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副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)诱导拟穴青蟹(Scylla paramamosain)血淋巴cDNA 文库构建及表达序列标签初步分析
引用本文:蔡小辉,彭银辉,赵 鹏,宋忠魁,张 琴,黄国强.副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)诱导拟穴青蟹(Scylla paramamosain)血淋巴cDNA 文库构建及表达序列标签初步分析[J].海洋与湖沼,2013,44(3):684-690.
作者姓名:蔡小辉  彭银辉  赵 鹏  宋忠魁  张 琴  黄国强
作者单位:广西海洋研究所 广西海洋生物技术重点实验室 北海 536000
基金项目:广西自然科学基金资助项目, 2010GXNSFA013079 号, 2012GXNSFAA053065 号; 广西科技攻关资助项目, 1114012-11 号; 南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室开放课题, 2011003 号; 国家海洋公益资助项目, 201205028-4 号。
摘    要:利用SMART技术构建副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)诱导的拟穴青蟹(Scylla paramamosain)血淋巴cDNA文库。结果表明,该文库的滴度为1.04×107CFU/mL,文库总容量达1.144×107CFU,克隆子插入片段大小为500—2000bp,重组率达98%。将随机挑选的300个阳性克隆测序,经过质量控制和拼接,共得到141个单基因组簇(UniGenes),75个UniGenes与NCBI非冗余蛋白质数据库中登录的蛋白质序列存在显著相似性,其中20个与免疫防御相关,如kazal-like丝氨酸蛋白酶抑制剂类蛋白、kazal-type蛋白酶抑制剂arasin-like蛋白、抗内毒素因子、抗微生肽、金属硫蛋白、铁蛋白、类70kD热休克蛋白等,达总测序数的6.67%。研究结果证实,构建cDNA文库是获得拟穴青蟹免疫相关基因的可靠途径。

关 键 词:拟穴青蟹  副溶血弧菌  cDNA文库  表达序列标签
收稿时间:2012/5/26 0:00:00
修稿时间:2012/7/30 0:00:00

CONSTRUCTION OF HAEMOLYMPH cDNA LIBRARY OF SCYLLA PARAMAMOSAIN INDUCED BY VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS AND ANALYSIS OF EXPRESSED SEQUENCE TAGs
CAI Xiao-Hui,PENG Yin-Hui,ZHAO Peng,SONG Zhong-Kui,ZHANG Qin and HUANG Guo-Qiang.CONSTRUCTION OF HAEMOLYMPH cDNA LIBRARY OF SCYLLA PARAMAMOSAIN INDUCED BY VIBRIO PARAHAEMOLYTICUS AND ANALYSIS OF EXPRESSED SEQUENCE TAGs[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2013,44(3):684-690.
Authors:CAI Xiao-Hui  PENG Yin-Hui  ZHAO Peng  SONG Zhong-Kui  ZHANG Qin and HUANG Guo-Qiang
Institution:Guangxi Institute of Oceanology, Key Laboratory of MarineBiotechnology of Guangxi;Guangxi Institute of Oceanology, Key Laboratory of MarineBiotechnology of Guangxi;Guangxi Institute of Oceanology, Key Laboratory of MarineBiotechnology of Guangxi;Guangxi Institute of Oceanology, Key Laboratory of MarineBiotechnology of Guangxi;Guangxi Institute of Oceanology, Key Laboratory of MarineBiotechnology of Guangxi;Guangxi Institute of Oceanology, Key Laboratory of MarineBiotechnology of Guangxi
Abstract:
Keywords:Scylla paramamosain    Vibrio parahaemolyticus  cDNA library  Expressed sequence tags
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