| 盐地碱蓬AGO蛋白基因家族的分离及表达分析 |
| |
| 引用本文： | 王 闻,范士亮,李 晋,高 伟,金玉休,郑明刚,郑 立.盐地碱蓬AGO蛋白基因家族的分离及表达分析[J].海洋科学进展,2019,37(2):306-314. |
| |
| 作者姓名： | 王 闻 范士亮 李 晋 高 伟 金玉休 郑明刚 郑 立 |
| |
| 作者单位： | 青岛大学 环境科学与工程学院,山东 青岛 266071;自然资源部 第一海洋研究所,山东 青岛 266061;自然资源部 第一海洋研究所,山东 青岛,266061;盘锦鸳鸯沟国家级海洋公园管理办公室,辽宁 盘锦,124000 |
| |
| 基金项目： | 海洋公益性行业科研专项;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项;蓬莱北戴河滨海湿地生态修复项目 |
| |
| 摘 要： | AGO蛋白(Argonature protein)作为RNA诱导沉默复合物的核心元件,在植物的非生物胁迫过程中发挥着重要作用。以前期获得的盐地碱蓬转录组数据为基础,开展了针对盐地碱蓬(Suaeda salsa)AGO蛋白的生物信息学及盐胁迫下的表达规律研究。采用RACE技术克隆2个AGO基因家族成员(SsAGO1、SsAGO16)的cDNA全长序列,并对其蛋白结构、进化关系、表达模式等进行分析。结果表明:盐地碱蓬2类AGO蛋白家族成员基因长度分别为3 212 bp和3 766 bp,编码的蛋白均是一个无跨膜结构域、无信号肽的亲水性蛋白,α-螺旋散布于每个蛋白质的整体结构中;SsAGO1和SsAGO16都含有一个未知的结构域DUF1785,除此之外,SsAGO1还含有PAZ和PIWI两个特征结构域,而SsAGO16仅含有PIWI结构域,SsAGO1和SsAGO16亲缘关系较远,且具有不同的时空表达模式。首次从盐地碱蓬鉴定了AGO蛋白基因并进行了盐胁迫下的表达规律分析,为研究AGO蛋白家族在盐生植物耐盐生理过程中的作用奠定了基础。
|
| 关 键 词： | 盐地碱蓬 Argonaute蛋白 功能预测 表达模式 |
Isolation and Expression Analysis of Argonaute Genes From Suaeda salsa |
| |
| WANG Wen,FAN Shi-liang,LI Jin,GAO Wei,JIN Yu-xiu,ZHENG Ming-gang,ZHENG Li.Isolation and Expression Analysis of Argonaute Genes From Suaeda salsa[J].Advances in Marine Science,2019,37(2):306-314. |
| |
| Authors: | WANG Wen FAN Shi-liang LI Jin GAO Wei JIN Yu-xiu ZHENG Ming-gang ZHENG Li |
| |
| Institution: | (College of Environmental Science and Engineering, Qingdao University , Qingdao 266071, China;First Institute of Oceanography , MNR , Qingdao 266061, China;The National Ocean Park Management Office of Yuanyanggou , Panjin 124000, China) |
| |
| Abstract: | WANG Wen;FAN Shi-liang;LI Jin;GAO Wei;JIN Yu-xiu;ZHENG Ming-gang;ZHENG Li(College of Environmental Science and Engineering, Qingdao University , Qingdao 266071, China;First Institute of Oceanography , MNR , Qingdao 266061, China;The National Ocean Park Management Office of Yuanyanggou , Panjin 124000, China) |
| |
| Keywords: | Suaeda salsa Argonaute protein functional prediction expression pattern |
| 本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《海洋科学进展》浏览原始摘要信息 |
| 点击此处可从《海洋科学进展》下载免费的PDF全文 |
|
