| 应用DGGE技术分析扇贝养殖海区真核浮游生物种群多样性 |
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| 引用本文： | 王娜,蔡玉勇,李赟,王崇明,崔红.应用DGGE技术分析扇贝养殖海区真核浮游生物种群多样性[J].中国海洋大学学报(自然科学版),2010,40(12). |
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| 作者姓名： | 王娜 蔡玉勇 李赟 王崇明 崔红 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划项目，现代农业产业技术体系建设专项 |
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| 摘 要： | 为分析扇贝养殖海区真核浮游生物种类和丰度,本研究首先以实验室培养的9种饵料微藻总DNA为模板PCR扩增18S rDNA V1～V3区的高变区序列.筛选用于DGGE分析该扩增序列的变性剂浓度,结果表明,扩增序列长560 bp,DGGE分析町将不同藻种分离开.随后对青岛沙子口扇贝养殖海区9个月份真核浮游生物多样性进行了DGGE分析,结果从9个月份2 m深的海水中总共扩增出38条谱带.其中共有谱带3条,占总数的7.69%,不同月份的特征性谱带11个,占总谱带数的28.2%.不同月份水样中的谱带数显著不同,香农多样性指数为0.4632.相似性分析表明,2009年3和4月养殖海区真核微牛物种类相似性最高,为89.7%.基于不同月份水样微生物种类多样性进行UPGMA聚类分析,结果表明,2008年5,6,8月和2009年1,2,3,4月分别聚为一支,显示取样时间相近的月份微生物种类相似度最高.
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| 关 键 词： | PCR-DGGE 18S rDNA序列 真核浮游生物多样性 |
Diversity of Eukaryotic Plankton Assemblages at Culture Area for Scallop by Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE) |
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| WANG Na,CAI Yu-Yong,LI Yun,WANG Chong-Ming,CUI Hong.Diversity of Eukaryotic Plankton Assemblages at Culture Area for Scallop by Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE)[J].Periodical of Ocean University of China,2010,40(12). |
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| Authors: | WANG Na CAI Yu-Yong LI Yun WANG Chong-Ming CUI Hong |
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