| 串珠藻目植物rbcL基因的适应性进化分析 |
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| 引用本文： | 巩超彦,南芳茹,冯佳,吕俊平,刘琪,谢树莲.串珠藻目植物rbcL基因的适应性进化分析[J].海洋与湖沼,2017,48(3):527-535. |
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| 作者姓名： | 巩超彦 南芳茹 冯佳 吕俊平 刘琪 谢树莲 |
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| 作者单位： | 山西大学 生命科学学院 太原 030006,山西大学 生命科学学院 太原 030006,山西大学 生命科学学院 太原 030006,山西大学 生命科学学院 太原 030006,山西大学 生命科学学院 太原 030006,山西大学 生命科学学院 太原 030006 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，31670208号，31370239号。 |
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| 摘 要： | 淡水红藻是藻类植物进化中的一个重要类群,其中最主要的类群是串珠藻目。核酮糖1,5二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubisco)是一种既负责碳同化又引发光呼吸,在植物光合作用中起重要作用的酶,其催化固定CO_2的活性中心位于Rubisco大亚基,由叶绿体rbcL基因编码。为了探究串珠藻目植物适应特殊生存环境的分子水平机制,本文选取了串珠藻目及一些相近类群淡水红藻的rbcL基因39条,利用PAML4.8软件,运行位点模型、分支模型及分支-位点模型,对选取类群的rbcL基因进行了适应性进化分析。结果表明:(1)通过最大似然法构建的系统发育树显示,所有内类群聚集为6个分支,其中,分支A为暗紫红毛菜,分支B为胶串珠藻,分支C为扁圆串珠藻,后验概率同样为100%,分支D为熊野藻属,分支E为连珠藻属,分支F为弧形西斯藻;(2)分支-位点模型中,在3个分支中分别鉴定出350S、277L和280L为正选择位点;(3)在构建出的Rubisco大亚基的参考三维模型中,277L和280L位于Rubisco大亚基羧基末端保守的8个α螺旋和8个β片层构成的α/β桶状结构域中第7个α螺旋和第7个β片层之间的loop结构上,350S位于羧基末端邻近α/β桶状结构域的一个α螺旋上。研究结果一方面显示了基于ω比值检验基因适应性进化的准确性和有效性,另一方面也揭示了串珠藻目植物rbcL基因确实发生了适应性进化,对串珠藻目适应特殊生存环境产生了有益的作用。
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| 关 键 词： | 串珠藻目 rbcL基因 适应性进化 |
| 收稿时间： | 2016/12/14 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2017/2/8 0:00:00 |
ADAPTIVE EVOLUTIONARY ANALYSIS ON rbcL GENE OF BATRACHOSPERMALES |
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| GONG Chao-Yan,NAN Fang-Ru,FENG Ji,L&#; Jun-Ping,LIU Qi and XIE Shu-Lian.ADAPTIVE EVOLUTIONARY ANALYSIS ON rbcL GENE OF BATRACHOSPERMALES[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2017,48(3):527-535. |
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| Authors: | GONG Chao-Yan NAN Fang-Ru FENG Ji L&#; Jun-Ping LIU Qi and XIE Shu-Lian |
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| Institution: | School of Life Science, Shanxi University, Taiyuan 030006, China,School of Life Science, Shanxi University, Taiyuan 030006, China,School of Life Science, Shanxi University, Taiyuan 030006, China,School of Life Science, Shanxi University, Taiyuan 030006, China,School of Life Science, Shanxi University, Taiyuan 030006, China and School of Life Science, Shanxi University, Taiyuan 030006, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Batrachospermales rbcL gene adaptive evolution |
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