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| 南极衣藻chlamydomonas sp. ICE-L硝酸还原酶基因的生物信息学分析 | |
| 引用本文： | 林敏卓,刘晨临,黄晓航,杨平平.南极衣藻chlamydomonas sp. ICE-L硝酸还原酶基因的生物信息学分析[J].海洋科学进展,2012,30(4). |
| 作者姓名： | 林敏卓 刘晨临 黄晓航 杨平平 |
| 作者单位： | 1. 山东轻工业学院食品与生物工程学院,山东济南250353;国家海洋局第一海洋研究所,山东青岛266061;国家海洋局海洋生物活性物质重点实验室,山东青岛266061 2. 国家海洋局第一海洋研究所,山东青岛266061;国家海洋局海洋生物活性物质重点实验室,山东青岛266061 3. 山东轻工业学院食品与生物工程学院,山东济南,250353 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目——南极衣藻在冰冻、高盐下的基因转录谱分析 |
| 摘 要： | 硝酸还原酶(NR)除调节植物的氮代谢外,在植物的各种非生物胁迫的适应过程中也发挥着重要的作用.从南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L的cDNA文库中筛选到了硝酸还原酶的全长基因,对其进行测序并对其编码的蛋白序列进行了生物信息学分析,构建了NR的系统进化树,通过多序列比对探讨了可能与该酶逆境适应性相关的活性位点,并对该蛋白进行了三级结构预测分析.结果显示,NR基因的编码区长2 589 bp,编码863个氨基酸.在以氨基酸序列构建的系统进化树中,南极衣藻的NR序列和其他绿藻类的聚在一起,与团藻、莱茵衣藻、杜氏盐藻和小球藻的同源性依次分别为63％,61％,60％和54％.蛋白质功能预测分析显示,该NR基因含有与高等植物NR相类似的3个不同的功能结构域.对南极冰藻NR基因的生物信息学分析研究,将有助于从硝酸还原酶角度了解南极衣藻对极端环境的适应性,拓展并深化其适应机制的研究. |
| 关 键 词： | 南极衣藻Chlamydomonas sp.ICE-L 硝酸还原酶 基因特征 逆境适应性 |
Bioinformatic Analysis of the Nitrate Reductase Gene in Antartic Ice Algae Chlamydomonas sp. ICE-L |
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| LIN Min-zhuo , LIU Chen-lin , HUANG Xiao-hang , YANG Ping-ping.Bioinformatic Analysis of the Nitrate Reductase Gene in Antartic Ice Algae Chlamydomonas sp. ICE-L[J].Advances in Marine Science,2012,30(4). | |
| Authors: | LIN Min-zhuo LIU Chen-lin HUANG Xiao-hang YANG Ping-ping |
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| Keywords: | |
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