNA提取方法简单，设计的引物可选择性地扩增浮游桡足类18S rDNA，根据18S rDNA序列序列变异描述浮游桡足类多样性是可行的。研究结果也为在浮游桡足类分类中引入18S rDNA序列奠定了基础。
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| 关 键 词： | 18S核糖体RNA基因 桡足类 序列变异 |
| 收稿时间： | 2003/10/21 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2003年10月21 |
AMPLIFICATION AND VARIATION ANALYSIS OF JIAOZHOU BAY PELAGIC COPEPOD 18S RIBOSOMAL RNA GENE (18S rDNA) |
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| MEN Rong-Xin,YANG Guan-Pin,LIU Yong-Jian and Guan Xiao-Jing.AMPLIFICATION AND VARIATION ANALYSIS OF JIAOZHOU BAY PELAGIC COPEPOD 18S RIBOSOMAL RNA GENE (18S rDNA)[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2005,36(1):88-96. |
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| Authors: | MEN Rong-Xin YANG Guan-Pin LIU Yong-Jian and Guan Xiao-Jing |
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| Institution: | College of Marine Life Sciences, Ocean University of China, Qingdao, 266003;College of Marine Life Sciences, Ocean University of China, Qingdao, 266003;College of Marine Life Sciences, Ocean University of China, Qingdao, 266003;College of Marine Life Sciences, Ocean University of China, Qingdao, 266003 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | 18S ribosomal RNA gene Copepod Sequence variation |
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