马氏珠母贝Perlucin基因序列特征及其SNP与耐低温性状的关系 |
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引用本文: | 王成,赖卓欣,宋欣霖,钟如卓,郑哲,王庆恒.马氏珠母贝Perlucin基因序列特征及其SNP与耐低温性状的关系[J].广东海洋大学学报,2024(1):55-63. |
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作者姓名: | 王成 赖卓欣 宋欣霖 钟如卓 郑哲 王庆恒 |
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作者单位: | 1. 广东海洋大学水产学院;2. 广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心;4. 广东省水产动物病害防控与健康养殖重点实验室 |
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基金项目: | 广东省自然科学基金(2023A1515030048);;湛江市科技计划(2022A01010); |
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摘 要: | 【目的】克隆马氏珠母贝(Pinctada fucata martensii)新的凝集素分子基因,命名为Perlucin,研究在低温胁迫下马氏珠母贝Perlucin的表达以及与抗低温性状相关的单核苷酸多态性(SNP)位点。【方法】根据马氏珠母贝基因组中Perlucin基因序列设计引物,克隆Perlucin基因全长;用生物信息学方法分析Perlucin的结构和理化特征;设计17和22℃(对照)2个温度组,对马氏珠母贝进行低温胁迫实验,用实时荧光定量PCR检测低温胁迫下Perlucin表达量的变化;筛选和比较分析马氏珠母贝耐低温选育系(R)F3和北部湾野生群体(W)的Perlucin外显子区的SNP位点和单倍型。【结果】马氏珠母贝Perlucin全长631 bp,编码152个氨基酸;包含1个信号肽和1个C型凝集素结构域。同源分析表明,马氏珠母贝Perlucin与紫贻贝(Mytilus galloprovincialis)Perlucin的亲缘性最近。Perlucin在鳃中表达量最高,其次为足和肝胰腺。低温胁迫时,鳃组织中Perlucin基因在17℃低温组的表达量呈先升高后降低的趋势,在12 ...
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关 键 词: | 马氏珠母贝 Perlucin 基因克隆 低温胁迫 SNP |
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