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龙须菜RSAP分析及其SCAR标记的转化
引用本文:王津果,隋正红,周伟,马金华,张淑,常连鹏.龙须菜RSAP分析及其SCAR标记的转化[J].中国海洋大学学报(自然科学版),2014,44(4):47-53.
作者姓名:王津果  隋正红  周伟  马金华  张淑  常连鹏
作者单位:中国海洋大学海洋生物遗传学与育种教育部重点实验室,山东青岛,266003
基金项目:“十二五”农村领域国家科技计划项目,农业部公益性项目
摘    要:初步探讨限制性位点扩增多态性(Restriction site amplified polymorphism,RSAP)分子标记技术在龙须菜遗传多样性检测和种质鉴定上的应用。利用所优化的适合于龙须菜RSAP分析的PCR反应体系,对青岛湛山湾野生群体和栽培品系981、07-2进行遗传多样性分析和比较。试验采用15对引物组合在3个群体14个龙须菜个体中共扩增出669个位点,其中多态位点数为146个,多态性比例22%,平均每对引物产生10条多态性条带,片段大小在100~1 000 bp之间。湛山湾野生群体的Na(1.007 5)、Ne(1.007 1)、H(0.003 6)、I(0.005 1)与栽培品系981的Na(1.003 0)、Ne(1.002 1)、H(0.001 2)、I(0.001 8),以及栽培品系07-2的Na(1.009 0)、Ne(1.006 3)、H(0.003 7)、I(0.005 4)相比较可知3个群体的遗传多样性是有差异的。种群间的遗传多样性分析表明,在所有检测的样品中,遗传多样性多来自不同群体间的多样性。群体遗传结构分析表明,2个栽培品系981、07-2间遗传距离不大,但栽培品系与湛山湾野生群体间的遗传距离相对较大,而UPGMA聚类分析也明显的将湛山湾野生群体与栽培品系981、07-2区分开来,表明野生群体与栽培品系间已产生一定的遗传隔离。通过分析湛山湾野生群体及栽培品系981、07-2的RSAP指纹图谱,从中筛选栽培品系981的特异条带,并将其转化为稳定性好、特异性高的序列特征化扩增区(Sequence characterized amplified regions,SCAR)分子标记。

关 键 词:龙须菜  RSAP  遗传多样性  栽培品系  SCAR

RSAP Analysis on Gracilariopsis lemaneiformis and Conversion of SCAR Marker
WANG Jin-Guo , SUI Zheng-Hong , ZHOU Wei , MA Jin-Hua , ZHANG Shu , CHANG Lian-Peng.RSAP Analysis on Gracilariopsis lemaneiformis and Conversion of SCAR Marker[J].Periodical of Ocean University of China,2014,44(4):47-53.
Authors:WANG Jin-Guo  SUI Zheng-Hong  ZHOU Wei  MA Jin-Hua  ZHANG Shu  CHANG Lian-Peng
Abstract:
Keywords:Gracilariopsis lemaneiformis  RSAP  genetic diversity  981 cultivar  SCAR
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