| 溶藻弧菌双组分调控系统PhoR/PhoB的基因克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 张燕飞,;庞欢瑛,;吴灶和,;简纪常,;鲁义善.溶藻弧菌双组分调控系统PhoR/PhoB的基因克隆及生物信息学分析[J].湛江海洋大学学报,2014(6):22-30. |
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| 作者姓名： | 张燕飞 ;庞欢瑛 ;吴灶和 ;简纪常 ;鲁义善 |
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| 作者单位： | [1]广东海洋大学水产学院,广东湛江524088; [2]广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室,广东湛江524088; [3]广东省水产经济动物病害控制重点实验室,广东湛江524088; [4]仲恺农业工程学院,广东广州510225 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑项项目（2012BAD17B02、2012BAD17B03）;广东高校国际合作创新平台项目（2013gjhz0008） |
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| 摘 要： | 双组分调控系统（Two-component Regulatory System）在致病菌的生长及毒力调控中起重要作用.克隆溶藻弧菌（Vibrio alginolyticus）HY9901 株组氨酸激酶PhoR 和反应调控因子PhoB 的全长基因,并对其进行生物信息学分析.序列分析结果显示,phoR（GenBank 登录号：KJ958404）全长1 299 bp,共编码432 个氨基酸;phoB（GenBank 登录号：KJ863646）全长690 bp,编码229 个氨基酸.构建PhoR/PhoB 的系统进化树,结果显示,溶藻弧菌PhoR/PhoB 与副溶血弧菌（Vibrio parahaemolyticus）、哈氏弧菌（Vibrio harveyi）有较近亲缘关系.利用SWISS-MODEL 软件,对PhoR/PhoB 中两个相对保守的功能域HATPase_c 和REC 进行同源建模,发现HATPase_c具有1 个ATP 结合位点,REC 具有4 个天冬氨酸活性位点.
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| 关 键 词： | 溶藻弧菌 双组分调控系统 PhoR/PhoB 基因克隆 生物信息学 |
Molecular Cloning and Bioinformatics Analysis of Two-componentRegulation System PhoR/PhoB from Vibrio alginolyticus HY9901 |
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| Institution: | ZHANG Yan-fei, PANG Huan-ying, WU Zao-he, JIAN Ji-chang, LU Yi-shan(1. Fisheries College, Guangdong Ocean University // 2. Guangdong Provincial key Laboratory ofPathogenic Biology and Epidemiology for Aquatic Economic Animals // 3. Key Laboratory of Controlfor Disease of Aquatic Animals of Guangdong Higher Education Institutes, Zhanjiang 524088, China;4. Zhongkai university of Agriculture and Engineering, Guangzhou 510225, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Vibrio alginolyticus Two-component regulation system PhoR/PhoB Gene cloning Bioinformatics analysis |
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