| 西施舌群体遗传结构及分化的RAPD分析 |
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| 引用本文： | 孟学平,王 帅,高如承,申 欣,程汉良,田 美.西施舌群体遗传结构及分化的RAPD分析[J].海洋科学,2011,35(2):6-9. |
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| 作者姓名： | 孟学平 王 帅 高如承 申 欣 程汉良 田 美 |
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| 作者单位： | 1. 淮海工学院海洋学院,江苏连云港,222005
2. 福建师范大学生命科学学院,福建福州,350108 |
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| 基金项目： | 江苏省自然科学基金项目(BK2007066); 国家863 计划项目(2004AA603140); 江苏省海洋生物技术重点建设实验室开放课题(2005HS009, 2009SH13); 江苏省教育厅自然科学基金项目(05SJD240028) |
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| 摘 要： | 采用55个随机引物对西施舌(Coelomactra antiquata)5个群体, 即长乐(CL)、启东(QD)、连云港(LYG)、胶南(JN)和北海(BH)群体进行RAPD 扩增。用PopGen(Version1.32)软件进行遗传多样性分析。结果共筛选出12个重复性好的引物, 得到88条清晰稳定的条带, 扩增片段在100 bp～3 000 bp之间, 其中引物S299扩增的600 bp片段为长乐群体特有。多态位点比例为62.07%～78.26%(JN、LYG、BH、QD、CL群体分别为78.26%、77.05%、72.58%、70.05%、62.07%), Shannon指数为0.210 5～0.312 3。群体间遗传距离为0.068 3～0.223 9,其中长乐群体与其余4个群体间的遗传距离为0.182 7～0.223 9, 4个非长乐群体的遗传距离为0.068 3～0.136 7。群体间遗传分化系数(Fst)为 0.313 01(P<0.05), 表明在整个遗传变异中群体间占31.30%。CL群体与QD, BH, JN, LYG群体间的遗传分化系数(Gst)分别为0.364 9,0.344 8, 0.325 0, 0.309 0;而非长乐群体之间的遗传分化系数为0.148 2～0.240 3;以上数据显示长乐群体遗传分化最大。聚类结果显示, 启东和胶南群体首先聚为一支, 然后与北海群体聚在一起, 再和连云港群体相聚; 而长乐群体则单独形成一支。
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| 关 键 词： | 西施舌(Coelomactra antiquata) 遗传结构 RAPD |
| 收稿时间： | 2009/11/18 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2010/4/13 0:00:00 |
RAPD analysis of genetic structure and differentiation of Coelomactra antiquata |
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| MENG Xue-ping,WANG Shuai,GAO Ru-cheng,SHEN Xin,CHENG Han-liang,TIAN Mei.RAPD analysis of genetic structure and differentiation of Coelomactra antiquata[J].Marine Sciences,2011,35(2):6-9. |
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| Authors: | MENG Xue-ping WANG Shuai GAO Ru-cheng SHEN Xin CHENG Han-liang TIAN Mei |
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| Institution: | MENG Xue-ping1,WANG Shuai2,GAO Ru-cheng2,SHEN Xin1,CHENG Han-liang1,TIAN Mei1(1.Marine School of Huaihai Institute of Technology,Jiangsu Key Laboratory of Marine Biotechnology,Lianyungang 222005,China,2.College of Life Sciences of Fujian Normal University,Fuzhou 350108,China) |
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| Abstract: | The Randomly Amplified Polymorphic DNA(RAPD) technique was applied to assess the genetic variations among five stocks Changle(CL),Qidong(QD),Lianyungang(LYG),Shandong(JN) and Guangxi(BH)] of Coelomactra antiquata using 55 random primers.Genetic diversity was analyzed with PopGen(Version 1.31) software.A total of 12 highly reproducible primers and 88 clear and stable bands were obtained.The lengths of amplified fragments were from 100 bp to 3000 bp.The primer S299,which amplified 600 bp fragment,was specifi... |
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| Keywords: | Coelomactra antiquata: genetic structure: RAPD |
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