| 加权基因共表达网络探究链状亚历山大藻爆发性生长的分子机制 |
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| 引用本文： | 刘源,隋正红,刘昊昕,Sadaf RIAZ.加权基因共表达网络探究链状亚历山大藻爆发性生长的分子机制[J].中国海洋大学学报(自然科学版),2019(9):66-76. |
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| 作者姓名： | 刘源 隋正红 刘昊昕 Sadaf RIAZ |
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| 作者单位： | 中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室;Department |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(41676091;41176098)资助~~ |
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| 摘 要： | 链状亚历山大藻(Alexandrium pacificum)作为典型的产毒赤潮甲藻,分布广泛,而对其爆发性生长的研究将有助于探究由其引发的赤潮的分子机制。本研究通过模拟赤潮爆发的条件对链状亚历山大藻进行表达谱测序,利用表达谱测序后得到的基因表达量数据,采用加权基因共表达网络(WGCNA)构建方法探究链状亚历山大藻的爆发性生长的分子机制。通过计算基因间表达量的相关性得到了35个基因共表达模块,将基因共表达模块与链状亚历山大藻爆发性生长性状相关联,在爆发性生长阶段,有6个显著性相关的模块,基于KEGG及GO功能富集分析,这些模块涉及蛋白质的加工合成、核糖体的合成,电子传递,碳水化合物代谢等过程,表明了细胞代谢能力的提升,为细胞增殖提供了物质基础。此外有大量的未知功能的枢纽基因被发现,基因模块可以用于推测这些基因的功能,从而为以后挖掘新基因,探究潜在的调控机制提供了基础。
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| 关 键 词： | 链状亚历山大藻 赤潮 WGCNA 基因共表达模块 枢纽基因 |
Elucidation of Molecular Mechanisms of Explosive Growth of Alexandrium pacificum Based on WGCNA Analysis |
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| Institution: | (Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding,Ministry of Education,Ocean University of China,Qingdao 266003,China;Department of Microbiology,University of Veterinary and Animal Sciences,Lahore 54660,Pakistan) |
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| Abstract: | LIU Yuan;SUI Zheng-Hong;LIU Hao-Xin;Sadaf RIAZ(Key Laboratory of Marine Genetics and Breeding,Ministry of Education,Ocean University of China,Qingdao 266003,China;Department of Microbiology,University of Veterinary and Animal Sciences,Lahore 54660,Pakistan) |
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| Keywords: | Alexandrium pacificum HABs WGCNA gene module hub genes |
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