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浙江新昌光唇鱼(Acrossocheilus)CO Ⅱ和D-loop基因克隆及系统发育分析
引用本文:潘娜,苗亮,李明云,郭晓飞,赵亮,陈炯,张玉明,吕益龙.浙江新昌光唇鱼(Acrossocheilus)CO Ⅱ和D-loop基因克隆及系统发育分析[J].海洋与湖沼,2015,46(2):381-388.
作者姓名:潘娜  苗亮  李明云  郭晓飞  赵亮  陈炯  张玉明  吕益龙
作者单位:1. 宁波大学应用海洋生物技术教育部重点实验室 宁波315211
2. 浙江新昌水利水电局 新昌 312500
基金项目:国家星火计划项目,2011GA701001号;浙江省科技厅重大科技专项遗传育种项目,2012C12907号;浙江省海洋与渔业项目,浙海渔计[2012]83号。
摘    要:采用扩增COⅡ、D-loop序列、进行序列比对和系统树分析并结合形态特征观察的方法,研究了浙江新昌光唇鱼(Acrossocheilus)的系统分类和种类鉴定。形态特征结果表明,新昌光唇鱼具有光唇鱼属鱼类的基本特征;扩增得到COⅡ序列全长691bp,D-loop序列全长931—944bp,A+T含量两基因序列都高于G+C(A+T的含量分别为57.30%—57.80%和65.30%—65.90%),G的含量在四种碱基中最低;COⅡ序列有6个碱基位点存在转换,而D-loop则存在多个碱基的转换、颠换、缺失或插入位点。浙江新昌光唇鱼群体内COⅡ、D-loop基因的平均遗传距离分别为0.003、0.005;基于COⅡ和D-loop序列构建的NJ法系统树均显示新昌光唇鱼与温州光唇鱼(A.wenchowensis)形成一个紧密的簇,序列相似性分别为99.94%和99.36%,遗传距离分别为0.000、0.011,未达到种间分化水平(遗传距离大于0.05),表明新昌光唇鱼与温州光唇鱼为同一种,且根据形态特征可以断定为二个不同的地理群体,而D-loop序列因进化速度较快更适于光唇鱼属种内及近缘物种的种间亲缘关系的研究。研究结果既有助于新昌光唇鱼资源的开发利用,又可为研究光唇鱼类的分类提供参考资料。

关 键 词:光唇鱼  COⅡ基因  D-loop基因  序列分析  系统发育分析
收稿时间:9/1/2014 12:00:00 AM
修稿时间:2014/10/12 0:00:00

MITOCHONDRIAL COⅡ AND D-LOOP CLONING AND THE PHYLOGENETIC POSITION OF ACROSSOCHEILUS FISH FROM XINCHANG IN ZHEJIANG PROVINCE
PAN N,MIAO Liang,LI Ming-Yun,GUO Xiao-Fei,ZHAO Liang,CHEN Jiong,ZHANG Yu-Ming and LV Yi-Long.MITOCHONDRIAL COⅡ AND D-LOOP CLONING AND THE PHYLOGENETIC POSITION OF ACROSSOCHEILUS FISH FROM XINCHANG IN ZHEJIANG PROVINCE[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2015,46(2):381-388.
Authors:PAN N  MIAO Liang  LI Ming-Yun  GUO Xiao-Fei  ZHAO Liang  CHEN Jiong  ZHANG Yu-Ming and LV Yi-Long
Institution:Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology, Ministry of Education, Ningbo University, Ningbo 315211, China,Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology, Ministry of Education, Ningbo University, Ningbo 315211, China,Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology, Ministry of Education, Ningbo University, Ningbo 315211, China,Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology, Ministry of Education, Ningbo University, Ningbo 315211, China,Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology, Ministry of Education, Ningbo University, Ningbo 315211, China,Key Laboratory of Applied Marine Biotechnology, Ministry of Education, Ningbo University, Ningbo 315211, China,The Water Conservancy Bureau of Xinchang County, Xinchang 312500, China and The Water Conservancy Bureau of Xinchang County, Xinchang 312500, China
Abstract:
Keywords:Acrossocheilus  COⅡ  D-loop  sequence analysis  phylogenetic analysis
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