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基于线粒体细胞色素b的秋刀鱼种群遗传结构的研究
引用本文:赵丽丽,朱清澄,花传祥.基于线粒体细胞色素b的秋刀鱼种群遗传结构的研究[J].海洋通报,2019,38(3).
作者姓名:赵丽丽  朱清澄  花传祥
作者单位:上海海洋大学 海洋科学学院,上海,201306;上海海洋大学 海洋科学学院,上海 201306;上海海洋大学 国家远洋渔业工程技术研究中心,上海 201306;上海海洋大学 大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室,上海 201306
基金项目:国家科技支撑计划 (2013BAD13B05)
摘    要:秋刀鱼主要分布在西北太平洋亚热带到温带水域中,是一种资源量较高的上层洄游性鱼类。为了对秋刀鱼的遗传结构进行研究,2016年6月-11月,在38°38′-44°31′N,146°36′-162°26′E海域随机取145条秋刀鱼,取其肌肉与DNA、PCR以及测序后获得421 bp基于线粒体细胞色素b (Cytb)基因的DNA序列。分析结果显示,145条序列中共发现了15个单倍型,单倍型多样性指数h=0.258±0.049,核苷酸多样性π=0.000 87±0.007 56。计算得出Tajima′s D与Fu′s Fs均呈负值并且绘制的核苷酸不配对曲线呈现单峰,可得出秋刀鱼群体经历了种群扩张。Nm值表明4个采样点的秋刀鱼群体之间存在频繁的基因交流,AMOVA分析结果显示97.22%的遗传变异来自群体内,结合遗传分化系数Fst得出群体遗传分化水平较低。单倍型网络图呈现星状拓扑结构、系统发育树分枝不明显均显示地域性差异不显著。研究发现秋刀鱼群体遗传多样性较低,需对其进行合理保护。

关 键 词:秋刀鱼  细胞色素b基因  遗传结构  遗传多样性
收稿时间:2018/8/23 0:00:00
修稿时间:2018/11/27 0:00:00

Genetic structure of saury population based on mitochondrial cytochrome b sequence analysis
ZHAO Li-li,ZHU Qing-cheng and HUA Chuan-xiang.Genetic structure of saury population based on mitochondrial cytochrome b sequence analysis[J].Marine Science Bulletin,2019,38(3).
Authors:ZHAO Li-li  ZHU Qing-cheng and HUA Chuan-xiang
Institution:College of Marine Sciences, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China,College of Marine Sciences, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China; National Engineering Research Center for Pelagic Fishery, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China; Key Laboratory of Sustainable Exploitation of Oceanic Fisheries Resources, Ministry of Education, Shanghai Ocean University, Shanghai 201306, China and Key Laboratory of the Pearl River Estuarine Dynamics and Associated Process Regulation, Ministry of the Water Resources, Pearl River Hydraulic Research Institute, Pearl River Water Resources Commission, Guangzhou 510611, China; State Key Laboratory of HydrologyWater Resources and Hydraulic Engineering, Hohai University, Nanjing 210098, China
Abstract:
Keywords:Cololabis saira  cytochrome b gene  genetic structure  genetic diversity
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