| 中国明对虾核糖体ITS1序列分析及其在对虾科系统分析中的应用 |
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| 引用本文： | 李玉龙,孔晓瑜,时伟,张艳春.中国明对虾核糖体ITS1序列分析及其在对虾科系统分析中的应用[J].中国海洋大学学报(自然科学版),2010,40(3). |
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| 作者姓名： | 李玉龙 孔晓瑜 时伟 张艳春 |
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| 作者单位： | 1. 中国海洋大学水产学院,教育部海水养殖重点实验室,山东,青岛,266003
2. 中国科学院南海海洋研究所,广东,广州,510301 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划项目 |
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| 摘 要： | 对采自不同群体的5个中国明对虾个体的核糖体RNA转录单元内间隔区1(ITS1)序列特点进行分析,并利用GeneBank数据库中已有的对虾科(Penaeidae)ITS1同源序列对对虾科虾类进行系统分析,探讨ITS1序列在对虾科系统及演化中的应用.结果表明,中国明对虾ITS1序列在个体间和个体内都表现出长度多态性,序列长度范围为637～652 bp,这种长度多态性主要是由于微卫星DNA简单重复序列的重复次数不同所造成.在中国明对虾ITS1序列中发现8个微卫星位点,根据目前已知的12种对虾的ITS1序列,发现某些微卫星位点只存于1种对虾中,如(CAGC)_(2-4)只存在于中国明对虾中,(CGGA)_(4-9)只存在于斑节对虾中,(GCGA)_4只存在于短沟对虾中.利用ITS1序列对12种对虾进行的系统分析表明,12种对虾分为4个类群,同种的不同个体,同属的不同种各自聚支,与形态分类比较吻合.对虾科属间遗传距离范围为0.313～0.977,平均值为0.633,远高于用线粒体基因片段得出的属间的遗传距离,支持将原对虾属的6个亚属提升为属的观点.
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| 关 键 词： | 中国明对虾 对虾科 长度多态性 系统发生关系 |
The First Ribosomal Internal Transcribed Spacer of Fenneropenaeus chinensis and Its Applicability as a Marker for Phylogenetic Analysis |
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| LI Yu-Long,KONG Xiao-Yu,SHI Wei,ZHANG Yan-Chun.The First Ribosomal Internal Transcribed Spacer of Fenneropenaeus chinensis and Its Applicability as a Marker for Phylogenetic Analysis[J].Periodical of Ocean University of China,2010,40(3). |
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| Authors: | LI Yu-Long KONG Xiao-Yu SHI Wei ZHANG Yan-Chun |
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| Institution: | LI+Yu-Long1,KONG+Xiao-Yu2,SHI+Wei1,ZHANG+Yan-Chun1(1.The+Key+Laboratory+of+Mariculture,Ministry+of+Education,College+of+Fisheries,Ocean+University+of+China,Qingdao+266003,China,2.South+China+Sea+Institute+of+Oceanology,Chinese+Academy+of+Sciences,Guangzhou+510301,China) |
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| Abstract: | The ribosomal DNA internal transcribed spacer 1(ITS1) of Fenneropenaeus chinensis was cloned and sequenced.The objective of the present study was to estimate phylogenies and explore the feasibility of using ITS1 as a molecular marker for studying the interspecific and intraspecific genetic variations among penaeid shrimps.Inter-and intraindividual polymorphisms of ITS1 were clearly observed in F.chinensis.The length of the ITS1 ranged from 637 to 652 bp,with a GC content of 66.9%.Repeats of microsatellite l... |
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| Keywords: | ITS1 Fenneropenaeus chinensis penaeidae ITS1 length variation phylogenetic relationship |
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