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牛山湖浮游生物群落DNA指纹结构与理化因子的关系
引用本文:吴利,余育和,张堂林,冯伟松,颜庆云,龚迎春,宋晓红.牛山湖浮游生物群落DNA指纹结构与理化因子的关系[J].湖泊科学,2008,20(2):235-241.
作者姓名:吴利  余育和  张堂林  冯伟松  颜庆云  龚迎春  宋晓红
作者单位:1. 中国科学院水生生物研究所,武汉,430072;中国科学院研究生院,北京,100049
2. 中国科学院水生生物研究所,武汉,430072
基金项目:国家自然科学基金 , 国家重点基础研究发展计划(973计划)
摘    要:对牛山湖5个站点的浮游生物群落DNA多态性进行了RAPD指纹和PCR-DGGE指纹分析,并探讨了其与理化因子的关系.结果如下:1)从40条随机引物中筛选出9条引物,共获得93条谱带,多态率为58%;各站点所得谱带平均为67条,其中I站最少,为61条,V站最多,为74条;2)PCR-DGGE指纹图谱共含102条谱带,其中原核生物56条,真核生物46条,谱带总数以Ⅲ站、Ⅳ站和V站较多,Ⅰ站和Ⅱ站较少;3)Ⅱ站的总磷、叶绿素、化学耗氧量、硬度及电导率最高;各站点间溶氧和pH差异较小.相似性聚类分析表明,浮游生物群落DNA指纹将5个站点划分为两支,Ⅰ站和Ⅱ站聚为一支,Ⅲ站、Ⅳ站和V站聚为另一支,理化因子将Ⅰ站、Ⅲ站、Ⅳ站和V站聚为一支,Ⅱ站单独聚为一支.研究表明牛山湖浮游生物群落DNA指纹结构与理化因子具有一定的相关性,并且与环境主要限制因子总磷的含量是密切相关的.因此,浮游生物群落级水平DNA分析能简便、准确、迅速地反映水质状况,这方面资料的积累可以为建立一种基于分子生物学简便而灵敏的水环境评价体系提供科学依据.

关 键 词:浮游生物  RAPD  PCR-DGGE  DNA指纹  理化因子  牛山湖
收稿时间:2007-05-16
修稿时间:2007-08-22

Relationship between DNA fingerprinting structure of plankton community and physicochemical factors in Lake Niushan
WU Li,YU Yuhe,ZHANG Tanglin,FENG Weisong,YAN Qingyun,GONG Yingchun and SONG Xiaohong.Relationship between DNA fingerprinting structure of plankton community and physicochemical factors in Lake Niushan[J].Journal of Lake Science,2008,20(2):235-241.
Authors:WU Li  YU Yuhe  ZHANG Tanglin  FENG Weisong  YAN Qingyun  GONG Yingchun and SONG Xiaohong
Institution:WU Li~,YU Yuhe~,ZHANG Tanglin~1,FENG Weisong~1,YAN Qingyun& SONG Xiaohong~
Abstract:Plankton are considered good indicators of water quality because they are highly sensitive to the environmental variation in their short life spans.However,traditional studies on plankton community constructure have depended on taxonomic identification which has historically been a difficult task.Recently,different fingerprinting techniques have been developed and applied successfully to analyze the community structure of bacterial and picoplankton.However,little is known to the whole plankton community.In ...
Keywords:Plankton  RAPD  PCR-DGGE  DNA fingerprinting  physico-chemical factors  Lake Niushan
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