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基于氨基酸的理化性质和位置信息的蛋白质序列相似性分析方法
摘 要:
本文提出了一个新的蛋白质序列相似性分析方法。将蛋白质序列中的每一个氨基酸都看成一个质点,基于氨基酸的理化性质和位置信息,用转动惯量来刻画蛋白质序列的特征,使每条蛋白质序列唯一对应到一个特征向量上,并用欧式距离作为蛋白质序列间的相似性度量。将本文的方法应用到不同的数据集上,实验结果与已知的进化关系相一致,验证了本文方法的有效性。
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