| 深圳杨梅坑海域造礁石珊瑚共生藻分类和遗传多样性研究 |
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| 引用本文： | 陈文静,佟 飞,陈丕茂,朱爱意,张 露,李丹丹,龙鑫玲.深圳杨梅坑海域造礁石珊瑚共生藻分类和遗传多样性研究[J].应用海洋学学报,2019,38(2):284-291. |
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| 作者姓名： | 陈文静 佟 飞 陈丕茂 朱爱意 张 露 李丹丹 龙鑫玲 |
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| 作者单位： | 浙江海洋大学，浙江 舟山 316022；中国水产科学研究院南海水产研究所，广东 广州 510300；中国水产科学研究院南海水产研究所深圳实验基地，广东 深圳 518108,中国水产科学研究院南海水产研究所，广东 广州 510300；中国水产科学研究院南海水产研究所深圳实验基地，广东 深圳 518108,中国水产科学研究院南海水产研究所，广东 广州 510300；中国水产科学研究院南海水产研究所深圳实验基地，广东 深圳 518108,浙江海洋大学，浙江 舟山 316022,中国水产科学研究院南海水产研究所，广东 广州 510300；中国水产科学研究院南海水产研究所深圳实验基地，广东 深圳 518108,浙江海洋大学，浙江 舟山 316022；中国水产科学研究院南海水产研究所，广东 广州 510300；中国水产科学研究院南海水产研究所深圳实验基地，广东 深圳 518108,中国水产科学研究院南海水产研究所深圳实验基地，广东 深圳 518108 |
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| 基金项目： | 深科技创新〔2016〕86号资助项目（JCYJ20160331141759795）；国家海洋公益性行业科研专项经费资助项目（201405020-2） |
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| 摘 要： | 通过核糖体ITS(Internal Transcribed Spacer)的核苷酸序列研究了深圳杨梅坑海域20种47个造礁石珊瑚样本的共生藻。通过ITS序列分析,与GenBank上的4种不同的共生藻构建Neighbor-Joining聚类树,进行石珊瑚共生藻分类和遗传多样性分析。结果表明,该海域的造礁石珊瑚共生藻属于2种不同的种类(亚系群),19个样品属于C1亚系群共生藻,1个样品属于C15亚系群共生藻,C1和C15两个亚系群共生藻之间的遗传距离为0. 01。将深圳杨梅坑海域得到的ITS序列与NCBI数据库上的福建东山海域、广东徐闻地区的C1系共生藻进行比对,只有深圳杨梅坑海域藻类样本平均(A+T)碱基含量为49. 4%,(A+T)含量小于(G+C)含量。构建Neighbor-Joining聚类树表明,深圳杨梅坑海域石珊瑚共生藻与福建东山海域的亲缘关系较近,而与广东徐闻地区的亲缘关系较远,地理隔离是主要的因素。
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| 关 键 词： | 海洋生物学 造礁石珊瑚 共生藻 ITS序列 遗传多样性 深圳杨梅坑海域 |
Classification and genetic diversity analysis of Symbiodinium in scleractinia coral from Yangmeikeng sea area in Shenzhen |
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| CHEN Wen-jing,TONG Fei,CHEN Pi-mao,ZHU Ai-yi,ZHANG Lu,LI Dan-dan and LONG Xin-ling.Classification and genetic diversity analysis of Symbiodinium in scleractinia coral from Yangmeikeng sea area in Shenzhen[J].Journal of Applied of Oceanography,2019,38(2):284-291. |
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| Authors: | CHEN Wen-jing TONG Fei CHEN Pi-mao ZHU Ai-yi ZHANG Lu LI Dan-dan and LONG Xin-ling |
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| Institution: | Zhejing Ocean University, Zhoushan 316022,China; South China Sea Fisheries Research Institute, CAFS, Guangzhou 510300, China; Shenzhen Experimental Base of the South China Sea Fisheries Research Institute, Shenzhen 518108,China,South China Sea Fisheries Research Institute, CAFS, Guangzhou 510300, China; Shenzhen Experimental Base of the South China Sea Fisheries Research Institute, Shenzhen 518108,China,South China Sea Fisheries Research Institute, CAFS, Guangzhou 510300, China; Shenzhen Experimental Base of the South China Sea Fisheries Research Institute, Shenzhen 518108,China,Zhejing Ocean University, Zhoushan 316022,China,South China Sea Fisheries Research Institute, CAFS, Guangzhou 510300, China; Shenzhen Experimental Base of the South China Sea Fisheries Research Institute, Shenzhen 518108,China,Zhejing Ocean University, Zhoushan 316022,China; South China Sea Fisheries Research Institute, CAFS, Guangzhou 510300, China; Shenzhen Experimental Base of the South China Sea Fisheries Research Institute, Shenzhen 518108,China and South China Sea Fisheries Research Institute, CAFS, Guangzhou 510300, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | marine biology scleractinia corals Symbiodinium ITS sequences genetic diversity Yangmeikeng sea area in Shenzhen |
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