| 舟山近海环境DNA保存方法的建立及优化 |
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| 引用本文： | 陈治,陈建威,王晓艳,高天翔,刘岩.舟山近海环境DNA保存方法的建立及优化[J].海洋与湖沼,2019,50(5):1098-1107. |
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| 作者姓名： | 陈治 陈建威 王晓艳 高天翔 刘岩 |
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| 作者单位： | 海南热带海洋学院水产与生命学院 三亚572022;青岛华大基因研究院 青岛 266555;浙江海洋大学国家海洋设施养殖工程技术研究中心 舟山 316022;浙江海洋大学水产学院 舟山 316022;中国水产科学研究院南海水产研究所 广州510300 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，41776171号，41806180号；国家自然科学基金委2018年度东海春季共享航次，NORC2018-02号。 |
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| 摘 要： | 近年来,环境DNA(environmentalDNA,eDNA)技术开始被广泛应用于水生生物多样性研究。本文通过绝对定量和高通量测序技术对舟山近海高浊度水样eDNA的保存方法进行了建立和优化。研究结果如下:(1)"酒精+低温"保存法的eDNA获得量是"酒精+常温"保存法的0.78—1.06 (7d)、0.89—1.80 (15d)、1.05—2.75 (30d)和2.69 (60d)倍;(2)酒精保存法(低温、常温)存在eDNA富集物渗漏及滤膜黏附现象;(3)短期内冷冻保存样品的eDNA获得量是酒精保存样品获得量的1.25—1.59倍(7d)和1.07—1.20倍(15d);(4)酒精保存法的eDNA降解速率慢于冷冻保存法,长期内酒精保存样品的eDNA获得量是冷冻保存样品获得量的1.99—2.10倍(30d)和2.84—7.64倍(60d);(5)二次富集(过滤)能显著提高eDNA获得量,富集组eDNA浓度是未富集组浓度的1.60—4.95倍("酒精+低温")和1.21—2.04倍("酒精+常温");(6)"酒精+低温"保存的样品在高通量测序总丰度、各鱼种分丰度、物种多样性指数等多个方面优于冷冻保存样品;(7)微生物(micro-organism)的eDNA降解速率慢于大生物(macro-organism),不同界(Kingdom)的eDNA最优保存方法可能并不相同。本研究首次建立了舟山近海高浊度水样eDNA最适保存方法,为相似水域的eDNA保存提供了借鉴参考。
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| 关 键 词： | 舟山近海 eDNA保存 “酒精+低温” 二次过滤 |
| 收稿时间： | 2019/2/12 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2019/5/23 0:00:00 |
ESTABLISHMENT AND OPTIMIZATION OF THE EDNA PRESERVATION METHOD FOR ZHOUSHAN COASTAL WATERS |
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| CHEN Zhi,CHEN Jian-Wei,WANG Xiao-Yan,GAO Tian-Xiang and LIU Yan.ESTABLISHMENT AND OPTIMIZATION OF THE EDNA PRESERVATION METHOD FOR ZHOUSHAN COASTAL WATERS[J].Oceanologia Et Limnologia Sinica,2019,50(5):1098-1107. |
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| Authors: | CHEN Zhi CHEN Jian-Wei WANG Xiao-Yan GAO Tian-Xiang and LIU Yan |
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| Institution: | College of Fisheries and Life Science, Hainan Tropical Ocean University, Sanya 572022, China,BGI-Qingdao, BGI-Shenzhen, Qingdao 266555, China,National Engineering Research Center of Marine Facilities Aquaculture, Zhejiang Ocean University, Zhoushan 316022, China,Fisheries College, Zhejiang Ocean University, Zhoushan 316022, China and South China Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Guangzhou 510300, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | coastal waters of Zhoushan preservation method of eDNA cold alcohol secondary filtration |
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