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霸王基因组RAPD优化条件的建立
引用本文:郝瑞文,景建洲,李振勇,贾敬芬.霸王基因组RAPD优化条件的建立[J].中国沙漠,2006,26(2):286-290.
作者姓名:郝瑞文  景建洲  李振勇  贾敬芬
作者单位:1. 西北大学,生命科学学院,陕西,西安,710069
2. 华美生物工程公司博士后工作站,河南,洛阳,471003
基金项目:陕西省自然科学基金;湖北省教育厅科研项目
摘    要: 实验以霸王20 d龄无菌籽苗为材料,使用CTAB法提取其基因组DNA,进行RAPD条件优化分析。通过单因子实验分别研究了Mg2+浓度、dNTPS浓度、Taq酶的浓度、引物浓度和模板DNA浓度对RAPD反应的影响,即在25 μL总反应体系中,Mg2+的适宜浓度为1.5~2.5 mmol\5L-1、dNTPs的适宜浓度为0.2~0.3 mmol\5L-1、随机引物的浓度以1.2 μmol\5L-1为宜、Taq酶的用量以2.0 U为佳、模板DNA的最适用量为50 ng。本研究的PCR扩增程序为94℃预变性8 min, 94℃变性1 min, 37℃退火1 min, 72℃延伸2 min,设40个循环,最后72℃保温6 min。

关 键 词:霸王  RAPD  PCR  条件优化
文章编号:1000-694X(2006)02-0286-05
收稿时间:2004-11-22
修稿时间:2005-01-24

Optimization of RAPD Analytic Conditions on Genomic DNA of Sarcozygium xanthoxylon
HAO Rui-wen,JING Jian-zhou,LI Zhen-yong,JIA Jing-fen.Optimization of RAPD Analytic Conditions on Genomic DNA of Sarcozygium xanthoxylon[J].Journal of Desert Research,2006,26(2):286-290.
Authors:HAO Rui-wen  JING Jian-zhou  LI Zhen-yong  JIA Jing-fen
Institution:1.College of Life Sciences, Northwest University, Xian 710069, China; 2.Postdoctoral Programme, Sino-American Biotechnology Company, Luoyang 471003, Henan, China
Abstract:Sarcozygium xanthoxylon Maxim genomic DNA, extracted from its sterile 20 days old seedlings by CTAB method, was used as RAPD amplification template. The effects of main elements, including concentration of Mg2+, dNTPs, DNA, primer and Taq polymerase dosage on RAPD amplification were studied through single factor experiment. A following efficient protocol for optimal reaction system of RAPD analysis in Sarcozygium xanthoxylon Maxim was established , i.e , the 25 μL reaction mixture contained 1.5~2.5 mmol·L-1 Mg2+, 0.2~0.3 mmol·L-1 of each dNTPs, 1.2 μmol·L-1 arbitrary primer, 2.0 U Taq polymerase, 50 ng template DNA . The amplification was performed as follows: 94℃ pre-denaturation for 8 min, 40 cycles of 94℃ for 1 min, 37℃ for 1 min, 72℃ for 2 min, and 72℃ extension for 6 min.
Keywords:RAPD  PCR
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