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耐高温酸性α-淀粉酶基因部分序列的克隆与分析
引用本文:王淑军,邓祥元,李富超,秦 松,陆兆新.耐高温酸性α-淀粉酶基因部分序列的克隆与分析[J].海洋科学,2007,31(12):69-75.
作者姓名:王淑军  邓祥元  李富超  秦 松  陆兆新
作者单位:1. 南京农业大学,食品科技学院,江苏,南京,210095;淮海工学院,江苏省海洋生物技术重点建设实验室,江苏,连云港,222005
2. 中国科学院,海洋研究所,山东,青岛,266071
3. 南京农业大学,食品科技学院,江苏,南京,210095
基金项目:中国科学院知识创新工程项目 , 江苏省六大人才高峰第三批资助项目 , 江苏省教育厅自然科学基金
摘    要:利用已报道的α-淀粉酶基因序列的保守区域设计引物,通过聚合酶链式反应(PCR)获得了高温球菌Thermococcus sp. HJ21的耐高温酸性α-淀粉酶基因的部分序列。通过对该序列的同源性比较分析发现,高温球菌Thermococcus sp. HJ21与热水高温球菌Thermococcus hydrothermalis和Thermococcus sp. OGL-20P的亲缘关系最近,序列相似度达到95%以上;利用Swiss Model预测该基因产物的3级结构,显示其具有典型的(β/α)8桶状结构;通过分析密码子的使用情况得知,该α-淀粉酶存在着密码子的兼并性和使用的偏向性问题。

关 键 词:高温球菌  α-淀粉酶  基因克隆  序列分析
文章编号:1000-3096(2007)12-0069-07
收稿时间:2007-07-24
修稿时间:2007-10-10

Cloning and sequence analysis of partial thermostable acid α-amylase gene
WANG Shu-jun,DENG Xiang-yuan,LI Fu-chao,QIN Song,Lu Zhao-xin.Cloning and sequence analysis of partial thermostable acid α-amylase gene[J].Marine Sciences,2007,31(12):69-75.
Authors:WANG Shu-jun  DENG Xiang-yuan  LI Fu-chao  QIN Song  Lu Zhao-xin
Abstract:
Keywords:
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