| 鳗草HSF基因家族的筛选与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 唐学玺,尚帅,臧宇,陈军,薛颂.鳗草HSF基因家族的筛选与生物信息学分析[J].中国海洋大学学报(自然科学版),2020,50(9). |
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| 作者姓名： | 唐学玺 尚帅 臧宇 陈军 薛颂 |
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| 作者单位： | 中国海洋大学海洋生命学院,山东青岛266003;中国海洋大学海洋生命学院,山东青岛266003;滨州学院黄河三角洲生态环境研究中心,山东滨州256600;自然资源部第一海洋研究,山东青岛266061 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;国家重点基础研究发展计划（973计划） |
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| 摘 要： | 鳗草(Zostera marina)作为适应在海洋环境中生长和繁殖的多年生被子植物,是研究海洋高等植物分子进化的理想物种。热激转录因子(HSF)在植物细胞的修复、蛋白的转录修饰以及信号转导中具有重要的作用。为全面了解鳗草基因组中HSF基因家族信息,本文采用生物信息学手段,在鳗草基因组中鉴定了11个ZmHSFs基因,基因长度差异较大,但均不含有内含子。系统发育结果显示11个基因分为HSFA和HSFB两大分支。顺式作用元件分析表明ZmHSFs基因很可能同时受到温度和光照等多种非生物因素的调节。此外,鳗草HSF基因家族数目明显小于其他高等植物,二次入海过程可能导致部分ZmHSFs基因丢失。转录组数据表明HSF基因在3种不同器官中均有表达,且存在一定的器官表达差异。
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| 关 键 词： | 鳗草 全基因组 热激转录因子 基因家族 生物信息学 |
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