| 湖泊微生物宏基因组学研究进展 |
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| 引用本文： | 罗建桦,陶晔,邢鹏,吴庆龙.湖泊微生物宏基因组学研究进展[J].湖泊科学,2020,32(1):271-280. |
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| 作者姓名： | 罗建桦 陶晔 邢鹏 吴庆龙 |
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| 作者单位： | 中国科学院南京地理与湖泊研究所,湖泊与环境国家重点实验室,南京210008;中国科学院大学中丹学院,北京100049;中国科学院南京地理与湖泊研究所,湖泊与环境国家重点实验室,南京210008;中国科学院大学,北京100049;中国科学院南京地理与湖泊研究所,湖泊与环境国家重点实验室,南京210008 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31722008，91751111）和中国科学院青年创新促进会项目（2014273）联合资助. |
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| 摘 要： | 湖泊微生物作为湖泊生态系统重要组成部分,在局域和区域的元素循环中发挥着关键作用.由于自然环境中微生物之间的复杂关系和对微生物认知的片面性,可在实验室培养的湖泊微生物比例不足1%.近10年来,宏基因组学技术在微生物生态学研究中得到了广泛应用,不仅扩展了对湖泊微生物群落组成和多样性的认识,更揭示了湖泊微生物的功能多样性和微生物之间的相互作用.特别是基于宏基因组数据的分装(Binning)手段,可以获取大量湖泊中未培养微生物的基因组信息,用于后续的比较基因组、生态进化和培养组学等研究.随着宏基因组学相关学科和技术的不断发展,其将在湖泊微生物生态学基础理论研究和环境生物监测应用中发挥更为重要的作用,成为人类了解湖泊生态系统功能和维持机制的有力工具.
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| 关 键 词： | 湖泊微生物 宏基因组学 生态基因组学 数据分装 宏基因组拼接基因组 功能 |
| 收稿时间： | 2019/4/24 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2019/6/17 0:00:00 |
Mini-review: Advances of metagenomics research for lake microbiomes |
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| LUO Jianhu,TAO Ye,XING Peng and WU Qinglong.Mini-review: Advances of metagenomics research for lake microbiomes[J].Journal of Lake Science,2020,32(1):271-280. |
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| Authors: | LUO Jianhu TAO Ye XING Peng and WU Qinglong |
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| Institution: | State Key Laboratory of Lake Science and Environment, Nanjing Institute of Geography and Limnology, Chinese Academy of Sciences, Nanjing 210008, P. R. China;Sino-Danish College, University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, P. R. China,State Key Laboratory of Lake Science and Environment, Nanjing Institute of Geography and Limnology, Chinese Academy of Sciences, Nanjing 210008, P. R. China;University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, P. R. China,State Key Laboratory of Lake Science and Environment, Nanjing Institute of Geography and Limnology, Chinese Academy of Sciences, Nanjing 210008, P. R. China and State Key Laboratory of Lake Science and Environment, Nanjing Institute of Geography and Limnology, Chinese Academy of Sciences, Nanjing 210008, P. R. China;Sino-Danish College, University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, P. R. China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Lake microbiomes metagenomics ecological genomics binning Metagenome-assembled genomes (MAGs) function |
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