| 印度尼西亚Padang Cermin热泉古菌多样性分析 |
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| 引用本文： | 沈继红,宋维志,林学政,王帅,Dewi Seswita Zilda.印度尼西亚Padang Cermin热泉古菌多样性分析[J].海洋科学进展,2012,30(4). |
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| 作者姓名： | 沈继红 宋维志 林学政 王帅 Dewi Seswita Zilda |
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| 作者单位： | 1. 国家海洋局第一海洋研究所,山东青岛266061;国家海洋局海洋生物活性物质重点实验室,山东青岛266061
2. 印度尼西亚海洋与渔业研究局海洋生物技术与水产品加工研究中心,雅加达,999006 |
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| 基金项目： | 中央级公益科研院所基本科研业务费专项资金项目——印尼热泉生态系统微生物多样性及其产嗜热酶研究 |
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| 摘 要： | 通过印度尼西亚苏门答腊岛Padang Cermin热泉环境基因组DNA构建古菌16S rRNA基因文库,并利用PCR-RFLP技术对其古菌多样性和系统发育分析进行了研究.根据限制性内切酶AluⅠ和MspⅠ的特征性酶切图谱,将62个阳性克隆归类为14个分类操作单位(operational taxonomic unit,OTU),文库的覆盖度达90.32％.克隆文库的优势类群为OTU2和OTU1,分别占克隆文库的27.42％和20.96％.从每个OUT中选取一个代表性克隆进行16S rRNA基因的序列测定与系统发育分析,结果表明,测定的Padang Cermin热泉中的古菌均属于泉古菌门,包括热变形菌目(Thermoproteales)、硫还原球菌目(Desulfurococcales)、杂色泉古菌(miscellaneous crenarchaeotic group,MCG)和未培养泉古菌(uncultured Crenarchaeota,UC),该热泉代表性克隆与GenBank数据库已有16S rRNA序列的相似性为91.9％～97.8％,而且与其相似性最高的序列均来自未培养的古菌克隆,由结果可见,Padang Cermin热泉古菌群落与已报道的其他热泉古菌群落的相似性较低,表明该热泉可能具有某些独特的特征,存在着特殊的古菌生态类群.
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| 关 键 词： | 热泉 古菌 多样性 系统发育分析 |
Phylogenetic Diversity of Archaeal Community in the Hot Spring in Padang Cermin, Sumatra, Indonesia |
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| SHEN Ji-hong
,
SONG Wei-zhi
,
LIN Xue-zheng
,
WANG Shuai
,
DEWI Seswita Zilda.Phylogenetic Diversity of Archaeal Community in the Hot Spring in Padang Cermin, Sumatra, Indonesia[J].Advances in Marine Science,2012,30(4). |
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| Authors: | SHEN Ji-hong SONG Wei-zhi LIN Xue-zheng WANG Shuai DEWI Seswita Zilda |
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| Keywords: | |
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