| 基于全基因组重测序对ARTP诱变的一株高产淀粉酶韩国普李斯特氏菌的关键基因研究 |
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| 引用本文： | 何伟,王灵,刘景川,黄仕新,李菁菁,黄家琪,龙腾,吴鹏,范坚强,邓小华,陈善义,陈义强,唐旭.基于全基因组重测序对ARTP诱变的一株高产淀粉酶韩国普李斯特氏菌的关键基因研究[J].应用海洋学学报,2024,43(1):171-182. |
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| 作者姓名： | 何伟 王灵 刘景川 黄仕新 李菁菁 黄家琪 龙腾 吴鹏 范坚强 邓小华 陈善义 陈义强 唐旭 |
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| 作者单位： | 福建中烟工业有限责任公司技术中心，福建 厦门 361021;自然资源部第三海洋研究所，福建 厦门 361005;龙岩烟草工业有限责任公司，福建 龙岩 364320;福建省海洋碳汇重点实验室，厦门大学，福建 厦门361102 |
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| 基金项目： | 福建中烟技术开发合作项目 (FJZYHZJH2020006)；国家自然科学基金(42188102)；福建省海洋碳汇重点实验室（厦门大学）开放基金课题（FKLMCS2023006，FKLMCS2023005）；厦门市海洋发展局青年科技创新项目（23YYZP010QCA18） |
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| 摘 要： | 为提高一株海洋来源的韩国普李斯特氏菌（Priestia koreensis FS 1）产淀粉酶的能力，对该株菌采用常压室温等离子体（atmospheric and room temperature plasma, ARTP）技术进行了诱变选育。结果显示：经过诱变选育后得到一株产淀粉酶活力较原始菌株提高了90%且稳定遗传的突变菌株P. koreensis FS 103。为解析该突变菌株酶活力增加的分子机制，对突变菌株P. koreensis FS 103进行了全基因组重测序及比对分析研究。相关分析显示：首先，P.koreensis FS 103的基因组中乙酰化修饰、抗氧化作用以及同义突变相关的基因发生了遗传变异；其次，对COG（clusters of orthologous groups）功能和变异基因进行富集分析，P. koreensis FS 103转录、翻译和翻译后修饰过程相关基因均上调。经过ARTP诱变以后的突变菌株P. koreensis FS 103淀粉酶活力提升的原因是以上功能基因发生上调效应。
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| 关 键 词： | 海洋生物学 常压室温等离子体（ARTP） 韩国普李斯特氏菌 淀粉酶 全基因组重测序 |
A study on key gene in an efficient amylase production strain of Priestia koreensis by ARTP mutation based on whole genome resequencing |
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| HE Wei,WANG Ling,LIU Jingchuan,HUANG Shixin,LI Jingjing,HUANG Jiaqi,LONG Teng,WU Peng,FAN Jianqiang,DENG Xiaohu,CHEN Shanyi,CHEN Yiqiang,TANG Xu.A study on key gene in an efficient amylase production strain of Priestia koreensis by ARTP mutation based on whole genome resequencing[J].Journal of Applied of Oceanography,2024,43(1):171-182. |
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| Authors: | HE Wei WANG Ling LIU Jingchuan HUANG Shixin LI Jingjing HUANG Jiaqi LONG Teng WU Peng FAN Jianqiang DENG Xiaohu CHEN Shanyi CHEN Yiqiang TANG Xu |
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| Institution: | Technology Center, China Tobacco Fujian Industrial Co., Ltd., Xiamen 361021, China;Third Institute of Oceanography, MNR, Xiamen 361005, China;China Tobacco Longyan Industrial Co., Ltd., Longyan 364320, China;Fujian Key Laboratory of Marine Carbon Sequestration, Xiamen University, Xiamen 361102, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | marine biology ARTP Priestia koreensis amylase whole genome resequencing |
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