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荣成湾孔鳐群体线粒体DNA cytb部分序列的遗传多样性分析
引用本文:刘梦侠,王丽娟,孔令怡,刘洪军,吴志昊,辛梦娇,张 伟,尤 锋.荣成湾孔鳐群体线粒体DNA cytb部分序列的遗传多样性分析[J].海洋科学,2012,36(10):85-92.
作者姓名:刘梦侠  王丽娟  孔令怡  刘洪军  吴志昊  辛梦娇  张 伟  尤 锋
作者单位:1. 山东海水养殖研究所, 山东 青岛 266002
2. 中国科学院 海洋研究所, 山东 青岛 266071
3. 中国海洋大学 海洋生命学院, 山东 青岛 266003
基金项目:国家海洋公益性行业科研专项(200805069)
摘    要:对2009 年和2011 年采自荣成湾的孔鳐(Raja porosa)群体共54 尾鱼的线粒体DNA 细胞色素b基因(cytb)部分序列进行测定, 以分析其遗传多样性和群体遗传结构。结果显示, 在所获得的782 bp 序列中, 共检测到11 个单倍型、15 个多态位点, 其单倍型多样性指数(H)为0.498±0.081, 核苷酸多样性指数(π)为0.0018±0.0005, 遗传多样性水平较低。其中, 2009 年样品检测到3 种单倍型、4 个单一变异位点, 其H 和π 值分别为0.378±0.181 和0.0010±0.0006; 2011 年样品检测到9 种单倍型、6 个单一变异位点和6 个简约信息位点, 其H 和π 值分别为0.352±0.086 和0.0020±0.0006。分子方差分析(AMOVA)分析显示它们的遗传变异主要集中在同年度个体间(98.22%), 而不同年度个体间的遗传变异远远小于同年度内个体间的变异。Kimura’s 2-parameter 模型分析得到的2009, 2011 年度孔鳐间的遗传距离为0.0013, 遗传分化系数为0.01778, 也表明2009 年和2011 年孔鳐的遗传分化程度低, 没有明显的遗传变异。中性检验表明, 荣成湾孔鳐群体可能发生过种群扩张。

关 键 词:孔鳐(Raja  porosa)    荣成湾    细胞色素b基因(cytb)部分序列    群体遗传多样性
收稿时间:2012/5/17 0:00:00
修稿时间:2012/8/21 0:00:00

Genetic diversity analysis of partial sequences of mtDNA cytb in Raja porosa stock of the Rongcheng Bay
Abstract:
Keywords:Raja porosa  the Rongcheng Bay  cytochrome b gene (cytb) partial sequence  population genetic diversity
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