| 黄鳍棘鲷微卫星标记开发及其在鲷科鱼类中的跨物种扩增 |
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| 引用本文： | 吴仁协,翟云,肖瑶,牛素芳,张浩冉,黎晓,陈伟勇.黄鳍棘鲷微卫星标记开发及其在鲷科鱼类中的跨物种扩增[J].应用海洋学学报,2019,38(3):356-364. |
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| 作者姓名： | 吴仁协 翟云 肖瑶 牛素芳 张浩冉 黎晓 陈伟勇 |
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| 作者单位： | 广东海洋大学水产学院,广东 湛江 524088,广东海洋大学水产学院,广东 湛江 524089,广东海洋大学水产学院,广东 湛江 524090,广东海洋大学水产学院,广东 湛江 524091,广东海洋大学水产学院,广东 湛江 524092,广东海洋大学水产学院,广东 湛江 524093,广东海洋大学水产学院,广东 湛江 524094 |
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| 基金项目： | 公益性行业(农业)科研专项资助项目(201403008)；广东省科技计划资助项目(2017A030303077)；广东省海洋和渔业发展专项(科技攻关与研发)资助项目(A201708D07); 国家自然科学基金资助项目(31372532) |
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| 摘 要： | 采用基于高通量测序平台的SLAF-seq技术,开发出47个高多态性的黄鳍棘鲷(Acanthopagrus latus)微卫星标记,其中二碱基重复位点17个,三至六碱基重复位点30个。各位点的等位基因数为2～27(均值为10),观测杂合度(Ho)和期望杂合度(He)分别为0. 156～0. 938(均值为0. 682)和0. 177～0. 963(均值为0. 741),多态信息含量(PIC)为0. 166～0. 946(均值为0. 705)。经Bonferroni校正后,有43个位点符合哈迪-温伯格平衡(HWE),其余4个位点偏离HWE。这些多态性微卫星标记为黄鳍棘鲷遗传资源研究提供新的有效分子标记。跨物种扩增结果显示,共有31个黄鳍棘鲷微卫星标记可在9种鲷科鱼类中成功扩增。其中17个标记在太平洋棘鲷(Acanthopagrus pacificus)、黑棘鲷(Acanthopagrus schlegelii)和澳洲棘鲷(Acanthopagrus australis)中具有较好的通用性,这些标记可为棘鲷属(Acanthopagrus)的系统进化和种群遗传学分析提供新的标记来源;另有3个标记在二长棘梨齿鲷(Evynnis cardinalis)、真赤鲷(Pagrus major)、蓝点赤鲷(Pagrus caeruleostictus)及黄牙鲷(Dentex hypselosomus)中具有通用性。
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| 关 键 词： | 海洋生物学 黄鳍棘鲷 微卫星标记 SLAF-seq技术 跨物种扩增 |
Microsatellite marker development for Acanthopagrus latus and cross species amplification in the family Sparidae |
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| Institution: | College of Fisheries, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524088, China,College of Fisheries, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524088, China,College of Fisheries, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524088, China,College of Fisheries, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524088, China,College of Fisheries, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524088, China,College of Fisheries, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524088, China and College of Fisheries, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524088, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | marine biology Acanthopagrus latus microsatellite marker SLAF-seq technology cross species amplification |
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