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翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)EST-SSR标记与生长性状相关性及4个选育群体遗传结构研究
引用本文:袁文成,叶金明,黄鹤忠,肖攀,路瑶,李泽,朱传坤.翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)EST-SSR标记与生长性状相关性及4个选育群体遗传结构研究[J].海洋与湖沼,2018,49(1):224-231.
作者姓名:袁文成  叶金明  黄鹤忠  肖攀  路瑶  李泽  朱传坤
作者单位:苏州大学基础医学与生物科学学院 苏州大学水产研究所 苏州 215123,扬州市水产生产技术指导站 扬州 225007,苏州大学基础医学与生物科学学院 苏州大学水产研究所 苏州 215123;江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心 淮安 223300,苏州大学基础医学与生物科学学院 苏州大学水产研究所 苏州 215123,苏州大学基础医学与生物科学学院 苏州大学水产研究所 苏州 215123,苏州大学基础医学与生物科学学院 苏州大学水产研究所 苏州 215123,江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心 淮安 223300
基金项目:江苏省水产三新工程项目,D2015-15号;江苏省科技计划现代农业重点项目,BE2017311号;江苏省区域现代农业与环境保护协同创新项目,48SKY00号;江苏省渔业科技项目,Y2017-38号;苏州市科技计划农业应用基础研究项目,SNG201608号。
摘    要:采用翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)转录组高通量测序并筛选得到的13对多态性EST-SSR引物,对60尾翘嘴鳜的体长、体高、体厚及体重4种生长性状进行标记-性状相关性研究,并对4个翘嘴鳜选育群体各30尾个体进行遗传结构分析。结果显示,与其生长性状显著相关的微卫星分子标记有5个,包括:分别与体厚和体长极显著相关(P0.01)和显著相关(P0.05)的标记C10127,AA型为体长、体厚的优势基因型,而AC型为劣势基因型;与体重显著相关(P0.05)的标记C19016,AA型为体重的优势基因型,AB型为体长的劣势基因型;与体厚显著相关(P0.05)的标记C14847,BB型为体厚的优势基因型;分别与体长、体高和体重、体厚极显著相关(P0.01)和显著相关(P0.05)的标记C12350,BC型为体长、体厚、体高和体重性状的优势基因型;分别与体厚、体重和体高极显著相关(P0.01)和显著相关(P0.05)的C18691标记,BB型为体厚、体重和体高性状的优势基因型。4个翘嘴鳜群体遗传多样性高低依次为太湖选育群体长江口选育群体洪泽湖选育群体鄱阳湖选育群体,其平均的等位基因数、有效等位基因数、观测杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别为2.2115、1.9405、0.55513、0.5925和0.3775,属于中度多态水平。

关 键 词:翘嘴鳜  EST-SSR标记  生长性状  遗传结构  相关性分析
收稿时间:2017/10/10 0:00:00
修稿时间:2017/11/9 0:00:00

STUDY ON CORRELATION OF EST-SSR MARKERS WITH GROWTH TRAITS AND GENETIC STRUCTURE OF 4 BREEDING POPULATIONS IN MANDARIN FISH SINIPERCA CHUATSI
YUAN Wen-Cheng,YE Jin-Ming,HUANG He-Zhong,XIAO Pan,LU Yao,LI Ze and ZHU Chuan-Kun.STUDY ON CORRELATION OF EST-SSR MARKERS WITH GROWTH TRAITS AND GENETIC STRUCTURE OF 4 BREEDING POPULATIONS IN MANDARIN FISH SINIPERCA CHUATSI[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2018,49(1):224-231.
Authors:YUAN Wen-Cheng  YE Jin-Ming  HUANG He-Zhong  XIAO Pan  LU Yao  LI Ze and ZHU Chuan-Kun
Institution:School of Medicine and Life Sciences, Medical College of Soochow University, Fisheries Research Institute of Soochow University, Suzhou 215123, China,Aquatic Products Production Technical Guidance Station of Yangzhou City, Yangzhou 225007, China,School of Medicine and Life Sciences, Medical College of Soochow University, Fisheries Research Institute of Soochow University, Suzhou 215123, China;Jiangsu Collaborative Innovation Center of Regional Modern Agriculture & Environmental Protection, Huai''an 223300, China,School of Medicine and Life Sciences, Medical College of Soochow University, Fisheries Research Institute of Soochow University, Suzhou 215123, China,School of Medicine and Life Sciences, Medical College of Soochow University, Fisheries Research Institute of Soochow University, Suzhou 215123, China,School of Medicine and Life Sciences, Medical College of Soochow University, Fisheries Research Institute of Soochow University, Suzhou 215123, China and Jiangsu Collaborative Innovation Center of Regional Modern Agriculture & Environmental Protection, Huai''an 223300, China
Abstract:
Keywords:Siniperca chuatsi  EST-SSR marker  growth trait  genetic structure  correlation analysis
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