| 条斑紫菜Tubulin和Kinesin基因家族鉴定及失水胁迫表达模式分析 |
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| 引用本文： | 崔正彩,孔凡娜,茅云翔,孙斌,王俊皓,董道英.条斑紫菜Tubulin和Kinesin基因家族鉴定及失水胁迫表达模式分析[J].海洋与湖沼,2021,52(3):673-684. |
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| 作者姓名： | 崔正彩 孔凡娜 茅云翔 孙斌 王俊皓 董道英 |
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| 作者单位： | 中国海洋大学海洋生命学院 海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室 青岛 266003;中国海洋大学海洋生命学院 海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室 青岛 266003;海南热带海洋学院水产与生命学院 热带海洋生物资源利用与保护教育部重点实验室 三亚 572022 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，41976146号，31672641号。 |
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| 摘 要： | 微管是细胞骨架的主要成分,其结构及动力学机制对提高生物体耐受性具有重要作用。微管网络如何通过结构的动态变化调控适应环境变化已成为胁迫生物学领域的研究热点之一。条斑紫菜(Pyropiayezoensis)能够适应潮间带复杂多变的环境,是研究潮间带大型海藻抗逆机制的良好材料。目前对紫菜微管相关基因家族构成及其生物学功能的研究较少。本研究利用生物信息学方法,在条斑紫菜基因组中共鉴定出4个Tubulin基因(Pyα-tubulin 1、Pyα-tubulin 2、Pyβ-tubulin和Pyγ-tubulin)和11个Kinesin基因(PyKinesin1—PyKinesin11),并对其理化性质、基因结构、蛋白特征、染色体定位、系统进化和失水胁迫下的表达模式进行了系统分析。结果显示:条斑紫菜中有3种微管蛋白(Tubulin)亚型;该家族成员散布于1号和2号染色体上, Pyα-tubulin 1和Pyα-tubulin 2为串联重复基因;PyTubulin家族成员在基因结构和蛋白特征方面均较为保守,且在转录水平对失水胁迫不敏感。条斑紫菜中有5种驱动蛋白(Kinesin)亚型,亚家族种类和基因数量均少于高等植物;该家族基因散布于1号、2号和3号染色体上,无串联重复基因; PyKinesin家族成员在基因结构和蛋白特征方面存在一定差异,PyKinesin1在中高度失水胁迫下表达量显著上调。本研究为进一步理解Tubulin和Kinesin基因家族的进化和功能、解析微管在条斑紫菜响应失水胁迫中的作用奠定了基础。
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| 关 键 词： | 条斑紫菜 Tubulin Kinesin 基因家族 失水胁迫 |
| 收稿时间： | 2020/6/21 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2020/7/19 0:00:00 |
IDENTIFICATION AND EXPRESSION PATTERN ANALYSIS OF TUBULIN AND KINESIN GENE FAMILY IN PYROPIA YEZOENSIS TO DEHYDRATION STRESSES |
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| CUI Zheng-Cai,KONG Fan-N,MAO Yun-Xiang,SUN Bin,WANG Jun-Hao,DONG Dao-Ying.IDENTIFICATION AND EXPRESSION PATTERN ANALYSIS OF TUBULIN AND KINESIN GENE FAMILY IN PYROPIA YEZOENSIS TO DEHYDRATION STRESSES[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2021,52(3):673-684. |
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| Authors: | CUI Zheng-Cai KONG Fan-N MAO Yun-Xiang SUN Bin WANG Jun-Hao DONG Dao-Ying |
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| Institution: | The Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding, Ministry of Education, Ocean University of China, Qingdao 266003, China;The Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding, Ministry of Education, Ocean University of China, Qingdao 266003, China;Key Laboratory of Utilization and Conservation of Tropical Marine Bioresource (Ministry of Education), College of Fisheries and Life Science, Hainan Tropical Ocean University, Sanya 572022, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Pyropia yezoensis Tubulin Kinesin gene family dehydration stress |
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