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白令海北部表层沉积物中细菌多样性的研究
引用本文:邹扬,曾胤新,田蕴,郑天凌.白令海北部表层沉积物中细菌多样性的研究[J].极地研究,2009,21(1):15-24.
作者姓名:邹扬  曾胤新  田蕴  郑天凌
作者单位:厦门大学生命科学学院; 滨海湿地生态系统教育部重点实验室; 厦门大学; 近海海洋环境科学国家重点实验室; 中国极地研究中心; 国家海洋局极地科学重点实验室
基金项目:国家自然科学基金,国际极地年中国行动计划,教育部长江学者和创新团队发展计划 
摘    要:提取白令海表层沉积物样品总DNA,构建沉积物中的细菌16SrDNA文库,通过RFLP酶切分型与序列测定,进行沉积物中的细菌多样性及系统发育分析。结果表明,该沉积物中细菌多样性丰富,获得的125条序列归属于10个细菌类群,包括占据优势地位的变形细菌(Pro-teobacteria,49.6%)、酸杆菌门(Acidobacteria,20.8%),以及拟杆菌门(Bacteroidetes,6.4%)、放线菌门(Actinobacteria,5.6%)、浮霉菌门(Planctomycetes,5.6%)、硝化螺旋菌门(Nitrospirae,4%)、疣微菌门(Verrucomicrobia,2.4%)、绿弯菌门(Chloroflexi,1.6%)、纤维杆菌门(Fibrobacteres,0.8%)、螺旋体(Spirochaetes,0.8%)。此外,还有一部分分类地位尚不明确的细菌(2.4%)。而在变形细菌中,δ、γ亚群为其中的优势类群。

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INVESTIGATION OF BACTERIAL DIVERSITY IN SURFACE SEDIMENT FROM THE NORTHERN BERING SEA
Zou Yang,Zeng Yinxin,Tian Yun,Zheng Tianling.INVESTIGATION OF BACTERIAL DIVERSITY IN SURFACE SEDIMENT FROM THE NORTHERN BERING SEA[J].Chinese Journal of Polar Research,2009,21(1):15-24.
Authors:Zou Yang  Zeng Yinxin  Tian Yun  Zheng Tianling
Institution:1.Key Laboratory of Ministry of Education for Coastal and Wetland Ecosystem; School of Life Sciences; Xiamen University; Xiamen 361005; China;2.Key Laboratory for Polar Science of State Oceanic Administration; Polar Research Institute of China; Shanghai 200136;3.State Key Laboratory of Marine Environmental Science; China
Abstract:Biodiversity of bacteria in the top layer of the sediment from Northern Bering Sea was studied by a combination of RFLP and 16S rDNA analysis. Phylogenetic analysis showed that bacterial community composition of the sediment had a high diversity. 124 clones from the 16S rDNA library fell into ten bacterial groups,including Proteobacteria (49.6%),Acidobacteria (20.8%),Bacteroidetes (6.4%),Actinobacteria (5.6%),Planctomycetes (5.6%),Nitrospirae (4%),Verrucomicrobia (2.4%),Chloroflexi (1.6%),Fibrobacteres (0.8...
Keywords:Northern Bering Sea  sediments  bacteria  diversity  
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