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南移养殖的刺参(Apostichopus japonicus)cDNA文库的构建及原肌球蛋白基因的研究
引用本文:崔 静,李太武,苏秀榕,李 晔,徐 静,周 君,应 琪,王中华,李松伟.南移养殖的刺参(Apostichopus japonicus)cDNA文库的构建及原肌球蛋白基因的研究[J].海洋与湖沼,2010,41(6):850-856.
作者姓名:崔 静  李太武  苏秀榕  李 晔  徐 静  周 君  应 琪  王中华  李松伟
作者单位:1. 宁波大学生命科学与生物工程学院,宁波,315211
2. 宁波城市职业技术学院,宁波,315100
3. 温州职业技术学院,温州,325035
基金项目:国家农业科技成果转化资金, 2007GB2C220359 号; 浙江省重大科技专项(优先主题)重大农业项目, 2008C02009-Ⅱ-2 号; 宁波市农业科技成果转化资金, 2007C30001 号
摘    要:以南移养殖的刺参为实验材料,采用非均一化的Oliga-dT引物定向克隆技术构建了南移刺参混合组织的cDNA文库。对文库质量的分析结果表明,cDNA文库的库容量为2.2×107cfu,重组率达95.8%,平均插入片段长度750bp左右。挑取cDNA克隆进行5’端测序,成功测序185个反应,分析得到136个单基因簇(Unigene),其中包括40个重叠群(Contigs)、96个单拷贝EST(Singletons)。结果表明,克隆南移养殖的刺参原肌球蛋白(tropomyosin,Trp)cDNA全长序列为1112bp,ORF编码284个氨基酸,其预测蛋白的分子量为33.27kDa,等电点为4.56。该氨基酸序列与紫石海胆、南极大磷虾、锯缘青蟹、文昌鱼、河蟹、家蚕同源性分别为62%、51%、46%、49%、47%、46%。

关 键 词:刺参    cDNA  文库    基因克隆    原肌球蛋白基因
收稿时间:2009/12/29 0:00:00

CONSTRUCTION OF cDNA LIBRARY WITH APOSTICHOPUS JAPONICUS CULTURED IN THE SOUTH AND SEQUENCE ANALYSIS OF ITS TROPOMYOSIN GENE
CUI Jing,LI Tai-Wu,SU Xiu-Rong,LI Ye,XU Jing,ZHOU Jun,YING Qi,WANG Zhong-Hua and LI Song-Wei.CONSTRUCTION OF cDNA LIBRARY WITH APOSTICHOPUS JAPONICUS CULTURED IN THE SOUTH AND SEQUENCE ANALYSIS OF ITS TROPOMYOSIN GENE[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2010,41(6):850-856.
Authors:CUI Jing  LI Tai-Wu  SU Xiu-Rong  LI Ye  XU Jing  ZHOU Jun  YING Qi  WANG Zhong-Hua and LI Song-Wei
Institution:Faculty of Life Science and Biotechnology, Ningbo University;Ningbo City College of Vocational Technology;Faculty of Life Science and Biotechnology, Ningbo University;Faculty of Life Science and Biotechnology, Ningbo University;Wenzhou Vocational & Technology College;Faculty of Life Science and Biotechnology, Ningbo University;Faculty of Life Science and Biotechnology, Ningbo University;Faculty of Life Science and Biotechnology, Ningbo University;Faculty of Life Science and Biotechnology, Ningbo University
Abstract:
Keywords:Apostichopus japonicus    cDNA library    Gene cloning    Tropomyosin gene
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