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珠江口3种鲸豚的MHC-I基因多态性研究
引用本文:余新建,张西阳,林文治,周蕊莲,吴玉萍.珠江口3种鲸豚的MHC-I基因多态性研究[J].海洋科学,2016,40(10):126-133.
作者姓名:余新建  张西阳  林文治  周蕊莲  吴玉萍
作者单位:南海生物资源开发与利用协同创新中心;广东省海洋资源与近岸工程重点实验室;珠海市海洋生物资源与环境重点实验室;中山大学 海洋科学学院,南海生物资源开发与利用协同创新中心;广东省海洋资源与近岸工程重点实验室;珠海市海洋生物资源与环境重点实验室;中山大学 海洋科学学院,南海生物资源开发与利用协同创新中心;广东省海洋资源与近岸工程重点实验室;珠海市海洋生物资源与环境重点实验室;中山大学 海洋科学学院,南海生物资源开发与利用协同创新中心;广东省海洋资源与近岸工程重点实验室;珠海市海洋生物资源与环境重点实验室;中山大学 海洋科学学院,南海生物资源开发与利用协同创新中心;广东省海洋资源与近岸工程重点实验室;珠海市海洋生物资源与环境重点实验室;中山大学 海洋科学学院
基金项目:国家自然科学基金项目(41276147, 41576128); 农业部中华白海豚保护行动计划(2015); 香港海洋公园保育基金(2013)
摘    要:旨在了解珠江口栖息的中华白海豚(Sousa chinensis)、宽脊江豚(Neophocaena phocaenoides)和点斑原海豚(Stenella attenuate)免疫相关基因MHC-I(Major Histocompatibility Complex)的多态性及其表达情况,以期为这3种鲸豚的保育工作提供基础资料。通过克隆测序的方法,首次证实MHC-I基因在这3种鲸豚体内表达。选择压力分析,表明MHC-I基因在这3种鲸豚中均受到强烈的正选择作用,提示其具有重要的免疫功能。3种鲸豚的MHC-I基因在系统发育树上相互混杂在一起,表明MHC-I基因存在跨物种多态性。结合选择压力分析和跨物种多态性,发现MHC-I基因受到平衡选择作用。珠江口3种鲸豚MHC-I基因多态性可能由平衡选择维持。

关 键 词:鲸豚    MHC(Major  Histocompatibility  Complex)    表达    平衡选择
收稿时间:2016/4/24 0:00:00
修稿时间:2016/8/30 0:00:00

Study of MHC-I polymorphism in three cetaceans from the Pearl River Estuary, China
YU Xin-jian,ZHANG Xi-yang,LIN Wen-zhi,ZHOU Rui-lian and WU Yu-ping.Study of MHC-I polymorphism in three cetaceans from the Pearl River Estuary, China[J].Marine Sciences,2016,40(10):126-133.
Authors:YU Xin-jian  ZHANG Xi-yang  LIN Wen-zhi  ZHOU Rui-lian and WU Yu-ping
Abstract:To gain the basic knowledge about cetacean conservation, we assessed the polymorphism and expression of the immunologic gene MHC-I(Major Histocompatibility Complex class I) in three cetaceans (Sousa chinensis, Neophocaena phocaenoides, and Stenella attenuata) around the Pearl River Estuary. We first confirmed the expression of MHC-I genes in the three cetaceans by cloning and sequencing. After selection pressure analysis, we found that relatively strong positive selections have acted on MHC-I genes in these three cetaceans, suggesting their important immunologic function. Phylogenetic analysis showed that the MHC-I genes of the three cetaceans did not cluster to three branches according to species but were mixed up, which implies the existence of trans-species polymorphism (TSP). Together with the results of selection pressure analysis and TSP, we suggest that intense balancing selection has acted on MHC-I genes in these three cetaceans, which further maintained the polymorphism of MHC-I genes.
Keywords:cetaceans  MHC(Major Histocompatibility Complex)  expression  balancing selection
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