| 南极红藻Iridaea cordata和Curdiea racovitzae转录组分析及其极端光环境适应相关基因的挖掘 |
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| 引用本文： | 刘晨临,王秀良,林学政.南极红藻Iridaea cordata和Curdiea racovitzae转录组分析及其极端光环境适应相关基因的挖掘[J].海洋学报,2020,42(10):110-120. |
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| 作者姓名： | 刘晨临 王秀良 林学政 |
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| 作者单位： | 1.自然资源部第一海洋研究所，山东 青岛 266061 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金（41276203）；国家南极观测监测网运维与管理项目（JDKC0518013）。 |
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| 摘 要： | 南极红藻具有重要的生态学功能和开发利用价值。南极极端环境赋予了其独特的生理耐受机制，也是发现新基因和代谢途径的理想材料。我们测序分析了南极产胶红藻Iridaea cordata (Turner) Bory和Curdiea racovitzae Hariot的转录组序列，并与其常温近缘种进行了比较，同时挖掘了其与光限制和强紫外线辐射等光环境适应相关的基因。I. cordata和C. racovitzae的转录组序列分别拼接成了14055条和12006条非冗余基因，平均长度分别为1473 bp和1448 bp。在I. cordata转录组中发现多条与绿藻基因同源的捕光复合物LHC基因Lhca2、Lhca6和Lhcb，并且在两种南极红藻中都各发现了1条编码结合岩藻黄质和Chl a/c蛋白的Lhcf基因，目前尚未在其他红藻中发现这类基因。光裂解酶修复紫外线诱导DNA损伤，在I. cordata的转录组序列中发现了6?4光裂解酶，光裂解酶CPD I和CPD II基因，而C. racovitzae转录组序列中仅找到了光裂解酶CPD II基因。尽管南极红藻中这些特有基因的功能有待进一步的验证，但是本文为后续研究红藻的南极极端光环境适应机制提供了方向。
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| 关 键 词： | 南极红藻 转录组 极端光环境适应 Iridaea cordata Curdiea racovitzae |
| 收稿时间： | 2019/7/2 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2019/11/18 0:00:00 |
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